Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JDL8

Protein Details
Accession J5JDL8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-364REEKLEKRLKAAKEERRRRALGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-146PPRRS
216-233GAARKPAAAAEPEKKIKK
345-364KLEKRLKAAKEERRRRALGG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MPIGDLLASISGGADKTSTTVRPNSAANIKRKASAELSSNLNKAPRVTPPAPAPVPKPTQASSAAQRYAGTAADRPSRPTPSKPRPAPPASSSSSANAAAAAAPAKAAPKKGSFAEILARGKAAQASMGQVGKIQHKKVENPPRRSKEDAAASGPLTAAARGKKPVAAPGYGGTSRPSQRPAGSGISNGGSSGARRPGAGSSSSLSRQRPPTSSSGAARKPAAAAEPEKKIKKAATATTGYAGTARPKLSTSDSKKRHHDVPRGGALLSAPKVRPRGGSKYDDEFDEDMDDFIDYDEEEEDEGGEPRYGYASDASSDMEAGMDDIYDEEDRAARIARLEDVREEKLEKRLKAAKEERRRRALGGYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.08
4 0.11
5 0.14
6 0.18
7 0.23
8 0.25
9 0.28
10 0.3
11 0.35
12 0.41
13 0.46
14 0.49
15 0.53
16 0.52
17 0.54
18 0.54
19 0.52
20 0.47
21 0.43
22 0.41
23 0.36
24 0.41
25 0.4
26 0.4
27 0.37
28 0.35
29 0.32
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.34
34 0.34
35 0.37
36 0.39
37 0.47
38 0.47
39 0.47
40 0.44
41 0.43
42 0.46
43 0.44
44 0.44
45 0.37
46 0.38
47 0.38
48 0.4
49 0.39
50 0.41
51 0.39
52 0.35
53 0.34
54 0.31
55 0.28
56 0.25
57 0.19
58 0.15
59 0.18
60 0.25
61 0.25
62 0.29
63 0.33
64 0.39
65 0.41
66 0.48
67 0.55
68 0.58
69 0.68
70 0.69
71 0.73
72 0.75
73 0.76
74 0.73
75 0.66
76 0.62
77 0.55
78 0.51
79 0.44
80 0.37
81 0.34
82 0.28
83 0.24
84 0.17
85 0.13
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.08
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.19
98 0.2
99 0.23
100 0.2
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.25
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.13
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.14
119 0.21
120 0.25
121 0.24
122 0.26
123 0.29
124 0.35
125 0.43
126 0.52
127 0.54
128 0.59
129 0.69
130 0.71
131 0.74
132 0.73
133 0.65
134 0.61
135 0.58
136 0.51
137 0.43
138 0.37
139 0.32
140 0.27
141 0.24
142 0.18
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.2
153 0.19
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.2
158 0.18
159 0.18
160 0.14
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.2
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.22
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.1
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.13
190 0.16
191 0.19
192 0.19
193 0.22
194 0.27
195 0.29
196 0.3
197 0.31
198 0.33
199 0.34
200 0.36
201 0.35
202 0.37
203 0.36
204 0.36
205 0.33
206 0.29
207 0.25
208 0.22
209 0.19
210 0.15
211 0.17
212 0.18
213 0.24
214 0.3
215 0.31
216 0.31
217 0.32
218 0.3
219 0.32
220 0.34
221 0.32
222 0.32
223 0.33
224 0.33
225 0.32
226 0.31
227 0.25
228 0.2
229 0.17
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.16
236 0.21
237 0.3
238 0.36
239 0.44
240 0.52
241 0.58
242 0.64
243 0.67
244 0.7
245 0.69
246 0.7
247 0.68
248 0.68
249 0.67
250 0.61
251 0.56
252 0.47
253 0.38
254 0.33
255 0.26
256 0.22
257 0.17
258 0.19
259 0.22
260 0.23
261 0.29
262 0.31
263 0.38
264 0.41
265 0.47
266 0.47
267 0.51
268 0.51
269 0.46
270 0.44
271 0.35
272 0.29
273 0.25
274 0.21
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.12
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.19
324 0.22
325 0.23
326 0.29
327 0.32
328 0.35
329 0.35
330 0.37
331 0.35
332 0.41
333 0.47
334 0.41
335 0.44
336 0.5
337 0.51
338 0.59
339 0.66
340 0.67
341 0.71
342 0.8
343 0.82
344 0.83
345 0.82
346 0.74