FuNGI

A0A162MCD1

Protein Details

Accession

A0A162MCD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-202	LRFQRLCRTHKKNVKMTCIA	Hydrophilic
833-857	PWENRRAASPVKRKRKRGADTGAGS	Hydrophilic
931-957	NQGAVARQKKTRNGHKKDNTRLQQLQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
838-850	RAASPVKRKRKRG

Subcellular Location(s)

mito 9, extr 7, cyto_mito 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MDIHRCRFVPYPASAINAVAFSHPHLSTGSRHSKTVPTRLAIGRANGDIEIWNPMQGVWLQEMTIPGGQDRSVEGLAWLVGDDEEIETSGGGGKIVSHGRLRLFSIGYTNTITEWDLEQACAKRHASGQHGAIWCLAAQPKLSSTELAAATSTSSSSSLSSQRLVGGTMDGCLVLYATDDDDLRFQRLCRTHKKNVKMTCIAFQTRQLAVVGCSDSTIRIVDVRNGAILHAMTLGRDLAGGARDVIVWSVRCLPGGDIVSGDSTGQVCIWDGRTYTQAQRIQGHTQDVLSLAVSADGGAIVSGGMDRRVVLYHTLTGGRAARWAKVWHRRYHHHDVKAMATFEAKGISVVVAGGPDATPVVLPLQKSGMEHHRTLSHLPQTVPVASAPQARRVICWWERQVHIWALDAPVDQLLRGVDADGPDAAADTEADFERNRRLVGRILIKGEANITAAAISPDGALVVVATHDDVKAFHLQKAAAARTGAAAGNGALRISKVAVPAAAATKGATDVAISPDGRWVCLVRGVENYVTMLECMRHGSDANGTSGTPTTPSFRPKPLRLTRLKRAIPRYELFSGLGRYDRRVTQVAFSPDSKMLAAGDLAGYIDTWVLRATEDKSGETAGEKEGEGDEDDVESASSSDEDSDAEEEPSGRNGAEGANDTSDGSWWVRNPRAKQLPKLSAAPVVLSFTPDVPGAPAVAGPSPPSPPPAAAANGVATKKANGTTAASTAVVVADDYVLLAITATSRLFAFHPLRARLVAWQRRLSPAHLPAAYRDIRDLAKGVIWQGPRAWLYGTSFLFMLDTSVEGGSSSGSGVGAGADIDAASLSTSAVAPWENRRAASPVKRKRKRGADTGAGSTMEVGRLAPQRIQIAADQDGWVDVDMRDADSRKQHHEDDDDNDDGGHSSSDDDSSDDDNSSSNNADAGASDADNQGAVARQKKTRNGHKKDNTRLQQLQQQLDQPQPTRSWHTFKYRPILGVVPLQTTTPAAYDSTAASYPPLEVALVERPNWDIDLPVRYDEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.34
3	0.29
4	0.23
5	0.2
6	0.15
7	0.14
8	0.13
9	0.17
10	0.16
11	0.16
12	0.17
13	0.19
14	0.22
15	0.32
16	0.4
17	0.37
18	0.38
19	0.41
20	0.48
21	0.53
22	0.59
23	0.56
24	0.48
25	0.53
26	0.54
27	0.58
28	0.52
29	0.48
30	0.42
31	0.36
32	0.35
33	0.27
34	0.25
35	0.19
36	0.17
37	0.18
38	0.15
39	0.14
40	0.13
41	0.13
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.14
49	0.15
50	0.16
51	0.16
52	0.14
53	0.12
54	0.13
55	0.13
56	0.12
57	0.13
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.1
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.11
82	0.14
83	0.17
84	0.17
85	0.2
86	0.23
87	0.25
88	0.27
89	0.27
90	0.25
91	0.23
92	0.25
93	0.24
94	0.24
95	0.23
96	0.21
97	0.17
98	0.18
99	0.17
100	0.14
101	0.13
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.19
106	0.21
107	0.23
108	0.27
109	0.26
110	0.25
111	0.28
112	0.33
113	0.34
114	0.37
115	0.37
116	0.4
117	0.41
118	0.38
119	0.35
120	0.29
121	0.24
122	0.21
123	0.2
124	0.14
125	0.14
126	0.14
127	0.16
128	0.19
129	0.2
130	0.17
131	0.16
132	0.21
133	0.2
134	0.2
135	0.18
136	0.14
137	0.14
138	0.13
139	0.13
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.09
144	0.12
145	0.16
146	0.18
147	0.19
148	0.19
149	0.2
150	0.2
151	0.2
152	0.17
153	0.15
154	0.13
155	0.12
156	0.11
157	0.09
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.04
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.11
169	0.13
170	0.14
171	0.15
172	0.15
173	0.22
174	0.3
175	0.37
176	0.45
177	0.52
178	0.61
179	0.68
180	0.78
181	0.78
182	0.79
183	0.8
184	0.77
185	0.71
186	0.67
187	0.65
188	0.58
189	0.51
190	0.47
191	0.42
192	0.35
193	0.33
194	0.27
195	0.21
196	0.19
197	0.2
198	0.16
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.08
206	0.1
207	0.11
208	0.14
209	0.17
210	0.17
211	0.17
212	0.17
213	0.16
214	0.15
215	0.14
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.06
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.14
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.15
241	0.17
242	0.19
243	0.17
244	0.13
245	0.13
246	0.13
247	0.13
248	0.12
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.09
257	0.1
258	0.1
259	0.12
260	0.14
261	0.17
262	0.2
263	0.27
264	0.29
265	0.31
266	0.35
267	0.37
268	0.39
269	0.39
270	0.38
271	0.31
272	0.27
273	0.24
274	0.2
275	0.16
276	0.12
277	0.09
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.02
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.03
290	0.03
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.14
304	0.15
305	0.13
306	0.17
307	0.16
308	0.16
309	0.18
310	0.23
311	0.29
312	0.38
313	0.45
314	0.48
315	0.54
316	0.61
317	0.67
318	0.74
319	0.74
320	0.69
321	0.65
322	0.6
323	0.57
324	0.52
325	0.44
326	0.33
327	0.25
328	0.2
329	0.16
330	0.14
331	0.1
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.11
354	0.14
355	0.21
356	0.24
357	0.24
358	0.25
359	0.26
360	0.27
361	0.28
362	0.3
363	0.27
364	0.26
365	0.25
366	0.26
367	0.26
368	0.24
369	0.23
370	0.17
371	0.14
372	0.12
373	0.19
374	0.17
375	0.22
376	0.25
377	0.25
378	0.26
379	0.26
380	0.33
381	0.3
382	0.36
383	0.34
384	0.34
385	0.35
386	0.37
387	0.38
388	0.33
389	0.3
390	0.23
391	0.2
392	0.16
393	0.16
394	0.13
395	0.1
396	0.08
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.04
413	0.03
414	0.03
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.12
424	0.14
425	0.16
426	0.22
427	0.27
428	0.26
429	0.26
430	0.27
431	0.26
432	0.24
433	0.21
434	0.16
435	0.11
436	0.08
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.02
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.06
458	0.12
459	0.13
460	0.14
461	0.16
462	0.16
463	0.18
464	0.21
465	0.2
466	0.15
467	0.14
468	0.13
469	0.11
470	0.12
471	0.1
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.07
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.04
496	0.03
497	0.04
498	0.05
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.09
507	0.08
508	0.12
509	0.12
510	0.1
511	0.11
512	0.12
513	0.12
514	0.12
515	0.11
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.06
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.07
537	0.1
538	0.12
539	0.17
540	0.2
541	0.27
542	0.34
543	0.36
544	0.46
545	0.5
546	0.57
547	0.61
548	0.66
549	0.67
550	0.71
551	0.72
552	0.68
553	0.68
554	0.64
555	0.61
556	0.54
557	0.51
558	0.43
559	0.39
560	0.33
561	0.27
562	0.23
563	0.18
564	0.2
565	0.15
566	0.15
567	0.17
568	0.17
569	0.18
570	0.2
571	0.2
572	0.19
573	0.24
574	0.25
575	0.25
576	0.25
577	0.24
578	0.22
579	0.22
580	0.19
581	0.14
582	0.1
583	0.08
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.06
599	0.08
600	0.12
601	0.13
602	0.13
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.12
608	0.08
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.1
647	0.1
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.08
652	0.08
653	0.1
654	0.15
655	0.21
656	0.27
657	0.29
658	0.38
659	0.47
660	0.51
661	0.57
662	0.61
663	0.61
664	0.59
665	0.59
666	0.51
667	0.43
668	0.39
669	0.32
670	0.23
671	0.18
672	0.15
673	0.13
674	0.12
675	0.09
676	0.09
677	0.09
678	0.08
679	0.07
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.07
688	0.08
689	0.1
690	0.1
691	0.12
692	0.12
693	0.12
694	0.14
695	0.15
696	0.15
697	0.15
698	0.15
699	0.14
700	0.17
701	0.17
702	0.16
703	0.13
704	0.12
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.11
709	0.14
710	0.15
711	0.15
712	0.16
713	0.15
714	0.13
715	0.12
716	0.11
717	0.08
718	0.06
719	0.05
720	0.04
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.03
727	0.02
728	0.03
729	0.04
730	0.04
731	0.05
732	0.05
733	0.06
734	0.07
735	0.14
736	0.16
737	0.2
738	0.26
739	0.28
740	0.29
741	0.29
742	0.29
743	0.29
744	0.37
745	0.4
746	0.4
747	0.43
748	0.44
749	0.49
750	0.5
751	0.46
752	0.43
753	0.41
754	0.41
755	0.38
756	0.37
757	0.32
758	0.37
759	0.36
760	0.29
761	0.25
762	0.21
763	0.2
764	0.21
765	0.2
766	0.14
767	0.14
768	0.14
769	0.15
770	0.17
771	0.17
772	0.17
773	0.17
774	0.2
775	0.19
776	0.19
777	0.18
778	0.15
779	0.17
780	0.23
781	0.22
782	0.19
783	0.18
784	0.17
785	0.16
786	0.14
787	0.12
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.03
813	0.03
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.05
818	0.06
819	0.09
820	0.14
821	0.22
822	0.22
823	0.23
824	0.25
825	0.29
826	0.36
827	0.44
828	0.5
829	0.53
830	0.64
831	0.72
832	0.79
833	0.85
834	0.87
835	0.84
836	0.84
837	0.82
838	0.81
839	0.76
840	0.72
841	0.64
842	0.53
843	0.45
844	0.35
845	0.27
846	0.17
847	0.13
848	0.08
849	0.11
850	0.15
851	0.17
852	0.18
853	0.21
854	0.22
855	0.23
856	0.25
857	0.22
858	0.21
859	0.22
860	0.22
861	0.18
862	0.17
863	0.16
864	0.15
865	0.13
866	0.1
867	0.07
868	0.09
869	0.09
870	0.11
871	0.14
872	0.15
873	0.19
874	0.25
875	0.3
876	0.34
877	0.39
878	0.4
879	0.43
880	0.48
881	0.48
882	0.46
883	0.48
884	0.42
885	0.37
886	0.33
887	0.28
888	0.23
889	0.19
890	0.13
891	0.07
892	0.08
893	0.08
894	0.09
895	0.09
896	0.09
897	0.11
898	0.13
899	0.14
900	0.13
901	0.13
902	0.12
903	0.13
904	0.14
905	0.12
906	0.1
907	0.09
908	0.09
909	0.09
910	0.09
911	0.11
912	0.11
913	0.1
914	0.11
915	0.12
916	0.11
917	0.11
918	0.1
919	0.08
920	0.11
921	0.15
922	0.2
923	0.25
924	0.32
925	0.39
926	0.48
927	0.58
928	0.65
929	0.72
930	0.75
931	0.81
932	0.85
933	0.89
934	0.91
935	0.92
936	0.89
937	0.87
938	0.84
939	0.79
940	0.75
941	0.73
942	0.67
943	0.6
944	0.57
945	0.52
946	0.51
947	0.51
948	0.46
949	0.43
950	0.41
951	0.41
952	0.44
953	0.46
954	0.48
955	0.49
956	0.57
957	0.6
958	0.64
959	0.69
960	0.64
961	0.6
962	0.56
963	0.52
964	0.45
965	0.45
966	0.39
967	0.32
968	0.28
969	0.27
970	0.24
971	0.22
972	0.19
973	0.13
974	0.12
975	0.1
976	0.11
977	0.12
978	0.12
979	0.15
980	0.14
981	0.14
982	0.13
983	0.13
984	0.13
985	0.12
986	0.12
987	0.08
988	0.08
989	0.11
990	0.18
991	0.2
992	0.2
993	0.21
994	0.22
995	0.23
996	0.24
997	0.21
998	0.16
999	0.17
1000	0.23
1001	0.24

A0A162MCD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer