FuNGI

A0A165D392

Protein Details

Accession

A0A165D392

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
455-474	AIKAERQLRRTDKKAMKEQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPTKSIFQEPGVRHFQLIHRSQRDSLIHDPEVSQHVLKAFERGNVVKGKSRAELEQILSPSDLTHDTERKNIGEAALYSVYYDDTVYNYMQHLCPVGMQEDGFDSILIEAPSKAKEKAKEPITLIDLPPEVLPSTSEVPCNYEFNPELDPHLCQVLQALKDDAFVDDDLDDDFFRELVADGKLASDGHLEFEFRDEGIEDGHDEADARDEANSDLDDAERTGWEARFTHAGSDMDASSKGGDTIGALPQISVIGGKKRQKGTSDASGYSMSSLSMFRNEGLTLIDEQFDNIQREYNSEENEETHTLFDDSDEASELITSREDFDAMMNEFLENYEIFGGKMSLGGVRLREENEEDEEDDILMPHDIDEKKDQWDCETILSTYSNLENHPRLIRARQDRPVPKIPSPKNSKYAPRCRTDCSDSLESDSDDDIQSQRVTISQPKNESKEDKQTQKQAIKAERQLRRTDKKAMKEQFSTEVKRQNRVLLNKKNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.42
3	0.43
4	0.48
5	0.51
6	0.5
7	0.54
8	0.55
9	0.59
10	0.56
11	0.53
12	0.52
13	0.5
14	0.45
15	0.42
16	0.41
17	0.36
18	0.37
19	0.33
20	0.26
21	0.2
22	0.2
23	0.23
24	0.23
25	0.25
26	0.23
27	0.24
28	0.29
29	0.29
30	0.32
31	0.35
32	0.37
33	0.39
34	0.4
35	0.41
36	0.39
37	0.41
38	0.38
39	0.37
40	0.4
41	0.35
42	0.37
43	0.35
44	0.32
45	0.29
46	0.26
47	0.21
48	0.18
49	0.17
50	0.14
51	0.2
52	0.24
53	0.26
54	0.31
55	0.34
56	0.33
57	0.34
58	0.31
59	0.26
60	0.23
61	0.22
62	0.22
63	0.2
64	0.19
65	0.16
66	0.15
67	0.15
68	0.12
69	0.12
70	0.07
71	0.07
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.12
76	0.14
77	0.14
78	0.14
79	0.14
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.11
85	0.11
86	0.1
87	0.1
88	0.12
89	0.11
90	0.09
91	0.08
92	0.07
93	0.1
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.09
98	0.12
99	0.14
100	0.18
101	0.21
102	0.26
103	0.3
104	0.38
105	0.42
106	0.45
107	0.44
108	0.46
109	0.45
110	0.43
111	0.38
112	0.33
113	0.28
114	0.23
115	0.21
116	0.17
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.14
122	0.14
123	0.15
124	0.15
125	0.18
126	0.2
127	0.22
128	0.19
129	0.2
130	0.2
131	0.2
132	0.22
133	0.19
134	0.2
135	0.19
136	0.19
137	0.15
138	0.16
139	0.14
140	0.11
141	0.13
142	0.15
143	0.15
144	0.15
145	0.16
146	0.14
147	0.15
148	0.15
149	0.13
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.1
179	0.1
180	0.08
181	0.08
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.05
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.07
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.13
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.08
241	0.14
242	0.19
243	0.25
244	0.29
245	0.32
246	0.33
247	0.38
248	0.39
249	0.42
250	0.41
251	0.36
252	0.34
253	0.32
254	0.29
255	0.24
256	0.19
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.13
279	0.12
280	0.14
281	0.17
282	0.19
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.19
288	0.19
289	0.15
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.09
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.09
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.15
337	0.16
338	0.17
339	0.19
340	0.2
341	0.18
342	0.17
343	0.17
344	0.15
345	0.13
346	0.11
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.11
352	0.11
353	0.14
354	0.19
355	0.2
356	0.25
357	0.28
358	0.28
359	0.25
360	0.28
361	0.26
362	0.24
363	0.25
364	0.2
365	0.19
366	0.19
367	0.17
368	0.14
369	0.15
370	0.14
371	0.13
372	0.18
373	0.19
374	0.22
375	0.24
376	0.25
377	0.27
378	0.31
379	0.39
380	0.43
381	0.49
382	0.53
383	0.61
384	0.65
385	0.7
386	0.74
387	0.7
388	0.68
389	0.71
390	0.7
391	0.71
392	0.73
393	0.72
394	0.7
395	0.71
396	0.74
397	0.74
398	0.78
399	0.76
400	0.75
401	0.72
402	0.71
403	0.72
404	0.69
405	0.63
406	0.6
407	0.57
408	0.49
409	0.49
410	0.45
411	0.38
412	0.32
413	0.27
414	0.21
415	0.16
416	0.17
417	0.13
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.15
424	0.23
425	0.31
426	0.35
427	0.44
428	0.51
429	0.56
430	0.61
431	0.65
432	0.62
433	0.65
434	0.68
435	0.69
436	0.7
437	0.74
438	0.77
439	0.76
440	0.74
441	0.72
442	0.71
443	0.7
444	0.71
445	0.72
446	0.7
447	0.7
448	0.75
449	0.76
450	0.76
451	0.73
452	0.75
453	0.73
454	0.75
455	0.8
456	0.8
457	0.77
458	0.73
459	0.71
460	0.69
461	0.69
462	0.66
463	0.62
464	0.63
465	0.59
466	0.61
467	0.6
468	0.6
469	0.61
470	0.64
471	0.68

A0A165D392

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer