Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4KQE0

Protein Details
Accession J4KQE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-427TSPEAPKVLMRKKKPVNVFMKRPVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-427RKKKPVNVFMKRPVRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.5, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLYEMATAVAVKNIESIVSIGYLSYASVRHILLKVDNARQLRQIELNCPQLHGETGELWLRLIEKDFPLEFKAKAYMPKSQDKWFKVWEKYKVDHDRSIRESEEQLRAALMGLRQDKEKNTSKIVEGRFLPSDAIRPKKRNGPKDHTTGVLTFGGGSRTKTLTGAGVMRKARREAREVRNIQGALSRSVVAPIRLLEKQHLKAPPPAMVRERRIAAQPAFRTPETEEREQRLQELEKKRAAALEEHSQRAAYITDSEEDSDMDQEPTYKPPKQRVTPVSATLAGPSSASTPGKPTVPGRKVIGSRGSMFQRKFGAGKSVKSPTKPVRVTTTTTTTTTASRDMSPTAKKRTTSSAKLDEPAAGPSKRPATEPAQVSPNRVLPRQPSPPEDTARSMSLKTSPEAPKVLMRKKKPVNVFMKRPVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.07
17 0.08
18 0.11
19 0.12
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.28
25 0.32
26 0.36
27 0.42
28 0.41
29 0.41
30 0.44
31 0.43
32 0.39
33 0.4
34 0.36
35 0.37
36 0.4
37 0.46
38 0.41
39 0.4
40 0.37
41 0.32
42 0.3
43 0.25
44 0.2
45 0.12
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.24
64 0.22
65 0.28
66 0.29
67 0.34
68 0.37
69 0.46
70 0.48
71 0.53
72 0.59
73 0.56
74 0.59
75 0.59
76 0.61
77 0.62
78 0.66
79 0.66
80 0.65
81 0.65
82 0.7
83 0.72
84 0.69
85 0.67
86 0.63
87 0.62
88 0.58
89 0.59
90 0.5
91 0.42
92 0.4
93 0.38
94 0.39
95 0.32
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.29
109 0.37
110 0.35
111 0.36
112 0.38
113 0.39
114 0.44
115 0.43
116 0.41
117 0.34
118 0.34
119 0.31
120 0.29
121 0.26
122 0.19
123 0.24
124 0.25
125 0.33
126 0.36
127 0.39
128 0.42
129 0.51
130 0.6
131 0.63
132 0.67
133 0.67
134 0.67
135 0.7
136 0.68
137 0.6
138 0.53
139 0.43
140 0.36
141 0.27
142 0.2
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.12
155 0.15
156 0.14
157 0.19
158 0.21
159 0.23
160 0.25
161 0.28
162 0.32
163 0.3
164 0.36
165 0.4
166 0.46
167 0.54
168 0.54
169 0.53
170 0.52
171 0.49
172 0.43
173 0.37
174 0.3
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.2
189 0.21
190 0.26
191 0.27
192 0.27
193 0.3
194 0.31
195 0.33
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.33
200 0.34
201 0.32
202 0.32
203 0.27
204 0.27
205 0.29
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.25
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.24
214 0.31
215 0.3
216 0.34
217 0.34
218 0.35
219 0.38
220 0.36
221 0.35
222 0.29
223 0.27
224 0.3
225 0.34
226 0.35
227 0.34
228 0.35
229 0.34
230 0.32
231 0.3
232 0.25
233 0.22
234 0.26
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.22
241 0.18
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.14
258 0.18
259 0.22
260 0.25
261 0.34
262 0.43
263 0.46
264 0.55
265 0.56
266 0.59
267 0.58
268 0.57
269 0.51
270 0.44
271 0.39
272 0.3
273 0.25
274 0.17
275 0.13
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.15
283 0.16
284 0.18
285 0.22
286 0.29
287 0.32
288 0.35
289 0.35
290 0.4
291 0.4
292 0.43
293 0.43
294 0.36
295 0.35
296 0.36
297 0.4
298 0.4
299 0.39
300 0.38
301 0.34
302 0.33
303 0.33
304 0.29
305 0.33
306 0.3
307 0.32
308 0.35
309 0.41
310 0.42
311 0.43
312 0.5
313 0.48
314 0.55
315 0.55
316 0.52
317 0.52
318 0.53
319 0.55
320 0.52
321 0.5
322 0.43
323 0.41
324 0.39
325 0.32
326 0.3
327 0.27
328 0.24
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.25
334 0.32
335 0.37
336 0.43
337 0.46
338 0.46
339 0.48
340 0.55
341 0.58
342 0.58
343 0.59
344 0.59
345 0.58
346 0.58
347 0.56
348 0.48
349 0.4
350 0.37
351 0.34
352 0.26
353 0.23
354 0.27
355 0.32
356 0.3
357 0.31
358 0.32
359 0.33
360 0.4
361 0.43
362 0.42
363 0.44
364 0.44
365 0.47
366 0.46
367 0.46
368 0.42
369 0.4
370 0.41
371 0.38
372 0.45
373 0.51
374 0.53
375 0.52
376 0.55
377 0.6
378 0.61
379 0.6
380 0.56
381 0.5
382 0.48
383 0.44
384 0.37
385 0.33
386 0.33
387 0.31
388 0.28
389 0.33
390 0.34
391 0.37
392 0.39
393 0.39
394 0.41
395 0.49
396 0.57
397 0.58
398 0.6
399 0.66
400 0.72
401 0.79
402 0.8
403 0.81
404 0.82
405 0.82
406 0.85
407 0.85