Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JSN3

Protein Details
Accession J5JSN3    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70SGEPPLKRRRAGKQGPSEEPQHydrophilic
162-184ASKRNAERRKPITKEERDRRLNVBasic
613-633IPAKWLPKIKRTRPRNESLDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-61LKRRRAG
164-175KRNAERRKPITK
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MVGRKRRSNATGRRGSSNAVAVAGRGASSIYREMLAEAGIEGSAPRDRISGEPPLKRRRAGKQGPSEEPQAGSDTVAAIQESSDDEDENVEFYDVPLPPAQVQTIERDSEDDSDEDEEDLVFQDVDLVAALEKGKDIASSVAEPRAQDLELNLTAQKAANAASKRNAERRKPITKEERDRRLNVHKMHLLCLLSHVARRNHWCNDEQVQDALRPHLSGKTIDYLTPGSHLSQFGQTESFKTGLKQAADMWRAKFEVTERGLRRARWAEDAAQLEQYQLPDHPETCTDRQDFGHAAKTLQGSRDVGAQLYCALLRGVGVKARLVCSLQPLAFGNGAPTLPRVAPAKTPAKTSITTQRAEEARSQVAQYKEMAAATAQTSSTRPTARRRLGHPSAASLNFEPKPSPSLTKPQKSFATPVRLRESAHPVYWVEVLDTGHQKWQPADPVVTHTFWKTKTLEPSITDRENCMSYVVAFDEDGTARDVTVRYAKAYTAKTRRIRVDGTDDNGWWRRAMRPFTRRRPTTLDQIENAELAGVESREPMPRNVQDFKDHPVFALQRHLRRHEVLVPTAMPSGTVSSGNKGPLEKIYRRRDVRIARTADKWFRMGRQVLPNEIPAKWLPKIKRTRPRNESLDDDARAEQDAQDAAGVPIYTEDQTELYTPDPVRNGRVPKNKFGNVEVYVPSMIPRGGRHIVHDLAAHAAKLVGVDYAPALTGFEFKGRQGTAVLKGIVVAEEYGPAIEAVLAGLENVEQEQEEERKRLVALKMWRRLLMGLRIRERIWSGVDEEERRAAEEEADRVLEEADAVEEGEEVAGQSDVTEEFDMVVDGDETEEYGGGFLVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.63
3 0.56
4 0.5
5 0.4
6 0.32
7 0.28
8 0.21
9 0.21
10 0.18
11 0.13
12 0.09
13 0.09
14 0.07
15 0.1
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.16
36 0.21
37 0.29
38 0.35
39 0.43
40 0.51
41 0.61
42 0.65
43 0.68
44 0.71
45 0.71
46 0.74
47 0.76
48 0.77
49 0.78
50 0.81
51 0.82
52 0.78
53 0.72
54 0.63
55 0.53
56 0.44
57 0.37
58 0.28
59 0.22
60 0.18
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.14
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.17
90 0.21
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.24
96 0.23
97 0.23
98 0.18
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.13
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.16
135 0.15
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.08
145 0.1
146 0.15
147 0.17
148 0.2
149 0.25
150 0.32
151 0.37
152 0.46
153 0.53
154 0.54
155 0.62
156 0.68
157 0.72
158 0.71
159 0.76
160 0.77
161 0.79
162 0.83
163 0.83
164 0.84
165 0.8
166 0.78
167 0.76
168 0.75
169 0.73
170 0.66
171 0.64
172 0.59
173 0.54
174 0.53
175 0.5
176 0.4
177 0.32
178 0.3
179 0.25
180 0.2
181 0.22
182 0.26
183 0.25
184 0.29
185 0.37
186 0.41
187 0.43
188 0.46
189 0.45
190 0.44
191 0.47
192 0.45
193 0.39
194 0.35
195 0.3
196 0.29
197 0.28
198 0.24
199 0.19
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.15
205 0.16
206 0.2
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.19
211 0.17
212 0.18
213 0.16
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.16
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.14
227 0.14
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.21
233 0.27
234 0.31
235 0.33
236 0.3
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.24
241 0.18
242 0.23
243 0.23
244 0.3
245 0.3
246 0.37
247 0.4
248 0.4
249 0.45
250 0.42
251 0.41
252 0.37
253 0.38
254 0.33
255 0.35
256 0.38
257 0.32
258 0.27
259 0.25
260 0.21
261 0.19
262 0.17
263 0.12
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.2
271 0.22
272 0.27
273 0.25
274 0.26
275 0.26
276 0.28
277 0.27
278 0.23
279 0.27
280 0.21
281 0.2
282 0.21
283 0.23
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.15
288 0.15
289 0.18
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.14
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.11
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.19
331 0.25
332 0.25
333 0.28
334 0.29
335 0.3
336 0.3
337 0.31
338 0.35
339 0.32
340 0.32
341 0.3
342 0.32
343 0.3
344 0.31
345 0.31
346 0.24
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.11
367 0.13
368 0.16
369 0.23
370 0.33
371 0.39
372 0.44
373 0.46
374 0.53
375 0.54
376 0.56
377 0.49
378 0.42
379 0.39
380 0.35
381 0.33
382 0.23
383 0.24
384 0.19
385 0.19
386 0.16
387 0.13
388 0.15
389 0.15
390 0.18
391 0.15
392 0.25
393 0.33
394 0.4
395 0.41
396 0.44
397 0.45
398 0.44
399 0.46
400 0.41
401 0.44
402 0.38
403 0.41
404 0.41
405 0.39
406 0.38
407 0.38
408 0.4
409 0.31
410 0.3
411 0.26
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.17
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.12
421 0.11
422 0.13
423 0.14
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.17
430 0.14
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.19
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.21
439 0.18
440 0.2
441 0.25
442 0.28
443 0.29
444 0.29
445 0.34
446 0.35
447 0.35
448 0.32
449 0.27
450 0.25
451 0.23
452 0.21
453 0.16
454 0.11
455 0.08
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.18
476 0.21
477 0.28
478 0.32
479 0.41
480 0.45
481 0.51
482 0.53
483 0.52
484 0.51
485 0.45
486 0.46
487 0.41
488 0.39
489 0.34
490 0.31
491 0.31
492 0.31
493 0.29
494 0.21
495 0.18
496 0.2
497 0.25
498 0.32
499 0.37
500 0.44
501 0.54
502 0.64
503 0.73
504 0.7
505 0.69
506 0.7
507 0.65
508 0.65
509 0.63
510 0.56
511 0.47
512 0.48
513 0.43
514 0.34
515 0.3
516 0.2
517 0.12
518 0.08
519 0.08
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.07
524 0.1
525 0.11
526 0.13
527 0.18
528 0.22
529 0.27
530 0.3
531 0.31
532 0.34
533 0.34
534 0.38
535 0.38
536 0.34
537 0.29
538 0.3
539 0.29
540 0.24
541 0.33
542 0.32
543 0.33
544 0.38
545 0.42
546 0.4
547 0.41
548 0.43
549 0.4
550 0.39
551 0.34
552 0.31
553 0.28
554 0.25
555 0.24
556 0.2
557 0.14
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.12
564 0.14
565 0.15
566 0.16
567 0.15
568 0.15
569 0.19
570 0.26
571 0.31
572 0.39
573 0.46
574 0.55
575 0.57
576 0.61
577 0.63
578 0.65
579 0.67
580 0.66
581 0.63
582 0.58
583 0.59
584 0.62
585 0.58
586 0.52
587 0.46
588 0.4
589 0.36
590 0.4
591 0.38
592 0.37
593 0.41
594 0.41
595 0.42
596 0.41
597 0.42
598 0.37
599 0.34
600 0.3
601 0.23
602 0.25
603 0.24
604 0.29
605 0.29
606 0.36
607 0.46
608 0.54
609 0.63
610 0.69
611 0.76
612 0.78
613 0.84
614 0.81
615 0.75
616 0.71
617 0.68
618 0.64
619 0.55
620 0.48
621 0.4
622 0.33
623 0.3
624 0.24
625 0.16
626 0.12
627 0.11
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.07
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.09
643 0.1
644 0.09
645 0.14
646 0.14
647 0.16
648 0.2
649 0.2
650 0.24
651 0.3
652 0.37
653 0.42
654 0.51
655 0.53
656 0.59
657 0.66
658 0.67
659 0.63
660 0.59
661 0.56
662 0.48
663 0.47
664 0.39
665 0.32
666 0.26
667 0.24
668 0.21
669 0.16
670 0.14
671 0.12
672 0.12
673 0.17
674 0.21
675 0.22
676 0.25
677 0.29
678 0.3
679 0.29
680 0.29
681 0.23
682 0.22
683 0.22
684 0.18
685 0.13
686 0.11
687 0.1
688 0.09
689 0.09
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.07
700 0.07
701 0.11
702 0.12
703 0.12
704 0.18
705 0.17
706 0.18
707 0.19
708 0.22
709 0.23
710 0.27
711 0.27
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.18
716 0.15
717 0.11
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.03
731 0.04
732 0.03
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.04
737 0.06
738 0.1
739 0.16
740 0.19
741 0.22
742 0.22
743 0.24
744 0.24
745 0.3
746 0.29
747 0.31
748 0.38
749 0.46
750 0.54
751 0.56
752 0.56
753 0.51
754 0.51
755 0.49
756 0.49
757 0.47
758 0.47
759 0.49
760 0.51
761 0.5
762 0.5
763 0.47
764 0.4
765 0.34
766 0.28
767 0.25
768 0.28
769 0.34
770 0.33
771 0.33
772 0.34
773 0.31
774 0.31
775 0.3
776 0.24
777 0.23
778 0.23
779 0.23
780 0.22
781 0.22
782 0.2
783 0.18
784 0.18
785 0.13
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.05
793 0.06
794 0.05
795 0.05
796 0.04
797 0.05
798 0.05
799 0.05
800 0.05
801 0.06
802 0.06
803 0.09
804 0.09
805 0.08
806 0.09
807 0.09
808 0.09
809 0.09
810 0.09
811 0.07
812 0.06
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.06