Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165HNC8

Protein Details
Accession A0A165HNC8    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-85NASLQRESPKLDKKRKSREAAHAPVDKREKSKRRKTRKVADEDSQENHydrophilic
483-506LDETRLKFAKRKLRVQRCKTVPGSHydrophilic
582-628EKGVKMRAGKERMRERRRPTERKDKASGKEKSKSKGRIRSGKSIARMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-76PKLDKKRKSREAAHAPVDKREKSKRRKTRK
254-272KGKGKATFGKEKEGRQHDR
553-632PKEERKKVKAADAERVARRLAKKQAKLLAEKGVKMRAGKERMRERRRPTERKDKASGKEKSKSKGRIRSGKSIARMNTKK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLSSLLLHKGKDAAIDKGLDNIFQSTTGLSTSASSQPNASLQRESPKLDKKRKSREAAHAPVDKREKSKRRKTRKVADEDSQENPPEDQQEEHSSTSKPSTSAASKARRVRPETAGSDEDSDDSEKPAFKSTSNPAQQHESSDGDSDDEGHSSELVHESLAKGSRTRSLNGRRAKTKYVPLEETSEQRNARTIFVGNVPVDVVKSRPLQKQFKRHILSFVSSAKIESLRFRSVAFQSPTAELPTLDDNTKGEKGKGKATFGKEKEGRQHDRERAASWRVARGQEDAEEERSKKTFLTPKEKKRIAFIKHEIHSAADAVNAFVVFAHPPPPVADGKHAVTSHNAIIDPYEAARLAVERGDGSVFMAHTIRVDRVGKGDEVGNSAVVADPKATVFVGNLDFASNEEDLRAFFEALAMEERGPPEERENEESEDEEGDEDEGNAVKPRTWVKRVRIIRDKDTQLGKGFAYVQFADRECVDEILALDETRLKFAKRKLRVQRCKTVPGSVKITPKHSRSAVSSSSSAHLKHPSVPFTPSSLPKGDPSLGTKISHLPKEERKKVKAADAERVARRLAKKQAKLLAEKGVKMRAGKERMRERRRPTERKDKASGKEKSKSKGRIRSGKSIARMNTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.29
4 0.28
5 0.32
6 0.32
7 0.25
8 0.23
9 0.21
10 0.18
11 0.16
12 0.17
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.12
20 0.19
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.22
25 0.28
26 0.32
27 0.31
28 0.29
29 0.3
30 0.38
31 0.41
32 0.44
33 0.46
34 0.51
35 0.59
36 0.66
37 0.72
38 0.75
39 0.82
40 0.87
41 0.88
42 0.87
43 0.88
44 0.88
45 0.87
46 0.85
47 0.82
48 0.74
49 0.73
50 0.71
51 0.64
52 0.61
53 0.63
54 0.65
55 0.67
56 0.77
57 0.79
58 0.83
59 0.9
60 0.93
61 0.94
62 0.94
63 0.93
64 0.89
65 0.87
66 0.83
67 0.76
68 0.68
69 0.62
70 0.52
71 0.43
72 0.36
73 0.29
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.26
79 0.28
80 0.29
81 0.3
82 0.28
83 0.29
84 0.31
85 0.28
86 0.21
87 0.19
88 0.23
89 0.24
90 0.3
91 0.37
92 0.42
93 0.48
94 0.57
95 0.63
96 0.66
97 0.68
98 0.67
99 0.65
100 0.65
101 0.61
102 0.58
103 0.52
104 0.45
105 0.42
106 0.36
107 0.3
108 0.23
109 0.21
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.25
119 0.3
120 0.39
121 0.44
122 0.46
123 0.43
124 0.49
125 0.49
126 0.46
127 0.42
128 0.34
129 0.27
130 0.26
131 0.24
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.11
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.33
156 0.4
157 0.47
158 0.55
159 0.61
160 0.62
161 0.64
162 0.68
163 0.65
164 0.64
165 0.63
166 0.61
167 0.58
168 0.52
169 0.53
170 0.48
171 0.45
172 0.4
173 0.37
174 0.31
175 0.28
176 0.31
177 0.26
178 0.25
179 0.23
180 0.21
181 0.17
182 0.19
183 0.22
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.15
193 0.2
194 0.26
195 0.35
196 0.45
197 0.52
198 0.62
199 0.67
200 0.73
201 0.72
202 0.67
203 0.65
204 0.58
205 0.52
206 0.46
207 0.39
208 0.31
209 0.26
