Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167WA66

Protein Details
Accession A0A167WA66    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-151AEDGTRKPKEGRRDKKRRPGGAGGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-147RGLKSAKRKRTAGAEDGTRKPKEGRRDKKRRPGG
182-198KRARRARAAEGAARSRR
216-218RKR
229-237RNPNKRRRK
480-488KAKVRNKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDAASDAGSPLRTPEPVTSEHAPSTPKAASSPVANDKEDGEDDDHAASGEGNKDDGDDGGDDAADAAGAGGGNESDDSEELLSDVDEDQFEDYDPATAHIEERPITIDEEAARGLKSAKRKRTAGAEDGTRKPKEGRRDKKRRPGGAGGENGEDATGAGGGSDDDDKAGAEGDAAAASSSKRARRARAAEGAARSRRASAEPQVNEEDLTPEERRKRALNRAIDLAIRNPNKRRRKQDEEDLEKAADEEIAQLKIRMEQACMADIDARAEGRPAVNKLQLLPQVLSVLHRNDIQETVLDPETNFLQSVKFFLEPLNDGSLPSYTIQRDIFTCLTTLPIEKDALLSSGIGKVVLFYTRSKRAEPAIKRMAERLVGEWSRPILKKTDDFKKRHVETRDYDARTAKLDSSQYTLTERPLSRFALDKERQLAPPVVNPNRAQPVGLPQSYTIAPKSTFEGHRGADFRPIGASSVEAFRRMTQKAKVRNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.23
4 0.26
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.36
9 0.36
10 0.34
11 0.3
12 0.32
13 0.28
14 0.24
15 0.22
16 0.23
17 0.22
18 0.24
19 0.31
20 0.35
21 0.37
22 0.37
23 0.37
24 0.35
25 0.37
26 0.34
27 0.29
28 0.22
29 0.19
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.05
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.1
102 0.13
103 0.14
104 0.24
105 0.32
106 0.41
107 0.47
108 0.5
109 0.54
110 0.61
111 0.64
112 0.6
113 0.56
114 0.55
115 0.55
116 0.59
117 0.61
118 0.52
119 0.47
120 0.46
121 0.46
122 0.49
123 0.53
124 0.58
125 0.63
126 0.74
127 0.82
128 0.88
129 0.92
130 0.89
131 0.85
132 0.82
133 0.79
134 0.75
135 0.69
136 0.6
137 0.51
138 0.43
139 0.36
140 0.27
141 0.18
142 0.11
143 0.06
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.07
167 0.11
168 0.13
169 0.22
170 0.26
171 0.31
172 0.4
173 0.45
174 0.49
175 0.53
176 0.54
177 0.5
178 0.5
179 0.52
180 0.45
181 0.41
182 0.34
183 0.28
184 0.25
185 0.24
186 0.23
187 0.23
188 0.29
189 0.28
190 0.31
191 0.32
192 0.31
193 0.29
194 0.25
195 0.2
196 0.12
197 0.15
198 0.12
199 0.15
200 0.19
201 0.2
202 0.22
203 0.26
204 0.31
205 0.38
206 0.45
207 0.47
208 0.45
209 0.47
210 0.46
211 0.42
212 0.37
213 0.3
214 0.29
215 0.26
216 0.28
217 0.32
218 0.41
219 0.49
220 0.57
221 0.64
222 0.66
223 0.72
224 0.75
225 0.78
226 0.79
227 0.77
228 0.72
229 0.63
230 0.53
231 0.43
232 0.37
233 0.26
234 0.16
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.1
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.09
261 0.1
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.2
267 0.21
268 0.21
269 0.19
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.14
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.17
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.14
311 0.1
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.18
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.14
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.18
344 0.26
345 0.29
346 0.3
347 0.32
348 0.38
349 0.46
350 0.48
351 0.51
352 0.52
353 0.53
354 0.53
355 0.52
356 0.48
357 0.41
358 0.37
359 0.29
360 0.28
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.23
365 0.27
366 0.27
367 0.27
368 0.23
369 0.27
370 0.35
371 0.41
372 0.5
373 0.53
374 0.56
375 0.63
376 0.68
377 0.69
378 0.7
379 0.69
380 0.66
381 0.61
382 0.66
383 0.68
384 0.6
385 0.58
386 0.53
387 0.48
388 0.42
389 0.39
390 0.31
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.25
397 0.26
398 0.27
399 0.25
400 0.3
401 0.29
402 0.29
403 0.31
404 0.32
405 0.3
406 0.34
407 0.35
408 0.38
409 0.39
410 0.41
411 0.42
412 0.44
413 0.44
414 0.42
415 0.43
416 0.34
417 0.38
418 0.43
419 0.43
420 0.45
421 0.44
422 0.47
423 0.5
424 0.48
425 0.41
426 0.33
427 0.37
428 0.4
429 0.39
430 0.34
431 0.28
432 0.31
433 0.31
434 0.32
435 0.24
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.24
440 0.28
441 0.3
442 0.31
443 0.34
444 0.32
445 0.37
446 0.38
447 0.35
448 0.36
449 0.34
450 0.31
451 0.28
452 0.27
453 0.22
454 0.2
455 0.2
456 0.14
457 0.2
458 0.21
459 0.21
460 0.21
461 0.25
462 0.3
463 0.32
464 0.36
465 0.39
466 0.47
467 0.56
468 0.66