FuNGI

A0A165HNK6

Protein Details

Accession

A0A165HNK6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-289	YASSERQEIKKNKQRRASKRMSSSDQKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-310	KKNKQRRASKRMSSSDQKEALKAKEKEKEREARKVKPRAG

Subcellular Location(s)

cyto_mito 9.166, mito 9, cyto 9, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MRVVATFHQPSSVSHSVKCNLTPDQEHLVVAKSNRLEVFSLQPEGLRRECGLDIWGRVVALRAVPVDDTNKSNLLVLTDHPDPKLIPLAYEVDESGTASLISKEGIDLHDRDARPAEFVTDVFVDPSGHVAIVSCYTGRLKLVQLENGEVTGIPTDISIPELYILSLTFLYTGADMYTIGILHYDHQQRLQLLSRDLDIQNKELSAAYSTLLPSTILSAKKFPTTETPPRLVSVPPCSSSEEMGGNAGVLVLGGRDILFFEYASSERQEIKKNKQRRASKRMSSSDQKEALKAKEKEKEREARKVKPRAGVKWPWSEVTACCPVDEGGRRHLIGDEYGRLAVLVFDQASSLVLVPLGEASPATTLTYLTSQVVYVGSHFGESQIIRVHPSPVSELNSVTLPIPAGIVTVSPSSLMSGKGKERADDDVSSGKEDKEGKIVSGKGSYVEVLSNHENIAPVMDAVLADIDGSGQPQIITCSGGKNAGALKVVQTGADFQEKAVVEGIPNITNAWPLRSTFEDVIDTHLVASTLEQTFAFSLNASDVLLPSDASANGFISGSATLAIKNVLRRVMTNTAGRTVSSYSNSSLVVQVTPERVRLLEYDAARDVFSTAANDWDPTRERRTIVAVDLNASQFVVGLSGGKLALLNFNEKQEFQVHKHRDFTDTAGGATEISAVSCSPFDSSKSYAMTIAVSFWGTNKVALLSLKSADSPLATMCECDALPSLPRALLLHNFGAGRTRKETEYHPHLLVGLTDGTLCSFSIKDDQLHDKKVFALGSSPVSFTSCVVDGKPAIFASGSRASVLHWDRQRLHQSQVMVKGTVCATRLNASAFPSSLVLCTPSSLVIGKIRGADKMQIKTVPLGLDNPRRISYHSGLKVVVVACVRTAPSRIGDFDGRTSSLKVLEDTGFNQLTSFTCEPGEEISSVLALPGGHDLLSPSFCIGTVRLQPGEPEPSHGRILLFSLVTGRLSTKPVQSALDLVVSMPVNGCIYQLVNVQDMVAAAVNSSVLLFRLERSEASSFQLKKIAEWNHNYIVMSLAAKGNKLIVGDAISSVSVLTVIDSQINTVARDYAPLWPVAVEAMGDNGVIGANSDCNLFTFSLQRSGNRATLERNGSFYLGDVVNKIIPGGFGSADALGAQVVEPRHIFFTSTGRIGVILEMSNEISLHMTTLQHNMAKEIVGPGGVSHTKYRAPANSKGHSEAESAFGFLDGDFLEQFLLLSNPSTYLQGEIEVERVKMSQAEVEDILEKLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.4
3	0.42
4	0.44
5	0.45
6	0.41
7	0.38
8	0.42
9	0.42
10	0.41
11	0.43
12	0.41
13	0.39
14	0.35
15	0.33
16	0.31
17	0.28
18	0.29
19	0.23
20	0.26
21	0.26
22	0.27
23	0.26
24	0.25
25	0.31
26	0.29
27	0.31
28	0.27
29	0.28
30	0.3
31	0.33
32	0.32
33	0.28
34	0.24
35	0.26
36	0.26
37	0.25
38	0.25
39	0.24
40	0.24
41	0.23
42	0.23
43	0.19
44	0.18
45	0.19
46	0.16
47	0.13
48	0.13
49	0.12
50	0.12
51	0.13
52	0.16
53	0.18
54	0.19
55	0.21
56	0.22
57	0.23
58	0.23
59	0.23
60	0.22
61	0.2
62	0.18
63	0.17
64	0.2
65	0.24
66	0.26
67	0.24
68	0.25
69	0.23
70	0.24
71	0.3
72	0.25
73	0.2
74	0.21
75	0.24
76	0.24
77	0.25
78	0.22
79	0.16
80	0.16
81	0.16
82	0.13
83	0.1
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.09
92	0.11
93	0.14
94	0.15
95	0.19
96	0.26
97	0.27
98	0.29
99	0.32
100	0.3
101	0.28
102	0.27
103	0.25
104	0.19
105	0.18
106	0.19
107	0.16
108	0.16
109	0.14
110	0.14
111	0.13
112	0.11
113	0.14
114	0.11
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.09
122	0.1
123	0.11
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.15
128	0.22
129	0.26
130	0.29
131	0.3
132	0.32
133	0.31
134	0.28
135	0.26
136	0.19
137	0.15
138	0.11
139	0.09
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.06
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.06
159	0.07
160	0.05
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.15
171	0.2
172	0.2
173	0.22
174	0.26
175	0.26
176	0.3
177	0.35
178	0.32
179	0.3
