Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A165DJH9

Protein Details
Accession A0A165DJH9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-332GSGRRRKTSKLTKSYSKRTERKHRRVKRVEESDSEBasic
366-395TVVHRVRRTRPVKTKTVRKIRRTKDESSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-52K
292-325RTKKYSGSGRRRKTSKLTKSYSKRTERKHRRVKR
373-387RTRPVKTKTVRKIRR
483-488KRSPRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MATHARYNPALGPPVHPGTCTDAIWNEYQQALGMYAQYQGAIPKQPVAREKKMGKIKEFRGDKREYASFLRNVEQYLLANEGVYSDDFSKIAFVLSQIDSSFTAGKWAESWEANQMAKHSNLGTYQDFKTTLTEKYGGVATKDQAWQVLLEGKYKQDKQTVDEYIGNLDILYRYAEIDDEYAKLIHFKRGLNEKLAEKVFITENLPTTYAAACKATRKVTNLQDIHSGKTNIFKFISGSSGSGRRMEKDLTQWTLIGSPQKPIRNVLPEYDPAPDRSGKTTSYAKTKTSNSRTKKYSGSGRRRKTSKLTKSYSKRTERKHRRVKRVEESDSEDNLEESEQEESESSSSEESESESSESEEVSEQETVVHRVRRTRPVKTKTVRKIRRTKDESSDSEEESYVIQRFILKEELARIQWEDALKMRGDRIKKRNMTMPHLDDLLEFGDNSDKYEYARRYPPPMEKDDPESFEIGCTLGSCGIQIKKRSPRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.36
3 0.33
4 0.3
5 0.33
6 0.35
7 0.32
8 0.28
9 0.25
10 0.27
11 0.29
12 0.28
13 0.22
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.13
28 0.16
29 0.17
30 0.22
31 0.24
32 0.3
33 0.38
34 0.45
35 0.49
36 0.55
37 0.59
38 0.62
39 0.69
40 0.7
41 0.71
42 0.71
43 0.71
44 0.72
45 0.76
46 0.74
47 0.72
48 0.71
49 0.65
50 0.62
51 0.58
52 0.52
53 0.49
54 0.48
55 0.44
56 0.41
57 0.42
58 0.37
59 0.34
60 0.32
61 0.28
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.14
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.1
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.22
104 0.21
105 0.22
106 0.17
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.21
121 0.18
122 0.19
123 0.21
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.16
128 0.18
129 0.2
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.13
135 0.18
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.19
140 0.25
141 0.27
142 0.3
143 0.3
144 0.3
145 0.32
146 0.39
147 0.37
148 0.34
149 0.34
150 0.31
151 0.26
152 0.24
153 0.2
154 0.12
155 0.11
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.12
172 0.15
173 0.18
174 0.18
175 0.23
176 0.31
177 0.34
178 0.34
179 0.36
180 0.33
181 0.35
182 0.35
183 0.3
184 0.21
185 0.21
186 0.18
187 0.16
188 0.15
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.16
202 0.19
203 0.21
204 0.24
205 0.3
206 0.34
207 0.42
208 0.41
209 0.38
210 0.43
211 0.41
212 0.39
213 0.35
214 0.3
215 0.21
216 0.27
217 0.26
218 0.2
219 0.2
220 0.18
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.11
225 0.12
226 0.11
227 0.14
228 0.14
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.2
236 0.24
237 0.22
238 0.22
239 0.21
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.17
244 0.14
245 0.15
246 0.2
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.27
251 0.28
252 0.29
253 0.28
254 0.26
255 0.24
256 0.25
257 0.25
258 0.22
259 0.17
260 0.19
261 0.18
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.17
266 0.2
267 0.25
268 0.25
269 0.32
270 0.33
271 0.32
272 0.36
273 0.41
274 0.47
275 0.5
276 0.57
277 0.55
278 0.61
279 0.62
280 0.61
281 0.59
282 0.55
283 0.56
284 0.57
285 0.62
286 0.64
287 0.69
288 0.73
289 0.73
290 0.72
291 0.72
292 0.72
293 0.72
294 0.72
295 0.7
296 0.72
297 0.77
298 0.82
299 0.82
300 0.81
301 0.78
302 0.78
303 0.83
304 0.85
305 0.87
306 0.88
307 0.89
308 0.89
309 0.92
310 0.91
311 0.91
312 0.89
313 0.83
314 0.76
315 0.73
316 0.66
317 0.57
318 0.49
319 0.38
320 0.28
321 0.23
322 0.19
323 0.11
324 0.07
325 0.08
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.18
355 0.22
356 0.22
357 0.3
358 0.37
359 0.45
360 0.51
361 0.58
362 0.64
363 0.67
364 0.76
365 0.77
366 0.81
367 0.82
368 0.86
369 0.86
370 0.86
371 0.89
372 0.88
373 0.89
374 0.85
375 0.82
376 0.8
377 0.79
378 0.73
379 0.71
380 0.64
381 0.54
382 0.49
383 0.42
384 0.33
385 0.25
386 0.24
387 0.16
388 0.13
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.16
393 0.19
394 0.16
395 0.17
396 0.21
397 0.25
398 0.23
399 0.24
400 0.22
401 0.2
402 0.22
403 0.22
404 0.2
405 0.18
406 0.2
407 0.2
408 0.2
409 0.24
410 0.27
411 0.34
412 0.42
413 0.48
414 0.56
415 0.62
416 0.66
417 0.69
418 0.71
419 0.71
420 0.7
421 0.66
422 0.59
423 0.53
424 0.48
425 0.4
426 0.34
427 0.27
428 0.18
429 0.12
430 0.1
431 0.15
432 0.14
433 0.17
434 0.17
435 0.15
436 0.17
437 0.26
438 0.29
439 0.3
440 0.39
441 0.41
442 0.47
443 0.54
444 0.61
445 0.6
446 0.65
447 0.64
448 0.6
449 0.64
450 0.63
451 0.59
452 0.52
453 0.46
454 0.38
455 0.32
456 0.28
457 0.21
458 0.14
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.15
465 0.21
466 0.27
467 0.33
468 0.41