210 0.25
211 0.19
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.23
220 0.23
221 0.3
222 0.28
223 0.25
224 0.25
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.21
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.14
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.2
241 0.22
242 0.29
243 0.31
244 0.32
245 0.35
246 0.4
247 0.48
248 0.43
249 0.51
250 0.47
251 0.47
252 0.52
253 0.54
254 0.54
255 0.51
256 0.58
257 0.54
258 0.56
259 0.54
260 0.47
261 0.44
262 0.41
263 0.38
264 0.31
265 0.3
266 0.27
267 0.27
268 0.26
269 0.23
270 0.21
271 0.19
272 0.21
273 0.18
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.14
281 0.19
282 0.22
283 0.27
284 0.37
285 0.45
286 0.54
287 0.64
288 0.68
289 0.62
290 0.64
291 0.65
292 0.59
293 0.58
294 0.55
295 0.53
296 0.51
297 0.51
298 0.44
299 0.36
300 0.31
301 0.22
302 0.15
303 0.08
304 0.07
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.13
321 0.14
322 0.15
323 0.19
324 0.18
325 0.16
326 0.16
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.11
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.14
410 0.19
411 0.22
412 0.25
413 0.28
414 0.28
415 0.27
416 0.27
417 0.24
418 0.2
419 0.17
420 0.12
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.12
432 0.18
433 0.25
434 0.32
435 0.4
436 0.44
437 0.54
438 0.6
439 0.67
440 0.7
441 0.7
442 0.69
443 0.7
444 0.67
445 0.63
446 0.59
447 0.53
448 0.45
449 0.41
450 0.34
451 0.27
452 0.26
453 0.2
454 0.2
455 0.17
456 0.16
457 0.18
458 0.18
459 0.18
460 0.16
461 0.17
462 0.15
463 0.15
464 0.13
465 0.11
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.09
470 0.08
471 0.12
472 0.12
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.2
477 0.28
478 0.38
479 0.43
480 0.53
481 0.61
482 0.72
483 0.81
484 0.84
485 0.87
486 0.83
487 0.84
488 0.76
489 0.74
490 0.7
491 0.65
492 0.62
493 0.58
494 0.59
495 0.53
496 0.58
497 0.56
498 0.52
499 0.53
500 0.49
501 0.47
502 0.45
503 0.48
504 0.44
505 0.41
506 0.39
507 0.34
508 0.35
509 0.34
510 0.3
511 0.27
512 0.29
513 0.26
514 0.32
515 0.34
516 0.36
517 0.35
518 0.37
519 0.35
520 0.34
521 0.38
522 0.35
523 0.35
524 0.34
525 0.33
526 0.32
527 0.35
528 0.32
529 0.29
530 0.3
531 0.32
532 0.31
533 0.31
534 0.3
535 0.34
536 0.38
537 0.4
538 0.39
539 0.41
540 0.49
541 0.59
542 0.67
543 0.68
544 0.67
545 0.71
546 0.71
547 0.72
548 0.71
549 0.65
550 0.65
551 0.64
552 0.67
553 0.62
554 0.6
555 0.53
556 0.5
557 0.49
558 0.47
559 0.5
560 0.51
561 0.54
562 0.6
563 0.66
564 0.67
565 0.69
566 0.65
567 0.64
568 0.59
569 0.56
570 0.52
571 0.5
572 0.46
573 0.42
574 0.44
575 0.44
576 0.48
577 0.5
578 0.56
579 0.62
580 0.7
581 0.78
582 0.81
583 0.81
584 0.83
585 0.89
586 0.89
587 0.88
588 0.88
589 0.89
590 0.88
591 0.88
592 0.86
593 0.85
594 0.84
595 0.84
596 0.82
597 0.81
598 0.79
599 0.78
600 0.79
601 0.8
602 0.8
603 0.81
604 0.82
605 0.84
606 0.84
607 0.86
608 0.85
609 0.82
610 0.78
611 0.76
612 0.72