Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165HLB8

Protein Details
Accession A0A165HLB8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-277TERLPFYRTRHLRNPWNHDREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences PATDRSRRQQNANPPAQRSEWVMWVGNVPSDATHDELWRFLNQEPSPGSTSSAAAEDAWAGVLSIFLISRSNCAFVNFQSEAKLLAAIQHFNGQPVRPNDPRCPRLVCRVRGRDDDLKAGVGGQRSAGLHVRWIRGQKRKARAQALALGDQSRSASSHSGSGSGSYASTSSSIFTQYFPKRYFILKSLTQKDLDISVEKGLWATQRHNEATLDQAYRTSKEVYLIFGVNKSGEFYGCARIAERLPGNPFKVQWVRTERLPFYRTRHLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPSVGQALLDEWD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.64
4 0.57
5 0.52
6 0.44
7 0.38
8 0.34
9 0.31
10 0.27
11 0.28
12 0.26
13 0.21
14 0.19
15 0.15
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.18
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.26
29 0.24
30 0.29
31 0.29
32 0.31
33 0.32
34 0.3
35 0.31
36 0.23
37 0.23
38 0.19
39 0.18
40 0.14
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.06
55 0.06
56 0.09
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.14
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.17
71 0.09
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.15
81 0.2
82 0.23
83 0.3
84 0.3
85 0.35
86 0.42
87 0.5
88 0.52
89 0.49
90 0.52
91 0.48
92 0.54
93 0.58
94 0.57
95 0.58
96 0.63
97 0.64
98 0.61
99 0.65
100 0.61
101 0.54
102 0.5
103 0.4
104 0.33
105 0.28
106 0.24
107 0.2
108 0.13
109 0.11
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.09
116 0.13
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.25
121 0.31
122 0.37
123 0.45
124 0.48
125 0.54
126 0.6
127 0.65
128 0.64
129 0.59
130 0.53
131 0.52
132 0.46
133 0.39
134 0.32
135 0.25
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.17
163 0.2
164 0.26
165 0.27
166 0.28
167 0.28
168 0.31
169 0.32
170 0.28
171 0.29
172 0.3
173 0.37
174 0.4
175 0.41
176 0.39
177 0.36
178 0.34
179 0.3
180 0.25
181 0.18
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.14
191 0.18
192 0.23
193 0.24
194 0.26
195 0.25
196 0.23
197 0.25
198 0.26
199 0.23
200 0.17
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.2
206 0.16
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.19
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.27
232 0.32
233 0.34
234 0.34
235 0.34
236 0.36
237 0.4
238 0.38
239 0.4
240 0.43
241 0.44
242 0.47
243 0.55
244 0.5
245 0.52
246 0.53
247 0.5
248 0.49
249 0.56
250 0.57
251 0.58
252 0.64
253 0.65
254 0.72
255 0.77
256 0.8
257 0.8
258 0.81
259 0.77
260 0.73
261 0.69
262 0.67
263 0.64
264 0.57
265 0.53
266 0.48
267 0.46
268 0.43
269 0.41
270 0.36
271 0.36
272 0.33
273 0.27
274 0.25
275 0.23
276 0.21
277 0.19
278 0.15
279 0.09