Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JGI9

Protein Details
Accession J5JGI9    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
537-556RDGKDAKEKEKQRKLKGKGIBasic
748-769GMQQKLMARKHQMRKKKAESRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
537-556RDGKDAKEKEKQRKLKGKGI
667-769RVRGEGGGRGGRGGRGGNRGGRGGPDSRDLGDDRGRDGARGRGGARGRGGDRGRGGGRDRRDRKPLMDKFKGDGRDTGGKEGMQQKLMARKHQMRKKKAESRG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSVAEESKKRLRPEIEEALAAMPDSETVAAPAPKKARTEERRSLFVRSLPPNVTNESLAEFFSEYFPVKHATVVIDQQTKESRGFGFVTLADADDAKQAQIVFDKKRWEDRTIRVEVAEPRQRKEATEGAQPRQKPGKPEFEPTPKLIVRNLPWSIRNSEQLGHLFRSYGKVKFADLPKNKGKLKGFGFVTLRGKKNAEKALEGINGKEIDGRTLAVDWAVDKDTWEQRQAGEGKEGESGDDQTSSEEDSDAEDDDDDDDDDDEDLNQDKEEGQLNTDLENFMKNHMQNIEDEDEDEDEDGEEETKRKEERNNSSDNSCTIFVRNLPFTTNDEHLKSFFSSFGNVRYARVVMDKATDRPAGTAFVCFYQEEDAKTCIKGAPRRQQPAASGKKSILKDDNLDPTGKYTLDGRLLSIAQAVNRAEASNLAESSLANRREKDKRRLYLLAEGSIGTNSPIYNLLSLPEIRMRQASAVQRKKLVQGNPTLHISLTRIALRNIPKNIGSKELKELARKAVVGFAQDVKEGIREPLSKEENARDGKDAKEKEKQRKLKGKGIVRQAKIVFESTQGSKVSEESGAGKSRGYGFIEYVSHHWALMGLRYLNGYQMDDTEEGKKKRLVAEFAIENAQVVQRRRINEEKSRQTREDATKGKPRFEKDNDEEEPNGNRVRGEGGGRGGRGGRGGNRGGRGGPDSRDLGDDRGRDGARGRGGARGRGGDRGRGGGRDRRDRKPLMDKFKGDGRDTGGKEGMQQKLMARKHQMRKKKAESRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.52
4 0.5
5 0.42
6 0.36
7 0.29
8 0.2
9 0.1
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.07
15 0.11
16 0.15
17 0.16
18 0.22
19 0.26
20 0.3
21 0.33
22 0.39
23 0.46
24 0.52
25 0.61
26 0.65
27 0.66
28 0.7
29 0.7
30 0.69
31 0.62
32 0.58
33 0.57
34 0.52
35 0.52
36 0.48
37 0.49
38 0.46
39 0.46
40 0.42
41 0.34
42 0.3
43 0.27
44 0.24
45 0.2
46 0.19
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.2
60 0.24
61 0.3
62 0.31
63 0.31
64 0.34
65 0.38
66 0.37
67 0.34
68 0.31
69 0.25
70 0.23
71 0.25
72 0.21
73 0.19
74 0.17
75 0.19
76 0.17
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.09
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.17
88 0.22
89 0.25
90 0.29
91 0.36
92 0.38
93 0.48
94 0.52
95 0.53
96 0.55
97 0.59
98 0.64
99 0.62
100 0.59
101 0.5
102 0.5
103 0.49
104 0.5
105 0.5
106 0.44
107 0.42
108 0.47
109 0.47
110 0.44
111 0.44
112 0.42
113 0.37
114 0.44
115 0.48
116 0.48
117 0.53
118 0.52
119 0.53
120 0.55
121 0.54
122 0.51
123 0.52
124 0.56
125 0.54
126 0.6
127 0.62
128 0.62
129 0.64
130 0.59
131 0.6
132 0.51
133 0.49
134 0.45
135 0.43
136 0.37
137 0.41
138 0.42
139 0.37
140 0.39
141 0.41
142 0.43
143 0.39
144 0.4
145 0.34
146 0.32
147 0.32
148 0.34
149 0.33
150 0.31
151 0.28
152 0.24
153 0.23
154 0.27
155 0.27
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.25
160 0.31
161 0.37
162 0.41
163 0.44
164 0.5
165 0.53
166 0.61
167 0.61
168 0.61
169 0.58
170 0.56
171 0.54
172 0.54
173 0.47
174 0.46
175 0.45
176 0.44
177 0.49
178 0.48
179 0.47
180 0.42
181 0.43
182 0.4
183 0.46
184 0.46
185 0.4
186 0.35
187 0.34
188 0.37
189 0.39
190 0.36
191 0.29
192 0.26
193 0.24
194 0.22
195 0.23
196 0.17
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.13
211 0.19
212 0.21
213 0.23
214 0.22
215 0.2
216 0.27
217 0.29
218 0.26
219 0.24
220 0.23
221 0.22
222 0.23
223 0.23
224 0.17
225 0.15
226 0.15
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.1
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.2
277 0.2
278 0.15
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.1
293 0.11
294 0.14
295 0.21
296 0.29
297 0.39
298 0.43
299 0.49
300 0.49
301 0.49
302 0.48
303 0.42
304 0.36
305 0.26
306 0.21
307 0.16
308 0.14
309 0.14
310 0.16
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.19
322 0.19
323 0.18
324 0.15
325 0.13
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.15
337 0.13
338 0.09
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.16
365 0.21
366 0.28
367 0.36
368 0.43
369 0.48
370 0.49
371 0.49
372 0.49
373 0.53
374 0.53
375 0.45
376 0.39
377 0.35
378 0.4
379 0.39
380 0.38
381 0.31
382 0.24
383 0.25
384 0.27
385 0.31
386 0.26
387 0.26
388 0.22
389 0.2
390 0.2
391 0.17
392 0.14
393 0.1
394 0.11
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.07
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.1
418 0.16
419 0.18
420 0.18
421 0.19
422 0.25
423 0.35
424 0.44
425 0.51
426 0.54
427 0.55
428 0.6
429 0.63
430 0.6
431 0.58
432 0.52
433 0.43
434 0.33
435 0.29
436 0.23
437 0.19
438 0.16
439 0.08
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.17
458 0.24
459 0.31
460 0.37
461 0.39
462 0.42
463 0.43
464 0.47
465 0.48
466 0.44
467 0.39
468 0.4
469 0.42
470 0.41
471 0.42
472 0.37
473 0.3
474 0.27
475 0.23
476 0.17
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.21
482 0.25
483 0.3
484 0.3
485 0.3
486 0.3
487 0.33
488 0.34
489 0.36
490 0.34
491 0.29
492 0.32
493 0.37
494 0.37
495 0.36
496 0.37
497 0.33
498 0.33
499 0.31
500 0.27
501 0.23
502 0.21
503 0.19
504 0.18
505 0.17
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.12
514 0.13
515 0.15
516 0.23
517 0.25
518 0.26
519 0.27
520 0.3
521 0.33
522 0.35
523 0.34
524 0.29
525 0.29
526 0.31
527 0.37
528 0.37
529 0.35
530 0.41
531 0.49
532 0.56
533 0.64
534 0.7
535 0.72
536 0.79
537 0.8
538 0.8
539 0.8
540 0.78
541 0.75
542 0.77
543 0.75
544 0.66
545 0.66
546 0.58
547 0.52
548 0.44
549 0.39
550 0.29
551 0.22
552 0.24
553 0.19
554 0.22
555 0.2
556 0.19
557 0.17
558 0.17
559 0.17
560 0.14
561 0.13
562 0.12
563 0.16
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.17
568 0.19
569 0.21
570 0.2
571 0.17
572 0.15
573 0.18
574 0.19
575 0.19
576 0.19
577 0.19
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.14
582 0.13
583 0.14
584 0.15
585 0.12
586 0.12
587 0.14
588 0.14
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.11
593 0.11
594 0.14
595 0.14
596 0.15
597 0.2
598 0.26
599 0.27
600 0.3
601 0.32
602 0.32
603 0.37
604 0.41
605 0.39
606 0.35
607 0.4
608 0.38
609 0.38
610 0.37
611 0.3
612 0.24
613 0.2
614 0.19
615 0.17
616 0.18
617 0.24
618 0.27
619 0.3
620 0.37
621 0.44
622 0.5
623 0.56
624 0.64
625 0.67
626 0.72
627 0.77
628 0.72
629 0.68
630 0.69
631 0.67
632 0.66
633 0.61
634 0.59
635 0.62
636 0.62
637 0.66
638 0.63
639 0.6
640 0.6
641 0.61
642 0.64
643 0.6
644 0.67
645 0.62
646 0.61
647 0.57
648 0.5
649 0.47
650 0.4
651 0.36
652 0.27
653 0.23
654 0.2
655 0.21
656 0.2
657 0.19
658 0.19
659 0.23
660 0.26
661 0.26
662 0.27
663 0.25
664 0.23
665 0.22
666 0.22
667 0.21
668 0.24
669 0.28
670 0.31
671 0.33
672 0.34
673 0.33
674 0.32
675 0.32
676 0.3
677 0.28
678 0.28
679 0.27
680 0.26
681 0.29
682 0.27
683 0.28
684 0.3
685 0.28
686 0.26
687 0.31
688 0.3
689 0.28
690 0.29
691 0.31
692 0.29
693 0.32
694 0.31
695 0.32
696 0.35
697 0.38
698 0.39
699 0.39
700 0.36
701 0.41
702 0.42
703 0.41
704 0.4
705 0.42
706 0.41
707 0.39
708 0.43
709 0.42
710 0.49
711 0.55
712 0.59
713 0.61
714 0.68
715 0.69
716 0.72
717 0.75
718 0.76
719 0.75
720 0.78
721 0.73
722 0.69
723 0.71
724 0.68
725 0.6
726 0.53
727 0.5
728 0.49
729 0.48
730 0.48
731 0.43
732 0.37
733 0.41
734 0.44
735 0.42
736 0.34
737 0.34
738 0.34
739 0.41
740 0.46
741 0.47
742 0.49
743 0.55
744 0.64
745 0.72
746 0.78
747 0.79
748 0.85
749 0.89