Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4UV90

Protein Details
Accession J4UV90    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-283TATGGKKLRERERKVKQTIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-151REGARGGAGARGRGGRGGRRPR
271-275RERER
292-353RPRGGARGGARGERGGRGGARGGDRGGARGGDRGDRGGDRGGDRGGRGGERGARGGARGGRP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, cyto 9, nucl 8, mito 6, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSSAITSQKTPIQISIEPVLPGQNLSTTSKRSEMAFKALGGAGASSLDRNRFAYFGNDEDGDAKPNAPVKTVDKASTHTTKRNVEPQAPVRAAGATGNRRGGPGGNEGAFRDRNAGSSRNQARSTDEAPREGARGGAGARGRGGRGGRRPREQDDRHSRQNRDTTAKQTAQGWGANEGNAELKDEQAAEAIAEGDKNAAADAEVEPAEPEDKSVSYSDYLAQQAEKKLALGGHNVREANEGSKLDKKWAGAKALENDEEEYVTATGGKKLRERERKVKQTIDFDPRFVESERPRGGARGGARGERGGRGGARGGDRGGARGGDRGDRGGDRGGDRGGRGGERGARGGARGGRPAAANINTKDEAAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.32
4 0.28
5 0.27
6 0.26
7 0.21
8 0.19
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.19
13 0.23
14 0.25
15 0.27
16 0.3
17 0.31
18 0.31
19 0.36
20 0.35
21 0.38
22 0.36
23 0.33
24 0.33
25 0.32
26 0.29
27 0.22
28 0.18
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.1
34 0.12
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.21
41 0.22
42 0.22
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.19
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.22
56 0.23
57 0.3
58 0.32
59 0.34
60 0.3
61 0.33
62 0.38
63 0.43
64 0.44
65 0.43
66 0.47
67 0.49
68 0.53
69 0.58
70 0.56
71 0.52
72 0.56
73 0.55
74 0.57
75 0.52
76 0.47
77 0.39
78 0.34
79 0.3
80 0.24
81 0.24
82 0.2
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.16
100 0.18
101 0.2
102 0.22
103 0.2
104 0.3
105 0.36
106 0.38
107 0.39
108 0.37
109 0.38
110 0.4
111 0.41
112 0.4
113 0.35
114 0.31
115 0.31
116 0.31
117 0.28
118 0.23
119 0.2
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.15
131 0.17
132 0.26
133 0.36
134 0.41
135 0.47
136 0.52
137 0.55
138 0.63
139 0.62
140 0.63
141 0.64
142 0.65
143 0.68
144 0.71
145 0.67
146 0.63
147 0.66
148 0.6
149 0.56
150 0.52
151 0.47
152 0.47
153 0.47
154 0.41
155 0.36
156 0.33
157 0.28
158 0.26
159 0.21
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.19
219 0.2
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.23
224 0.23
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.15
229 0.21
230 0.21
231 0.23
232 0.24
233 0.24
234 0.27
235 0.3
236 0.32
237 0.28
238 0.32
239 0.34
240 0.36
241 0.36
242 0.3
243 0.27
244 0.24
245 0.21
246 0.17
247 0.13
248 0.09
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.12
253 0.15
254 0.17
255 0.2
256 0.29
257 0.39
258 0.48
259 0.57
260 0.63
261 0.71
262 0.79
263 0.81
264 0.81
265 0.76
266 0.73
267 0.73
268 0.72
269 0.63
270 0.53
271 0.49
272 0.42
273 0.39
274 0.32
275 0.32
276 0.26
277 0.33
278 0.35
279 0.35
280 0.34
281 0.33
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.28
286 0.28
287 0.29
288 0.29
289 0.3
290 0.31
291 0.27
292 0.26
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.2
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.2
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.17
306 0.15
307 0.17
308 0.19
309 0.19
310 0.2
311 0.2
312 0.22
313 0.21
314 0.23
315 0.23
316 0.25
317 0.22
318 0.24
319 0.25
320 0.24
321 0.23
322 0.24
323 0.23
324 0.21
325 0.2
326 0.22
327 0.25
328 0.25
329 0.27
330 0.26
331 0.24
332 0.23
333 0.28
334 0.3
335 0.28
336 0.3
337 0.29
338 0.29
339 0.29
340 0.31
341 0.32
342 0.31
343 0.35
344 0.33
345 0.38
346 0.37
347 0.36
348 0.34
349 0.29
350 0.26
351 0.23