180	0.3
181	0.29
182	0.31
183	0.31
184	0.34
185	0.29
186	0.26
187	0.25
188	0.24
189	0.23
190	0.19
191	0.19
192	0.14
193	0.13
194	0.11
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.08
201	0.11
202	0.15
203	0.16
204	0.18
205	0.21
206	0.23
207	0.27
208	0.28
209	0.27
210	0.3
211	0.37
212	0.45
213	0.48
214	0.51
215	0.47
216	0.48
217	0.48
218	0.42
219	0.38
220	0.36
221	0.33
222	0.31
223	0.32
224	0.34
225	0.34
226	0.32
227	0.3
228	0.22
229	0.18
230	0.17
231	0.15
232	0.11
233	0.1
234	0.08
235	0.06
236	0.04
237	0.03
238	0.02
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.08
249	0.09
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.17
254	0.21
255	0.31
256	0.36
257	0.46
258	0.54
259	0.62
260	0.68
261	0.74
262	0.81
263	0.82
264	0.85
265	0.84
266	0.84
267	0.85
268	0.84
269	0.82
270	0.81
271	0.76
272	0.74
273	0.7
274	0.62
275	0.56
276	0.53
277	0.5
278	0.51
279	0.5
280	0.48
281	0.5
282	0.55
283	0.59
284	0.63
285	0.67
286	0.63
287	0.7
288	0.7
289	0.71
290	0.75
291	0.77
292	0.74
293	0.72
294	0.73
295	0.69
296	0.71
297	0.7
298	0.67
299	0.66
300	0.62
301	0.55
302	0.5
303	0.45
304	0.36
305	0.34
306	0.34
307	0.25
308	0.23
309	0.22
310	0.21
311	0.24
312	0.3
313	0.27
314	0.25
315	0.28
316	0.28
317	0.28
318	0.29
319	0.25
320	0.21
321	0.21
322	0.18
323	0.16
324	0.15
325	0.15
326	0.13
327	0.12
328	0.09
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.07
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.12
371	0.12
372	0.14
373	0.15
374	0.17
375	0.15
376	0.16
377	0.17
378	0.17
379	0.21
380	0.2
381	0.19
382	0.18
383	0.18
384	0.17
385	0.14
386	0.12
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.09
402	0.1
403	0.13
404	0.15
405	0.22
406	0.22
407	0.22
408	0.23
409	0.26
410	0.28
411	0.25
412	0.25
413	0.24
414	0.24
415	0.25
416	0.24
417	0.19
418	0.19
419	0.2
420	0.19
421	0.19
422	0.19
423	0.18
424	0.21
425	0.22
426	0.2
427	0.2
428	0.19
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.11
436	0.13
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.07
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.07
463	0.07
464	0.09
465	0.09
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.1
478	0.09
479	0.11
480	0.13
481	0.12
482	0.09
483	0.14
484	0.14
485	0.15
486	0.14
487	0.12
488	0.1
489	0.12
490	0.13
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.12
501	0.14
502	0.17
503	0.15
504	0.17
505	0.16
506	0.16
507	0.19
508	0.17
509	0.15
510	0.12
511	0.11
512	0.1
513	0.08
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.05
528	0.05
529	0.04
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.05
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.04
548	0.05
549	0.06
550	0.07
551	0.08
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.12
556	0.17
557	0.2
558	0.22
559	0.24
560	0.23
561	0.24
562	0.23
563	0.23
564	0.19
565	0.17
566	0.15
567	0.14
568	0.14
569	0.13
570	0.13
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.13
586	0.14
587	0.14
588	0.15
589	0.16
590	0.16
591	0.15
592	0.14
593	0.11
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.09
603	0.12
604	0.14
605	0.18
606	0.18
607	0.19
608	0.19
609	0.22
610	0.21
611	0.21
612	0.21
613	0.17
614	0.16
615	0.16
616	0.15
617	0.12
618	0.1
619	0.08
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.06
632	0.06
633	0.1
634	0.1
635	0.12
636	0.12
637	0.12
638	0.14
639	0.17
640	0.19
641	0.2
642	0.29
643	0.33
644	0.35
645	0.39
646	0.39
647	0.37
648	0.35
649	0.33
650	0.28
651	0.23
652	0.21
653	0.16
654	0.15
655	0.12
656	0.11
657	0.09
658	0.04
659	0.03
660	0.04
661	0.03
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.07
668	0.1
669	0.12
670	0.14
671	0.15
672	0.16
673	0.15
674	0.15
675	0.14
676	0.11
677	0.09
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.08
689	0.09
690	0.07
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.07
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.06
708	0.07
709	0.08
710	0.08
711	0.07
712	0.08
713	0.08
714	0.08
715	0.1
716	0.12
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.18
722	0.18
723	0.18
724	0.19
725	0.21
726	0.2
727	0.22
728	0.27
729	0.29
730	0.35
731	0.36
732	0.33
733	0.31
734	0.31
735	0.29
736	0.24
737	0.18
738	0.1
739	0.06
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.04
747	0.05
748	0.09
749	0.11
750	0.12
751	0.15
752	0.24
753	0.27
754	0.31
755	0.31
756	0.28
757	0.27
758	0.28
759	0.25
760	0.16
761	0.15
762	0.12
763	0.15
764	0.15
765	0.15
766	0.12
767	0.13
768	0.13
769	0.11
770	0.11
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.11
778	0.09
779	0.08
780	0.08
781	0.08
782	0.12
783	0.15
784	0.14
785	0.13
786	0.14
787	0.14
788	0.21
789	0.23
790	0.24
791	0.24
792	0.29
793	0.3
794	0.37
795	0.44
796	0.4
797	0.41
798	0.37
799	0.37
800	0.37
801	0.42
802	0.36
803	0.3
804	0.27
805	0.25
806	0.23
807	0.22
808	0.18
809	0.12
810	0.11
811	0.13
812	0.14
813	0.15
814	0.15
815	0.16
816	0.16
817	0.15
818	0.15
819	0.13
820	0.12
821	0.1
822	0.09
823	0.09
824	0.08
825	0.08
826	0.08
827	0.07
828	0.08
829	0.08
830	0.09
831	0.1
832	0.11
833	0.12
834	0.15
835	0.15
836	0.16
837	0.17
838	0.21
839	0.24
840	0.26
841	0.27
842	0.25
843	0.25
844	0.25
845	0.26
846	0.21
847	0.16
848	0.18
849	0.22
850	0.28
851	0.31
852	0.32
853	0.32
854	0.32
855	0.33
856	0.36
857	0.34
858	0.35
859	0.35
860	0.34
861	0.33
862	0.32
863	0.33
864	0.26
865	0.24
866	0.15
867	0.12
868	0.1
869	0.11
870	0.12
871	0.1
872	0.11
873	0.1
874	0.12
875	0.14
876	0.15
877	0.18
878	0.2
879	0.2
880	0.21
881	0.22
882	0.21
883	0.2
884	0.2
885	0.17
886	0.17
887	0.16
888	0.15
889	0.16
890	0.15
891	0.15
892	0.15
893	0.19
894	0.17
895	0.16
896	0.16
897	0.14
898	0.13
899	0.19
900	0.18
901	0.14
902	0.14
903	0.14
904	0.15
905	0.15
906	0.16
907	0.1
908	0.09
909	0.09
910	0.09
911	0.08
912	0.07
913	0.07
914	0.05
915	0.05
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.08
924	0.07
925	0.07
926	0.07
927	0.08
928	0.08
929	0.12
930	0.17
931	0.2
932	0.21
933	0.21
934	0.22
935	0.24
936	0.3
937	0.25
938	0.26
939	0.26
940	0.29
941	0.29
942	0.29
943	0.26
944	0.2
945	0.22
946	0.18
947	0.14
948	0.11
949	0.11
950	0.11
951	0.11
952	0.11
953	0.11
954	0.11
955	0.14
956	0.17
957	0.19
958	0.21
959	0.22
960	0.23
961	0.22
962	0.22
963	0.2
964	0.18
965	0.14
966	0.12
967	0.13
968	0.11
969	0.11
970	0.09
971	0.09
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.06
976	0.07
977	0.09
978	0.12
979	0.13
980	0.13
981	0.13
982	0.12
983	0.12
984	0.11
985	0.1
986	0.08
987	0.06
988	0.05
989	0.05
990	0.05
991	0.04
992	0.04
993	0.04
994	0.04
995	0.06
996	0.06
997	0.07
998	0.1
999	0.11
1000	0.12
1001	0.16
1002	0.19
1003	0.18
1004	0.22
1005	0.29
1006	0.27
1007	0.28
1008	0.33
1009	0.29
1010	0.27
1011	0.34
1012	0.38
1013	0.38
1014	0.42
1015	0.46
1016	0.44
1017	0.46
1018	0.45
1019	0.37
1020	0.31
1021	0.25
1022	0.19
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.13
1026	0.13
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.13
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.1
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.1
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.06
1041	0.05
1042	0.04
1043	0.05
1044	0.05
1045	0.06
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.12
1050	0.13
1051	0.13
1052	0.12
1053	0.14
1054	0.12
1055	0.14
1056	0.15
1057	0.17
1058	0.18
1059	0.17
1060	0.17
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.13
1064	0.12
1065	0.07
1066	0.05
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.05
1070	0.05
1071	0.05
1072	0.05
1073	0.04
1074	0.05
1075	0.04
1076	0.05
1077	0.06
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.07
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.1
1084	0.15
1085	0.16
1086	0.24
1087	0.26
1088	0.27
1089	0.3
1090	0.34
1091	0.36
1092	0.34
1093	0.35
1094	0.31
1095	0.37
1096	0.42
1097	0.38
1098	0.37
1099	0.35
1100	0.32
1101	0.3
1102	0.26
1103	0.23
1104	0.17
1105	0.16
1106	0.14
1107	0.14
1108	0.14
1109	0.14
1110	0.14
1111	0.1
1112	0.09
1113	0.09
1114	0.1
1115	0.08
1116	0.08
1117	0.09
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.08
1121	0.07
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.05
1125	0.07
1126	0.08
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.12
1130	0.15
1131	0.15
1132	0.17
1133	0.16
1134	0.22
1135	0.24
1136	0.25
1137	0.24
1138	0.22
1139	0.22
1140	0.21
1141	0.19
1142	0.14
1143	0.1
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.1
1149	0.1
1150	0.09
1151	0.08
1152	0.09
1153	0.09
1154	0.11
1155	0.12
1156	0.16
1157	0.2
1158	0.22
1159	0.22
1160	0.22
1161	0.22
1162	0.2
1163	0.2
1164	0.17
1165	0.14
1166	0.11
1167	0.11
1168	0.09
1169	0.15
1170	0.16
1171	0.17
1172	0.18
1173	0.21
1174	0.24
1175	0.27
1176	0.33
1177	0.36
1178	0.4
1179	0.48
1180	0.54
1181	0.58
1182	0.6
1183	0.61
1184	0.58
1185	0.51
1186	0.47
1187	0.39
1188	0.34
1189	0.27
1190	0.23
1191	0.18
1192	0.16
1193	0.14
1194	0.11
1195	0.11
1196	0.07
1197	0.08
1198	0.07
1199	0.07
1200	0.07
1201	0.07
1202	0.07
1203	0.07
1204	0.07
1205	0.06
1206	0.08
1207	0.08
1208	0.1
1209	0.11
1210	0.13
1211	0.12
1212	0.14
1213	0.14
1214	0.15
1215	0.16
1216	0.15
1217	0.19
1218	0.19
1219	0.19
1220	0.17
1221	0.17
1222	0.16
1223	0.15
1224	0.16
1225	0.16
1226	0.15
1227	0.19
1228	0.19
1229	0.2
1230	0.2
1231	0.19
1232	0.19
1233	0.15

A0A165HNK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer