FuNGI

A0A165F519

Protein Details

Accession

A0A165F519

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
209-230	VYVGHYKPRKERKFKLEEMKAR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
319-325	KSRKQAK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034364 PABP_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR045305 RRM2_I_PABPs IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12378 RRM1_I_PABPs cd12379 RRM2_I_PABPs cd12380 RRM3_I_PABPs cd12381 RRM4_I_PABPs

Amino Acid Sequences

MPVSPSVAQPQEAPVPQVSEAAPAPPPAPAAMPPAPAYNPAPPPQMSSPSASLYVGELDPTVNEVMLFEIFDLVGPVESIRVCRDAVTRRSLGYAYVTYLNAEDAERALEQLNYSLIRGRACRIMWSQSDPARGANHQGGVFIKNLHEQIDDKALRNTFAAFGNLLSCDISTDKHGRSKGYGFVHYETTEAAETTIKEVNGMLLNDKKVYVGHYKPRKERKFKLEEMKARFTNIYVKNIDTEMTEEKFFDLFKQFGNITSAVIQHDDEGNSRGFGFVNFETHEEAQQAVETLHDTVFNGKKLFVARAQKKDERETELHKSRKQAKMEKARKYQGVDLFTNIYVKNIDAETTEEEFLDLFKQFGDITSAVIQRDDEGNSRGFGFVNFKTHKQAQQTVDNLHDTVFNGKKLFVARAQKKEERETELLNDYVQAKMKKLSKYQGVNIYIKNLEHDIDDDKLRAEFEPFGTITSAKVMRDDKGTSKGFGFVCFSSPDEATKAVAEMNNKMIGSKPLYVSLAQPREVRRQQLESQITQRNQIRMQQAAASGLGGHMPPRFVEGSGDDDRFSKVESKSYNKALRRSAP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.26
4	0.27
5	0.23
6	0.2
7	0.19
8	0.19
9	0.18
10	0.17
11	0.17
12	0.15
13	0.16
14	0.13
15	0.14
16	0.14
17	0.19
18	0.21
19	0.23
20	0.24
21	0.26
22	0.26
23	0.28
24	0.29
25	0.29
26	0.32
27	0.33
28	0.36
29	0.33
30	0.39
31	0.39
32	0.43
33	0.38
34	0.37
35	0.37
36	0.35
37	0.35
38	0.29
39	0.25
40	0.2
41	0.2
42	0.15
43	0.13
44	0.11
45	0.09
46	0.09
47	0.11
48	0.1
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.06
65	0.07
66	0.09
67	0.1
68	0.12
69	0.12
70	0.14
71	0.2
72	0.27
73	0.33
74	0.38
75	0.38
76	0.37
77	0.39
78	0.37
79	0.32
80	0.27
81	0.23
82	0.19
83	0.2
84	0.19
85	0.17
86	0.17
87	0.16
88	0.13
89	0.12
90	0.1
91	0.07
92	0.09
93	0.08
94	0.09
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.1
99	0.12
100	0.1
101	0.11
102	0.14
103	0.14
104	0.16
105	0.18
106	0.19
107	0.23
108	0.23
109	0.27
110	0.27
111	0.32
112	0.32
113	0.36
114	0.4
115	0.38
116	0.42
117	0.38
118	0.36
119	0.33
120	0.31
121	0.3
122	0.26
123	0.26
124	0.22
125	0.22
126	0.22
127	0.2
128	0.2
129	0.17
130	0.15
131	0.15
132	0.16
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.16
137	0.24
138	0.25
139	0.23
140	0.27
141	0.26
142	0.26
143	0.25
144	0.24
145	0.16
146	0.16
147	0.15
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.11
159	0.16
160	0.18
161	0.23
162	0.25
163	0.26
164	0.29
165	0.31
166	0.34
167	0.33
168	0.35
169	0.33
170	0.32
171	0.34
172	0.3
173	0.28
174	0.2
175	0.18
176	0.14
177	0.11
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.1
182	0.12
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.13
195	0.11
196	0.15
197	0.19
198	0.22
199	0.31
200	0.39
201	0.47
202	0.56
203	0.66
204	0.73
205	0.76
206	0.79
207	0.8
208	0.8
209	0.8
210	0.82
211	0.8
212	0.79
213	0.76
214	0.75
215	0.65
216	0.57
217	0.49
218	0.4
219	0.39
220	0.34
221	0.32
222	0.26
223	0.26
224	0.25
225	0.25
