FuNGI

A0A168A9B3

Protein Details

Accession

A0A168A9B3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-59	SHPKAPQPLRKVPPHLLRRKQRTADPLVARKKPQQRPPAAPGAS	Hydrophilic
224-244	AKDSNPKKPAQNQKKEKQFQL	Hydrophilic
558-578	TESSRKKMKKHATGSVRPSRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-49	RKVPPHLLRRKQRTADPLVARKKPQ
540-546	KSKSLKR
562-575	RKKMKKHATGSVRP

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDPAASGQSGQINGTSHPKAPQPLRKVPPHLLRRKQRTADPLVARKKPQQRPPAAPGASVLSSANRSGVVSLSLPPEARPLKVFNGEDEAKRLAAFDGQRKLNGGWTDPPPASGSGYRDFPVVTTKRALREGIRYHVMRFAKAGKGGDDEREIDPTNQDDFTRPVSLHRRDPRQPAPGRAVKEEAPPPPTPPTADDKEAEKVAQQKADREAQRAIDMAQIAPVAKDSNPKKPAQNQKKEKQFQLYFPKNTAEQRKETEIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGTYVSALSEANVALVISGSAFRMVPLEKFYRFTPKPPFQAYSIEKAEEIMGKKMSVGRWAMRDTEKKKFEEELEETRKTIGGRARVKLESSTFRSAPRSEKIDHDDIDMEGDEFQDDDENVGLEPENDEDSKDSRERLRRNHLGANLFGNADEQEVDKEEQENKAARKTGQLGKQLRKALAKREDHLEYLEYVDSDTNSEKEDFLELSSDDEDNDEPDNEKKDDETKSKSDAKEKPPTSTNTPKTNTTPSGKQKATDALKKSKSLKRPGSPNLSESSETESSRKKMKKHATGSVRPSRSTTPLPGQPKTKGPKGGALSDGEATGGEMSDGPAGGKRRIKIVGSGAKGTPSGSRATSPAPAASSQGQLSPGSNPGSPVRAGSPNSRATSPTGGNAMVDAAEIVSTLLQIPEGITVGALLRRFGNRIGDGPNQMKRKDWIKLVKENSVFGEDKLLRARVPGSSSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.25
3	0.24
4	0.27
5	0.31
6	0.37
7	0.46
8	0.53
9	0.55
10	0.63
11	0.69
12	0.74
13	0.77
14	0.78
15	0.79
16	0.8
17	0.82
18	0.82
19	0.85
20	0.86
21	0.89
22	0.86
23	0.83
24	0.82
25	0.79
26	0.78
27	0.77
28	0.77
29	0.76
30	0.76
31	0.73
32	0.73
33	0.76
34	0.75
35	0.76
36	0.77
37	0.77
38	0.79
39	0.81
40	0.82
41	0.73
42	0.64
43	0.55
44	0.49
45	0.4
46	0.32
47	0.25
48	0.17
49	0.17
50	0.17
51	0.16
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.11
58	0.13
59	0.15
60	0.16
61	0.17
62	0.16
63	0.23
64	0.23
65	0.24
66	0.24
67	0.26
68	0.29
69	0.37
70	0.37
71	0.32
72	0.38
73	0.39
74	0.37
75	0.37
76	0.33
77	0.26
78	0.25
79	0.23
80	0.16
81	0.19
82	0.22
83	0.26
84	0.32
85	0.34
86	0.35
87	0.37
88	0.37
89	0.37
90	0.34
91	0.3
92	0.28
93	0.29
94	0.34
95	0.31
96	0.32
97	0.28
98	0.27
99	0.27
100	0.24
101	0.25
102	0.23
103	0.25
104	0.25
105	0.23
106	0.22
107	0.2
108	0.26
109	0.24
110	0.23
111	0.27
112	0.3
113	0.34
114	0.37
115	0.39
116	0.33
117	0.4
118	0.43
119	0.43
120	0.47
121	0.44
122	0.42
123	0.47
124	0.44
125	0.35
126	0.33
127	0.31
128	0.28
129	0.3
130	0.3
131	0.25
132	0.28
133	0.29
134	0.29
135	0.27
136	0.26
137	0.23
138	0.25
139	0.25
140	0.21
141	0.21
142	0.21
143	0.2
144	0.18
145	0.18
146	0.17
147	0.18
148	0.2
149	0.21
150	0.19
151	0.24
152	0.32
153	0.37
154	0.44
155	0.51
156	0.56
157	0.6
158	0.69
159	0.7
160	0.7
161	0.71
162	0.67
163	0.67
164	0.65
165	0.61
166	0.55
167	0.51
168	0.43
169	0.44
170	0.43
171	0.37
172	0.36
173	0.34
174	0.34
175	0.35
176	0.34
177	0.29
178	0.27
179	0.31
180	0.31
181	0.33
182	0.31
183	0.3
184	0.32
185	0.31
186	0.28
187	0.23
188	0.25
189	0.25
190	0.29
191	0.27
192	0.28
193	0.31
194	0.4
195	0.39
196	0.36
197	0.36
198	0.33
199	0.33
200	0.29
201	0.25
202	0.19
203	0.18
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.07
211	0.07
212	0.16
213	0.18
214	0.28
215	0.32
216	0.35
217	0.41
218	0.49
219	0.59
220	0.63
221	0.7
222	0.71
223	0.76
224	0.84
225	0.84
226	0.8
227	0.78
228	0.7
229	0.68
230	0.69
231	0.68
232	0.6
233	0.56
234	0.53
235	0.46
236	0.49
237	0.5
238	0.43
239	0.39
240	0.4
241	0.46
242	0.47
243	0.45
244	0.46
245	0.39
246	0.35
247	0.34
248	0.31
249	0.25
250	0.24
251	0.25
252	0.18
253	0.16
254	0.15
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.13
260	0.13
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.09
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.1
292	0.14
293	0.14
294	0.16
295	0.17
296	0.26
297	0.26
298	0.31
299	0.37
300	0.41
301	0.45
302	0.47
303	0.48
304	0.4
305	0.48
306	0.45
307	0.41
308	0.36
309	0.31
310	0.27
311	0.26
312	0.24
313	0.19
314	0.18
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.12
319	0.14
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.15
324	0.18
325	0.19
326	0.22
327	0.24
328	0.32
329	0.33
330	0.39
331	0.42
332	0.4
333	0.4
334	0.4
335	0.36
336	0.35
337	0.35
338	0.35
339	0.37
340	0.36
341	0.35
342	0.32
343	0.32
344	0.26
345	0.25
346	0.2
347	0.22
348	0.26
349	0.28
350	0.31
351	0.3
352	0.31
353	0.29
354	0.28
355	0.25
356	0.26
357	0.27
358	0.24
359	0.25
360	0.27
361	0.28
362	0.29
363	0.28
364	0.26
365	0.24
366	0.27
367	0.31
368	0.32
369	0.3
370	0.27
371	0.24
372	0.2
373	0.19
374	0.15
375	0.1
376	0.07
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.19
401	0.27
402	0.32
403	0.39
404	0.47
405	0.51
406	0.54
407	0.57
408	0.56
409	0.5
410	0.45
411	0.4
412	0.31
413	0.24
414	0.2
415	0.15
416	0.11
417	0.08
418	0.08
419	0.06
420	0.05
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.1
425	0.11
426	0.12
427	0.15
428	0.18
429	0.18
430	0.21
431	0.23
432	0.21
433	0.23
434	0.29
435	0.32
436	0.35
437	0.43
438	0.46
439	0.5
440	0.56
441	0.56
442	0.53
443	0.53
444	0.49
445	0.49
446	0.51
447	0.48
448	0.44
449	0.46
450	0.45
451	0.39
452	0.38
453	0.29
454	0.21
455	0.19
456	0.17
457	0.11
458	0.1
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.08
464	0.09
465	0.1
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.1
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.1
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.11
484	0.15
485	0.14
486	0.15
487	0.15
488	0.19
489	0.24
490	0.28
491	0.32
492	0.32
493	0.37
494	0.44
495	0.46
496	0.49
497	0.52
498	0.55
499	0.59
500	0.58
501	0.56
502	0.55
503	0.57
504	0.57
505	0.59
506	0.57
507	0.56
508	0.57
509	0.56
510	0.55
511	0.56
512	0.54
513	0.49
514	0.51
515	0.51
516	0.57
517	0.53
518	0.5
519	0.47
520	0.5
521	0.51
522	0.5
523	0.48
524	0.48
525	0.51
526	0.56
527	0.62
528	0.61
529	0.62
530	0.65
531	0.68
532	0.67
533	0.72
534	0.75
535	0.76
536	0.71
537	0.65
538	0.59
539	0.52
540	0.46
541	0.37
542	0.36
543	0.29
544	0.27
545	0.28
546	0.29
547	0.29
548	0.37
549	0.41
550	0.38
551	0.46
552	0.55
553	0.62
554	0.65
555	0.72
556	0.73
557	0.77
558	0.81
559	0.81
560	0.74
561	0.64
562	0.6
563	0.54
564	0.5
565	0.45
566	0.41
567	0.38
568	0.43
569	0.49
570	0.5
571	0.51
572	0.5
573	0.55
574	0.56
575	0.55
576	0.54
577	0.49
578	0.52
579	0.51
580	0.51
581	0.45
582	0.4
583	0.35
584	0.29
585	0.27
586	0.19
587	0.15
588	0.11
589	0.09
590	0.06
591	0.05
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.09
598	0.12
599	0.18
600	0.22
601	0.23
602	0.27
603	0.31
604	0.32
605	0.34
606	0.4
607	0.43
608	0.42
609	0.44
610	0.4
611	0.37
612	0.36
613	0.32
614	0.25
615	0.18
616	0.18
617	0.16
618	0.17
619	0.18
620	0.2
621	0.23
622	0.22
623	0.22
624	0.21
625	0.2
626	0.22
627	0.22
628	0.22
629	0.19
630	0.19
631	0.19
632	0.18
633	0.18
634	0.17
635	0.19
636	0.19
637	0.18
638	0.19
639	0.2
640	0.22
641	0.21
642	0.21
643	0.22
644	0.25
645	0.28
646	0.31
647	0.36
648	0.4
649	0.43
650	0.42
651	0.39
652	0.37
653	0.41
654	0.36
655	0.32
656	0.28
657	0.25
658	0.24
659	0.22
660	0.18
661	0.12
662	0.1
663	0.07
664	0.05
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.1
682	0.1
683	0.1
684	0.13
685	0.15
686	0.17
687	0.2
688	0.25
689	0.25
690	0.28
691	0.33
692	0.35
693	0.4
694	0.45
695	0.51
696	0.5
697	0.49
698	0.49
699	0.5
700	0.52
701	0.52
702	0.55
703	0.57
704	0.59
705	0.68
706	0.7
707	0.73
708	0.68
709	0.63
710	0.57
711	0.52
712	0.45
713	0.35
714	0.39
715	0.3
716	0.32
717	0.35
718	0.33
719	0.27
720	0.29
721	0.3
722	0.25

A0A168A9B3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer