Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A165F8M1

Protein Details
Accession A0A165F8M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-255QLTTIKKPRRPAHRTNVQKRDWAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-547LGARAAAPQRGQRGGPAGRGGQRGGTPSRGAAPPPRG
Subcellular Location(s) cyto 15, nucl 9, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGSEQHEKVLERLLRPRPEDSAEILLELGLSGLPTREQVHREIEEKLLLPKERLPEHWLPTYQIHWDHEISVPSLLSLEPSPPPTTLAFVRAGLHGRVTGYKEVSNPRIPSGLTSTSLDRAPGPSGSFVRGKAGYVPFWPGGLEQSKKSELDVINDLQEESIGLRRVAPGLSRGLRLPGEEVEETLPEEELEPLSRPIKTDIEFLPNGEAYANEVTLSGTSEIDELLPTTRTQLTTIKKPRRPAHRTNVQKRDWAHVVNVNKEMTNFHELVPDMAHKYPFELDTFQKQAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAGKHMTRAIYTSPIKALSNQKYRDFKQTFSSSSIGILTGDVQINPEANCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNAKEFADWVGRTKKKDIYVISTSKRPVPLEHYLYAGRDFHKIVDANGNFLGEGYRAASEALRRKQDKEREAAGLAPVQRLGARAAAPQRGQRGGPAGRGGQRGGTPSRGAAPPPRGGSPRTFHQPDKNLYVHLMGNLKKKSLLPVVVFTLSKKRCEENASTLTNLDLCTAVEKSEIHVAIEKALSRLKGSDRRLPQIRRMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFARGLVKVLFATETFAMGVNMPAKCVVFSNIRKHDGRAFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVVIVANDTLPEQSTLNGMILGKPSNLQSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSSQKMLPDQMKKVIESEKVLSRLPELSCDVCFPDIEHFYDASYEIVDLNQTILSLAAKNSQWSRLMGTGRVVVLRDERFRWNMAVVLRNDRKTDETIILAMVDPETKAALLELERKEDASGQSPPPRWPPTPTSLVVDDATYYLWKVPLTSIAMMTASTIKVDADVILSQKRISSMNSAIQLLNAELEKWLQVDSIPEADWSKFRSLEFQEALRERDELVKELGGFQCTICSDFDDHYMQVHSRKSLIAHIEELKRAVSEQNMELIPDYEQRIGVLKDLKFIDENSTVLLKGRVACEINSANELVLTELILENTLANFEPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPIISPKLEEGRDAIIAIAERVSQIKDYHKVPGDDFRALKFGLMEVVYEWAKGMPFEQITDLTDVPEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEESQIKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.57
4 0.53
5 0.53
6 0.51
7 0.47
8 0.44
9 0.36
10 0.33
11 0.29
12 0.24
13 0.19
14 0.15
15 0.11
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.05
20 0.06
21 0.08
22 0.12
23 0.17
24 0.19
25 0.24
26 0.31
27 0.34
28 0.36
29 0.36
30 0.36
31 0.35
32 0.33
33 0.35
34 0.34
35 0.32
36 0.32
37 0.34
38 0.39
39 0.39
40 0.41
41 0.44
42 0.45
43 0.48
44 0.53
45 0.51
46 0.47
47 0.46
48 0.45
49 0.43
50 0.4
51 0.37
52 0.34
53 0.33
54 0.31
55 0.32
56 0.31
57 0.27
58 0.23
59 0.2
60 0.16
61 0.15
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.17
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.2
72 0.23
73 0.22
74 0.23
75 0.22
76 0.21
77 0.23
78 0.23
79 0.25
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.21
85 0.23
86 0.25
87 0.24
88 0.26
89 0.3
90 0.36
91 0.41
92 0.45
93 0.43
94 0.41
95 0.41
96 0.39
97 0.37
98 0.35
99 0.32
100 0.27
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.26
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.25
114 0.26
115 0.24
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.27
120 0.29
121 0.27
122 0.26
123 0.3
124 0.25
125 0.25
126 0.24
127 0.18
128 0.2
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.29
133 0.32
134 0.31
135 0.32
136 0.34
137 0.29
138 0.31
139 0.33
140 0.29
141 0.28
142 0.29
143 0.28
144 0.2
145 0.19
146 0.14
147 0.1
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.21
158 0.23
159 0.24
160 0.24
161 0.27
162 0.26
163 0.26
164 0.25
165 0.19
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.27
188 0.27
189 0.31
190 0.31
191 0.31
192 0.3
193 0.25
194 0.24
195 0.19
196 0.16
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.23
221 0.27
222 0.37
223 0.48
224 0.55
225 0.58
226 0.67
227 0.73
228 0.77
229 0.79
230 0.79
231 0.79
232 0.79
233 0.86
234 0.87
235 0.89
236 0.81
237 0.78
238 0.7
239 0.66
240 0.6
241 0.51
242 0.44
243 0.41
244 0.42
245 0.41
246 0.42
247 0.35
248 0.31
249 0.3
250 0.27
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.18
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.22
259 0.19
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.19
270 0.25
271 0.28
272 0.26
273 0.26
274 0.25
275 0.26
276 0.26
277 0.27
278 0.21
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.17
283 0.14
284 0.1
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.12
315 0.17
316 0.19
317 0.2
318 0.21
319 0.23
320 0.23
321 0.26
322 0.34
323 0.35
324 0.43
325 0.46
326 0.52
327 0.57
328 0.59
329 0.65
330 0.58
331 0.51
332 0.5
333 0.51
334 0.46
335 0.43
336 0.41
337 0.31
338 0.29
339 0.27
340 0.19
341 0.14
342 0.11
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.15
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.07
389 0.09
390 0.1
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.1
424 0.14
425 0.14
426 0.18
427 0.27
428 0.3
429 0.33
430 0.36
431 0.38
432 0.37
433 0.42
434 0.4
435 0.38
436 0.42
437 0.46
438 0.45
439 0.45
440 0.42
441 0.4
442 0.4
443 0.34
444 0.28
445 0.28
446 0.33
447 0.33
448 0.33
449 0.32
450 0.3
451 0.3
452 0.29
453 0.24
454 0.18
455 0.15
456 0.15
457 0.13
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.23
462 0.21
463 0.21
464 0.21
465 0.21
466 0.16
467 0.16
468 0.15
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.11
477 0.18
478 0.23
479 0.3
480 0.31
481 0.36
482 0.44
483 0.52
484 0.52
485 0.5
486 0.48
487 0.43
488 0.42
489 0.39
490 0.31
491 0.26
492 0.21
493 0.16
494 0.13
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.11
502 0.14
503 0.17
504 0.19
505 0.2
506 0.23
507 0.22
508 0.22
509 0.2
510 0.23
511 0.21
512 0.21
513 0.21
514 0.2
515 0.22
516 0.24
517 0.23
518 0.18
519 0.17
520 0.19
521 0.18
522 0.18
523 0.14
524 0.13
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.18
529 0.2
530 0.22
531 0.24
532 0.26
533 0.24
534 0.26
535 0.29
536 0.28
537 0.28
538 0.32
539 0.33
540 0.33
541 0.39
542 0.44
543 0.42
544 0.45
545 0.41
546 0.34
547 0.31
548 0.31
549 0.24
550 0.19
551 0.2
552 0.18
553 0.23
554 0.24
555 0.23
556 0.23
557 0.23
558 0.24
559 0.23
560 0.23
561 0.18
562 0.19
563 0.21
564 0.21
565 0.21
566 0.18
567 0.23
568 0.21
569 0.23
570 0.23
571 0.23
572 0.24
573 0.28
574 0.31
575 0.3
576 0.34
577 0.33
578 0.32
579 0.3
580 0.27
581 0.23
582 0.19
583 0.12
584 0.07
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.1
593 0.1
594 0.09
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.12
599 0.11
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.08
604 0.1
605 0.14
606 0.21
607 0.25
608 0.31
609 0.33
610 0.4
611 0.47
612 0.48
613 0.53
614 0.54
615 0.54
616 0.51
617 0.5
618 0.46
619 0.42
620 0.42
621 0.36
622 0.28
623 0.24
624 0.2
625 0.18
626 0.16
627 0.13
628 0.1
629 0.07
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.04
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.07
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.1
671 0.15
672 0.2
673 0.29
674 0.34
675 0.39
676 0.39
677 0.4
678 0.45
679 0.45
680 0.44
681 0.41
682 0.39
683 0.35
684 0.39
685 0.38
686 0.31
687 0.26
688 0.22
689 0.17
690 0.14
691 0.14
692 0.09
693 0.1
694 0.09
695 0.08
696 0.09
697 0.1
698 0.1
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.13
705 0.12
706 0.13
707 0.11
708 0.11
709 0.09
710 0.08
711 0.07
712 0.06
713 0.05
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.06
721 0.06
722 0.07
723 0.06
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.1
732 0.14
733 0.16
734 0.17
735 0.18
736 0.22
737 0.24
738 0.24
739 0.27
740 0.22
741 0.24
742 0.24
743 0.24
744 0.2
745 0.17
746 0.17
747 0.13
748 0.13
749 0.09
750 0.07
751 0.06
752 0.05
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.08
757 0.1
758 0.13
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.15
763 0.17
764 0.17
765 0.23
766 0.26
767 0.27
768 0.32
769 0.31
770 0.29
771 0.3
772 0.34
773 0.32
774 0.32
775 0.31
776 0.33
777 0.34
778 0.34
779 0.34
780 0.34
781 0.29
782 0.26
783 0.27
784 0.25
785 0.26
786 0.26
787 0.23
788 0.21
789 0.23
790 0.2
791 0.19
792 0.17
793 0.16
794 0.16
795 0.17
796 0.17
797 0.13
798 0.13
799 0.11
800 0.13
801 0.13
802 0.15
803 0.15
804 0.14
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.1
809 0.08
810 0.07
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.04
818 0.04
819 0.04
820 0.05
821 0.06
822 0.06
823 0.09
824 0.09
825 0.12
826 0.14
827 0.16
828 0.17
829 0.17
830 0.2
831 0.21
832 0.22
833 0.21
834 0.21
835 0.2
836 0.19
837 0.19
838 0.17
839 0.13
840 0.16
841 0.18
842 0.19
843 0.2
844 0.23
845 0.25
846 0.26
847 0.26
848 0.22
849 0.22
850 0.22
851 0.26
852 0.24
853 0.32
854 0.35
855 0.36
856 0.37
857 0.35
858 0.35
859 0.31
860 0.32
861 0.24
862 0.2
863 0.19
864 0.18
865 0.17
866 0.14
867 0.11
868 0.08
869 0.07
870 0.05
871 0.05
872 0.05
873 0.05
874 0.04
875 0.04
876 0.05
877 0.07
878 0.14
879 0.15
880 0.18
881 0.18
882 0.19
883 0.19
884 0.21
885 0.21
886 0.17
887 0.21
888 0.22
889 0.29
890 0.31
891 0.34
892 0.39
893 0.43
894 0.41
895 0.42
896 0.43
897 0.42
898 0.46
899 0.45
900 0.41
901 0.37
902 0.37
903 0.31
904 0.26
905 0.2
906 0.14
907 0.13
908 0.09
909 0.08
910 0.07
911 0.08
912 0.08
913 0.08
914 0.08
915 0.11
916 0.14
917 0.15
918 0.14
919 0.13
920 0.14
921 0.13
922 0.13
923 0.11
924 0.08
925 0.07
926 0.07
927 0.06
928 0.06
929 0.07
930 0.06
931 0.06
932 0.07
933 0.1
934 0.11
935 0.12
936 0.12
937 0.12
938 0.14
939 0.13
940 0.14
941 0.17
942 0.2
943 0.24
944 0.26
945 0.27
946 0.26
947 0.25
948 0.24
949 0.18
950 0.16
951 0.1
952 0.08
953 0.07
954 0.07
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.06
959 0.06
960 0.08
961 0.1
962 0.11
963 0.11
964 0.12
965 0.13
966 0.14
967 0.16
968 0.17
969 0.18
970 0.18
971 0.18
972 0.24
973 0.26
974 0.32
975 0.33
976 0.31
977 0.36
978 0.37
979 0.38
980 0.32
981 0.29
982 0.23
983 0.27
984 0.27
985 0.21
986 0.21
987 0.2
988 0.2
989 0.23
990 0.23
991 0.18
992 0.17
993 0.14
994 0.15
995 0.14
996 0.15
997 0.12
998 0.13
999 0.13
1000 0.14
1001 0.18
1002 0.18
1003 0.17
1004 0.17
1005 0.19
1006 0.19
1007 0.22
1008 0.23
1009 0.21
1010 0.2
1011 0.21
1012 0.21
1013 0.25
1014 0.28
1015 0.26
1016 0.27
1017 0.33
1018 0.35
1019 0.34
1020 0.34
1021 0.29
1022 0.24
1023 0.23
1024 0.2
1025 0.17
1026 0.17
1027 0.17
1028 0.21
1029 0.2
1030 0.2
1031 0.2
1032 0.19
1033 0.17
1034 0.17
1035 0.18
1036 0.14
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.17
1040 0.17
1041 0.19
1042 0.23
1043 0.21
1044 0.26
1045 0.26
1046 0.28
1047 0.25
1048 0.26
1049 0.28
1050 0.23
1051 0.23
1052 0.19
1053 0.2
1054 0.18
1055 0.18
1056 0.18
1057 0.14
1058 0.15
1059 0.16
1060 0.18
1061 0.19
1062 0.19
1063 0.23
1064 0.25
1065 0.25
1066 0.24
1067 0.23
1068 0.18
1069 0.17
1070 0.17
1071 0.12
1072 0.09
1073 0.07
1074 0.07
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.07
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.07
1082 0.06
1083 0.07
1084 0.07
1085 0.07
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.09
1089 0.08
1090 0.08
1091 0.08
1092 0.08
1093 0.08
1094 0.07
1095 0.07
1096 0.05
1097 0.06
1098 0.07
1099 0.07
1100 0.12
1101 0.13
1102 0.16
1103 0.18
1104 0.19
1105 0.18
1106 0.21
1107 0.24
1108 0.25
1109 0.24
1110 0.21
1111 0.21
1112 0.27
1113 0.26
1114 0.24
1115 0.23
1116 0.2
1117 0.21
1118 0.21
1119 0.18
1120 0.13
1121 0.13
1122 0.13
1123 0.11
1124 0.08
1125 0.08
1126 0.1
1127 0.11
1128 0.12
1129 0.14
1130 0.21
1131 0.26
1132 0.27
1133 0.35
1134 0.4
1135 0.41
1136 0.41
1137 0.48
1138 0.46
1139 0.47
1140 0.46
1141 0.4
1142 0.37
1143 0.35
1144 0.33
1145 0.24
1146 0.19
1147 0.16
1148 0.15
1149 0.13
1150 0.11
1151 0.15
1152 0.14
1153 0.13
1154 0.13
1155 0.11
1156 0.11
1157 0.11
1158 0.11
1159 0.13
1160 0.14
1161 0.15
1162 0.17
1163 0.17
1164 0.19
1165 0.23
1166 0.22
1167 0.17
1168 0.17
1169 0.16
1170 0.14
1171 0.15
1172 0.13
1173 0.11
1174 0.14
1175 0.13
1176 0.13
1177 0.15
1178 0.15
1179 0.15
1180 0.19
1181 0.2
1182 0.22
1183 0.26
1184 0.31
1185 0.34
1186 0.36
1187 0.37
1188 0.35
1189 0.34
1190 0.38
1191 0.37
1192 0.33
1193 0.3
1194 0.28
1195 0.26
1196 0.25
1197 0.24
1198 0.18
1199 0.16
1200 0.17
1201 0.16
1202 0.15
1203 0.16
1204 0.15
1205 0.23
1206 0.27
1207 0.31
1208 0.38
1209 0.47
1210 0.52
1211 0.53
1212 0.57
1213 0.53
1214 0.51
1215 0.48
1216 0.41
1217 0.35