226	0.25
227	0.16
228	0.15
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.15
244	0.13
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.1
249	0.11
250	0.1
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.09
263	0.08
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.09
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.12
287	0.14
288	0.15
289	0.16
290	0.17
291	0.26
292	0.31
293	0.38
294	0.44
295	0.47
296	0.49
297	0.53
298	0.51
299	0.47
300	0.44
301	0.42
302	0.44
303	0.49
304	0.51
305	0.48
306	0.52
307	0.54
308	0.58
309	0.6
310	0.59
311	0.6
312	0.66
313	0.72
314	0.75
315	0.74
316	0.72
317	0.69
318	0.63
319	0.59
320	0.53
321	0.48
322	0.4
323	0.33
324	0.3
325	0.26
326	0.25
327	0.19
328	0.15
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.09
336	0.11
337	0.13
338	0.13
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.1
344	0.07
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.09
351	0.08
352	0.09
353	0.12
354	0.14
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.11
359	0.13
360	0.13
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.13
367	0.11
368	0.11
369	0.13
370	0.13
371	0.2
372	0.22
373	0.23
374	0.28
375	0.32
376	0.36
377	0.37
378	0.43
379	0.4
380	0.45
381	0.47
382	0.44
383	0.43
384	0.39
385	0.33
386	0.26
387	0.22
388	0.15
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.18
396	0.19
397	0.18
398	0.26
399	0.32
400	0.4
401	0.48
402	0.52
403	0.55
404	0.61
405	0.6
406	0.57
407	0.52
408	0.46
409	0.42
410	0.4
411	0.36
412	0.28
413	0.26
414	0.19
415	0.18
416	0.21
417	0.18
418	0.16
419	0.22
420	0.28
421	0.32
422	0.36
423	0.42
424	0.46
425	0.5
426	0.55
427	0.58
428	0.58
429	0.57
430	0.52
431	0.49
432	0.42
433	0.36
434	0.32
435	0.24
436	0.18
437	0.15
438	0.16
439	0.14
440	0.15
441	0.16
442	0.15
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.13
450	0.16
451	0.16
452	0.16
453	0.17
454	0.16
455	0.14
456	0.17
457	0.18
458	0.14
459	0.19
460	0.19
461	0.2
462	0.24
463	0.27
464	0.27
465	0.33
466	0.35
467	0.32
468	0.31
469	0.35
470	0.31
471	0.3
472	0.29
473	0.21
474	0.22
475	0.21
476	0.22
477	0.19
478	0.19
479	0.19
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.15
484	0.14
485	0.14
486	0.15
487	0.16
488	0.17
489	0.19
490	0.21
491	0.21
492	0.21
493	0.2
494	0.22
495	0.24
496	0.25
497	0.23
498	0.24
499	0.25
500	0.26
501	0.29
502	0.34
503	0.35
504	0.34
505	0.38
506	0.39
507	0.48
508	0.53
509	0.55
510	0.51
511	0.54
512	0.55
513	0.61
514	0.62
515	0.58
516	0.61
517	0.62
518	0.57
519	0.59
520	0.59
521	0.54
522	0.51
523	0.53
524	0.5
525	0.44
526	0.45
527	0.4
528	0.35
529	0.31
530	0.28
531	0.21
532	0.16
533	0.13
534	0.12
535	0.09
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.14
541	0.15
542	0.15
543	0.17
544	0.18
545	0.24
546	0.28
547	0.29
548	0.25
549	0.25
550	0.27
551	0.24
552	0.24
553	0.24
554	0.21
555	0.27
556	0.34
557	0.4
558	0.46
559	0.56
560	0.62
561	0.62
562	0.68

A0A165F519

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer