FuNGI

J5JXC1

Protein Details

Accession

J5JXC1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
639-659	LSKSRPITQKKAEPAVRQRLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 13, mito 10, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019049 Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF09531 Ndc1_Nup

Amino Acid Sequences

MAAAVVRRAPYKDTLQPALHRRFAATATLLLAVAYIEALALASWTSFLWSWFPLGPTGIRTAIIFTSGLAILVLRIAHYHVGVRTESGAQTLKALLFRLQTYETFFWYAISSTLFCPVYLWSLNDSAGLRWITYFSGDRARLNERPIFLACYFGTCAVMQTIVHYQSDIDRLVVASEPKAEDVKPKTSGFLTGSPKKIMQQFPTLFAGCIKQATFSLVMAIVLYYALFRSFTWSWALMLFRPFYNLPRTNIVPNSWPTDLFLMVRCVWAGALLNAIWAAGNTGFSILMAKAPLKNGKPFTTESKDPNGSLLNGLKSKKDSIQCFAMWELAIIARDFDAQRKAIYADIDRKDGPMWSQVYLICMTVIRSIEERVDAYGKPILPAVPVTAPEVSKQRGSAPLRQDEIFTKGNVSRGGVDKAWDQFARSPGSSPIAELSPIAKKTWRQTRDRMLTKEQQEAVSKESIQSYIDQAASRLLKLEWISSIFRRDFGTEFAAVVLGQPYAEPTVYIHATQALCQLAIHSLAEDQYGNVHRDVPSIIRTLTAIIKKVEALKTQFPIHWTDSSRCRESPEVDQVLDAMRLGLEQVVAKFEPFSGDLRLTLTDLRLAKEAMTKSQPASEPEAVKETKESKDARAKRTDLSKSRPITQKKAEPAVRQRLDQRRPEMQQAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.5
3	0.56
4	0.62
5	0.65
6	0.63
7	0.56
8	0.51
9	0.46
10	0.42
11	0.39
12	0.31
13	0.25
14	0.21
15	0.21
16	0.19
17	0.16
18	0.14
19	0.1
20	0.07
21	0.06
22	0.04
23	0.03
24	0.03
25	0.03
26	0.03
27	0.03
28	0.03
29	0.03
30	0.04
31	0.04
32	0.06
33	0.07
34	0.08
35	0.1
36	0.11
37	0.14
38	0.15
39	0.17
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.21
45	0.19
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.16
50	0.16
51	0.13
52	0.1
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.08
57	0.08
58	0.06
59	0.08
60	0.08
61	0.05
62	0.06
63	0.07
64	0.08
65	0.09
66	0.12
67	0.12
68	0.15
69	0.15
70	0.16
71	0.17
72	0.18
73	0.18
74	0.18
75	0.18
76	0.15
77	0.16
78	0.17
79	0.16
80	0.16
81	0.17
82	0.16
83	0.17
84	0.18
85	0.2
86	0.2
87	0.2
88	0.25
89	0.25
90	0.25
91	0.24
92	0.23
93	0.2
94	0.19
95	0.19
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.16
101	0.16
102	0.15
103	0.15
104	0.15
105	0.17
106	0.18
107	0.18
108	0.16
109	0.17
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.14
114	0.17
115	0.16
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.12
120	0.14
121	0.15
122	0.13
123	0.21
124	0.22
125	0.24
126	0.27
127	0.32
128	0.33
129	0.37
130	0.38
131	0.31
132	0.33
133	0.33
134	0.34
135	0.27
136	0.28
137	0.23
138	0.21
139	0.21
140	0.18
141	0.18
142	0.13
143	0.14
144	0.1
145	0.11
146	0.08
147	0.1
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.14
154	0.17
155	0.15
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.12
161	0.11
162	0.09
163	0.11
164	0.11
165	0.12
166	0.13
167	0.13
168	0.18
169	0.22
170	0.26
171	0.29
172	0.29
173	0.3
174	0.29
175	0.32
176	0.28
177	0.31
178	0.34
179	0.36
180	0.38
181	0.38
182	0.38
183	0.39
184	0.43
185	0.4
186	0.36
187	0.39
188	0.38
189	0.4
190	0.43
191	0.39
192	0.32
193	0.28
194	0.26
195	0.16
196	0.17
197	0.13
198	0.1
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.1
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.04
215	0.04
216	0.1
217	0.11
218	0.12
219	0.15
220	0.15
221	0.16
222	0.17
223	0.18
224	0.13
225	0.15
226	0.15
227	0.12
228	0.15
229	0.15
230	0.16
231	0.24
232	0.26
233	0.26
234	0.3
235	0.32
236	0.32
237	0.34
238	0.32
239	0.28
240	0.26
241	0.28
242	0.24
243	0.22
244	0.2
245	0.19
246	0.18
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.03
265	0.04
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.07
278	0.1
279	0.14
280	0.15
281	0.21
282	0.23
283	0.25
284	0.27
285	0.29
286	0.34
287	0.35
288	0.37
289	0.35
290	0.38
291	0.37
292	0.34
293	0.33
294	0.27
295	0.21
296	0.2
297	0.18
298	0.14
299	0.16
300	0.17
301	0.17
302	0.17
303	0.18
304	0.22
305	0.25
306	0.25
307	0.25
308	0.28
309	0.27
310	0.27
311	0.26
312	0.21
313	0.16
314	0.13
315	0.1
316	0.07
317	0.07
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.12
331	0.13
332	0.19
333	0.2
334	0.22
335	0.22
336	0.22
337	0.21
338	0.2
339	0.18
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.15
347	0.14
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.09
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.1
361	0.09
362	0.1
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.11
368	0.09
369	0.1
370	0.09
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.14
378	0.14
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.22
383	0.26
384	0.31
385	0.33
386	0.36
387	0.38
388	0.38
389	0.37
390	0.31
391	0.32
392	0.27
393	0.21
394	0.19
395	0.18
396	0.2
397	0.19
398	0.18
399	0.16
400	0.17
401	0.19
402	0.17
403	0.17
404	0.17
405	0.18
406	0.2
407	0.18
408	0.17
409	0.17
410	0.2
411	0.23
412	0.2
413	0.2
414	0.19
415	0.22
416	0.2
417	0.18
418	0.16
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.14
425	0.15
426	0.16
427	0.19
428	0.27
429	0.37
430	0.42
431	0.44
432	0.51
433	0.61
434	0.69
435	0.73
436	0.71
437	0.68
438	0.69
439	0.66
440	0.64
441	0.55
442	0.48
443	0.44
444	0.4
445	0.35
446	0.29
447	0.26
448	0.21
449	0.2
450	0.17
451	0.14
452	0.14
453	0.13
454	0.13
455	0.15
456	0.13
457	0.13
458	0.17
459	0.17
460	0.15
461	0.15
462	0.12
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.12
467	0.14
468	0.17
469	0.17
470	0.23
471	0.21
472	0.22
473	0.22
474	0.23
475	0.21
476	0.21
477	0.23
478	0.17
479	0.17
480	0.15
481	0.14
482	0.12
483	0.11
484	0.09
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.1
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.15
498	0.15
499	0.16
500	0.18
501	0.15
502	0.14
503	0.13
504	0.14
505	0.1
506	0.11
507	0.1
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.09
512	0.08
513	0.07
514	0.11
515	0.14
516	0.15
517	0.15
518	0.17
519	0.17
520	0.18
521	0.2
522	0.17
523	0.17
524	0.17
525	0.17
526	0.15
527	0.15
528	0.16
529	0.21
530	0.21
531	0.21
532	0.2
533	0.21
534	0.22
535	0.28
536	0.29
537	0.29
538	0.31
539	0.33
540	0.36
541	0.38
542	0.38
543	0.34
544	0.36
545	0.34
546	0.34
547	0.33
548	0.35
549	0.41
550	0.46
551	0.49
552	0.45
553	0.46
554	0.46
555	0.45
556	0.48
557	0.49
558	0.45
559	0.41
560	0.4
561	0.35
562	0.32
563	0.28
564	0.2
565	0.1
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.06
570	0.06
571	0.07
572	0.08
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.11
578	0.13
579	0.13
580	0.15
581	0.15
582	0.16
583	0.16
584	0.17
585	0.18
586	0.17
587	0.17
588	0.16
589	0.18
590	0.19
591	0.2
592	0.2
593	0.2
594	0.2
595	0.25
596	0.26
597	0.26
598	0.3
599	0.3
600	0.3
601	0.36
602	0.38
603	0.35
604	0.41
605	0.41
606	0.39
607	0.39
608	0.44
609	0.38
610	0.36
611	0.38
612	0.35
613	0.32
614	0.37
615	0.37
616	0.39
617	0.49
618	0.57
619	0.59
620	0.64
621	0.63
622	0.63
623	0.7
624	0.72
625	0.7
626	0.7
627	0.71
628	0.66
629	0.73
630	0.75
631	0.73
632	0.73
633	0.73
634	0.74
635	0.74
636	0.79
637	0.78
638	0.78
639	0.8
640	0.82
641	0.76
642	0.72
643	0.73
644	0.73
645	0.75
646	0.74
647	0.72
648	0.71
649	0.72

J5JXC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer