Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JA21

Protein Details
Accession A0A162JA21    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
646-673RYCRPRVVPVEKKQDRRKREHRGGETEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
660-664DRRKR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, extr 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFPFSYVCDLLQQVADLPLHRRNQKRIINELVRAWFDRHRAAVDGLLPRAGGSPLNKPAAASTTSATPETPVTPTAPATTINTTAAAALLAALLPDYRTDRVYGLQAASLQRIVVRAFGLGRSRLMELNRWTRPGLDGQAVDLADCIEKILEITPNPCHPVPVSVEEIDAALLAVAGRCRFSSPAVRAAAAASAATTGTTAPLLRDRTIGCLYQRLDARGAKWFTRLILKDYRPVVLDVTTVTRALHPGLPLALQVHSDFGAALQSLAGSGGGGSSSRGDGGNVGNGDGDGDGDESVDKPSVGPRQQTLTPRLGVKVGRQPWAKARSIQHCLALGGPRRMSCERKLDGEYVQVHVDLTRLGPDDNGNGRRSNCLQLFSKSGKDSTWDRINLHSAILASLRIGEPDCKIKTGCILEGEMLAYDEKEGKVLDFDAVRNHVTRSGSMLYCDTPSESRVYEHLMIVYYDVLLVDGQSLLGVRHADRFRRLEDLITCRPGYAELVPRQVIDFRSHTAAAELRQAFARCITARLEGLVLKPEDDPYFDLTGPTDAPPPRLEWPYMRSYAIKLKKEYIGAFGEVGDFAVVGARYDAAKAKEYPPDLPGLRWTHFYVGCLDTGAHSPAAASRPRFVVTNVVTLTVAQMTAFLRYCRPRVVPVEKKQDRRKREHRGGETEAGATIHTNGAQAGERAPFDLAPLEPGLDDGRSGPTDLFADPPVVDIRCFSFHRPGYGNFWCPRFPSVVKFHFDRTYRDVLTFADLQTMAEGESTRRSAAATADADDDDDNDDDEEHARWVAQLKGADPRGIAVDAETSQSSGRVTTSNASTTTRSQSSDEGGVLVTGPPPTKRTTTTVQLATTVEEKDEEVADRPASSPSATPKASGQPDGTATRNVTVIDLTGEDDDDDETPSPTPRPLGLPALCESPATPAITTSPASTPPPTSPQPTPQLSPSPPSSQLASSSPVPLLSSLAGHDVLGSSQTTVDNTPCSATMQGRKRLCMSDAGGEPYPIVSPPQLKRTRRTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.19
6 0.25
7 0.32
8 0.41
9 0.47
10 0.53
11 0.62
12 0.68
13 0.71
14 0.72
15 0.75
16 0.73
17 0.7
18 0.68
19 0.62
20 0.58
21 0.52
22 0.48
23 0.42
24 0.39
25 0.4
26 0.36
27 0.33
28 0.33
29 0.32
30 0.32
31 0.32
32 0.33
33 0.29
34 0.27
35 0.24
36 0.21
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.15
41 0.21
42 0.27
43 0.31
44 0.31
45 0.3
46 0.31
47 0.31
48 0.3
49 0.25
50 0.19
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.2
67 0.22
68 0.22
69 0.21
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.11
75 0.08
76 0.06
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.06
84 0.09
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.15
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.2
93 0.2
94 0.23
95 0.23
96 0.23
97 0.21
98 0.18
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.16
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.22
112 0.24
113 0.25
114 0.28
115 0.32
116 0.4
117 0.42
118 0.42
119 0.41
120 0.39
121 0.39
122 0.37
123 0.33
124 0.29
125 0.25
126 0.24
127 0.27
128 0.26
129 0.23
130 0.18
131 0.14
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.08
139 0.1
140 0.11
141 0.14
142 0.19
143 0.22
144 0.26
145 0.26
146 0.25
147 0.23
148 0.26
149 0.27
150 0.27
151 0.28
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.17
157 0.13
158 0.09
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.15
170 0.23
171 0.25
172 0.32
173 0.33
174 0.33
175 0.32
176 0.31
177 0.28
178 0.19
179 0.15
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.12
191 0.15
192 0.16
193 0.19
194 0.19
195 0.24
196 0.26
197 0.28
198 0.24
199 0.28
200 0.28
201 0.3
202 0.32
203 0.29
204 0.31
205 0.3
206 0.31
207 0.32
208 0.34
209 0.3
210 0.3
211 0.29
212 0.26
213 0.32
214 0.33
215 0.3
216 0.36
217 0.37
218 0.41
219 0.41
220 0.41
221 0.34
222 0.33
223 0.29
224 0.2
225 0.19
226 0.13
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.1
289 0.17
290 0.2
291 0.22
292 0.23
293 0.27
294 0.32
295 0.38
296 0.39
297 0.36
298 0.35
299 0.34
300 0.33
301 0.32
302 0.28
303 0.27
304 0.31
305 0.31
306 0.36
307 0.36
308 0.37
309 0.43
310 0.48
311 0.45
312 0.42
313 0.46
314 0.47
315 0.51
316 0.5
317 0.44
318 0.38
319 0.37
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.26
324 0.25
325 0.24
326 0.28
327 0.31
328 0.33
329 0.33
330 0.37
331 0.35
332 0.38
333 0.4
334 0.37
335 0.34
336 0.36
337 0.32
338 0.25
339 0.24
340 0.19
341 0.17
342 0.14
343 0.14
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.12
352 0.18
353 0.21
354 0.21
355 0.23
356 0.24
357 0.27
358 0.29
359 0.31
360 0.27
361 0.27
362 0.28
363 0.28
364 0.32
365 0.31
366 0.33
367 0.27
368 0.26
369 0.22
370 0.24
371 0.24
372 0.26
373 0.3
374 0.29
375 0.29
376 0.3
377 0.34
378 0.3
379 0.27
380 0.21
381 0.15
382 0.13
383 0.12
384 0.09
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.15
393 0.15
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.2
398 0.2
399 0.2
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.09
406 0.08
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.15
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.16
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.14
444 0.14
445 0.13
446 0.13
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.12
467 0.14
468 0.16
469 0.2
470 0.22
471 0.22
472 0.26
473 0.26
474 0.22
475 0.24
476 0.29
477 0.28
478 0.29
479 0.27
480 0.23
481 0.23
482 0.2
483 0.18
484 0.13
485 0.17
486 0.16
487 0.19
488 0.2
489 0.2
490 0.2
491 0.2
492 0.19
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.15
497 0.15
498 0.15
499 0.14
500 0.14
501 0.11
502 0.16
503 0.15
504 0.13
505 0.15
506 0.15
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.1
525 0.11
526 0.12
527 0.11
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.11
537 0.13
538 0.13
539 0.15
540 0.18
541 0.19
542 0.2
543 0.18
544 0.22
545 0.24
546 0.25
547 0.24
548 0.21
549 0.22
550 0.3
551 0.35
552 0.35
553 0.32
554 0.33
555 0.35
556 0.37
557 0.35
558 0.3
559 0.24
560 0.2
561 0.18
562 0.15
563 0.13
564 0.1
565 0.1
566 0.05
567 0.04
568 0.03
569 0.04
570 0.04
571 0.03
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.08
577 0.09
578 0.11
579 0.13
580 0.16
581 0.2
582 0.21
583 0.22
584 0.2
585 0.24
586 0.22
587 0.2
588 0.24
589 0.23
590 0.23
591 0.24
592 0.24
593 0.23
594 0.23
595 0.23
596 0.2
597 0.17
598 0.16
599 0.14
600 0.13
601 0.1
602 0.11
603 0.11
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.12
609 0.14
610 0.13
611 0.14
612 0.16
613 0.17
614 0.18
615 0.16
616 0.2
617 0.19
618 0.23
619 0.22
620 0.21
621 0.2
622 0.19
623 0.19
624 0.12
625 0.1
626 0.05
627 0.06
628 0.05
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.13
633 0.16
634 0.18
635 0.2
636 0.22
637 0.25
638 0.32
639 0.42
640 0.47
641 0.53
642 0.63
643 0.66
644 0.74
645 0.79
646 0.81
647 0.79
648 0.8
649 0.81
650 0.81
651 0.84
652 0.85
653 0.83
654 0.81
655 0.78
656 0.71
657 0.61
658 0.5
659 0.4
660 0.3
661 0.22
662 0.15
663 0.1
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.1
676 0.08
677 0.09
678 0.1
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.08
685 0.08
686 0.07
687 0.07
688 0.06
689 0.08
690 0.08
691 0.09
692 0.08
693 0.09
694 0.1
695 0.1
696 0.11
697 0.09
698 0.1
699 0.09
700 0.11
701 0.12
702 0.11
703 0.11
704 0.1
705 0.12
706 0.15
707 0.17
708 0.19
709 0.25
710 0.26
711 0.31
712 0.33
713 0.33
714 0.36
715 0.39
716 0.43
717 0.38
718 0.39
719 0.36
720 0.34
721 0.33
722 0.31
723 0.28
724 0.28
725 0.34
726 0.37
727 0.39
728 0.4
729 0.42
730 0.44
731 0.44
732 0.42
733 0.4
734 0.41
735 0.38
736 0.36
737 0.33
738 0.27
739 0.29
740 0.25
741 0.19
742 0.15
743 0.14
744 0.14
745 0.13
746 0.12
747 0.08
748 0.07
749 0.08
750 0.06
751 0.09
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.11
756 0.11
757 0.12
758 0.16
759 0.14
760 0.15
761 0.16
762 0.16
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.1
767 0.1
768 0.09
769 0.07
770 0.08
771 0.08
772 0.09
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.07
777 0.08
778 0.11
779 0.12
780 0.14
781 0.15
782 0.16
783 0.23
784 0.25
785 0.25
786 0.22
787 0.21
788 0.19
789 0.19
790 0.17
791 0.1
792 0.11
793 0.1
794 0.12
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.08
801 0.09
802 0.08
803 0.1
804 0.13
805 0.16
806 0.17
807 0.19
808 0.21
809 0.22
810 0.25
811 0.29
812 0.27
813 0.27
814 0.26
815 0.27
816 0.28
817 0.27
818 0.24
819 0.18
820 0.16
821 0.14
822 0.13
823 0.11
824 0.09
825 0.08
826 0.1
827 0.11
828 0.13
829 0.16
830 0.19
831 0.22
832 0.27
833 0.31
834 0.37
835 0.43
836 0.45
837 0.42
838 0.41
839 0.38
840 0.35
841 0.31
842 0.24
843 0.17
844 0.14
845 0.13
846 0.12
847 0.13
848 0.12
849 0.12
850 0.14
851 0.14
852 0.14
853 0.15
854 0.15
855 0.15
856 0.15
857 0.15
858 0.19
859 0.26
860 0.26
861 0.26
862 0.28
863 0.35
864 0.37
865 0.38
866 0.33
867 0.29
868 0.33
869 0.35
870 0.34
871 0.29
872 0.27
873 0.25
874 0.25
875 0.22
876 0.18
877 0.15
878 0.13
879 0.11
880 0.1
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.08
885 0.09
886 0.09
887 0.08
888 0.1
889 0.09
890 0.1
891 0.11
892 0.13
893 0.14
894 0.14
895 0.15
896 0.16
897 0.19
898 0.22
899 0.29
900 0.29
901 0.31
902 0.32
903 0.33
904 0.32
905 0.28
906 0.24
907 0.2
908 0.22
909 0.2
910 0.18
911 0.15
912 0.17
913 0.19
914 0.2
915 0.18
916 0.17
917 0.18
918 0.22
919 0.23
920 0.24
921 0.26
922 0.32
923 0.34
924 0.38
925 0.4
926 0.44
927 0.5
928 0.52
929 0.51
930 0.49
931 0.54
932 0.5
933 0.51
934 0.48
935 0.45
936 0.44
937 0.43
938 0.4
939 0.33
940 0.34
941 0.31
942 0.3
943 0.26
944 0.26
945 0.24
946 0.22
947 0.21
948 0.18
949 0.17
950 0.13
951 0.12
952 0.11
953 0.12
954 0.12
955 0.11
956 0.11
957 0.1
958 0.09
959 0.1
960 0.09
961 0.08
962 0.09
963 0.1
964 0.11
965 0.12
966 0.14
967 0.15
968 0.15
969 0.17
970 0.16
971 0.17
972 0.19
973 0.24
974 0.32
975 0.39
976 0.47
977 0.49
978 0.53
979 0.55
980 0.56
981 0.51
982 0.49
983 0.43
984 0.41
985 0.41
986 0.42
987 0.39
988 0.35
989 0.33
990 0.27
991 0.24
992 0.17
993 0.16
994 0.14
995 0.22
996 0.27
997 0.38
998 0.47
999 0.52