FuNGI

J4UG01

Protein Details

Accession

J4UG01

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
154-176	TQRARICFKRIVRRVKRDFWRGI	Hydrophilic
527-547	QKRSSLPPIRHRDRTVRPKPA	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 5, pero 5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MDTIVAGDMNAHHLHWRTDRPSSRCGTKLAEWAEEQGLLLLNEPDIDTTRSAPHRRATTIDLAFSNIDQAAAVVEEYLTTGSLHYTPLLDSHENIERTTSSLTDIIETAIRTCGHRQNNHKAGKNPWWNEECANTLLDFRVLWRTTENPTGEETQRARICFKRIVRRVKRDFWRGIIASITSPDDVYKVTRWLKPRQRISPPPIRVGEQIFSTNKDKARALGRAKLARRTASDDIVDPWSIPVTPETSIPFDQKISYEETRFGLLSTGNTSPGADGITVHMLQKLWPIVGHLVTDIYNACLQHGYCPRAWRTAEVVMIPKQNKRDLTDPGTWRPISLLSCLGKGMERIIAKRMSHLAIKNKILHPNQAGALPQRSATDIAAALTHDVEQARRRTTKRVATLVTMDLRRQGWPIFLIRWLATFLASRLANVRFEDAIAEALELLCGIPQGSPLSPILYLLATAALYKLPGATQRYGYADDTAMLFVGETLDETTAQANAAIAAMEEWGRSEGFAFDINKTEVIHFTNQKRSSLPPIRHRDRTVRPKPAMRWLGIWFDARLNFSVHVSKWAAKAKSVIYHLRSMSNTVRGISAAAAQSLVAKSPDELRIWPPAAPPDAAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.35
4	0.36
5	0.46
6	0.55
7	0.56
8	0.62
9	0.63
10	0.65
11	0.6
12	0.59
13	0.55
14	0.51
15	0.54
16	0.5
17	0.47
18	0.4
19	0.4
20	0.37
21	0.31
22	0.26
23	0.19
24	0.17
25	0.13
26	0.13
27	0.1
28	0.09
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.1
33	0.12
34	0.12
35	0.14
36	0.21
37	0.28
38	0.33
39	0.37
40	0.42
41	0.46
42	0.47
43	0.49
44	0.48
45	0.49
46	0.47
47	0.46
48	0.39
49	0.35
50	0.33
51	0.28
52	0.25
53	0.15
54	0.13
55	0.09
56	0.09
57	0.07
58	0.06
59	0.06
60	0.04
61	0.04
62	0.04
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.11
75	0.16
76	0.15
77	0.16
78	0.19
79	0.26
80	0.26
81	0.26
82	0.26
83	0.21
84	0.22
85	0.22
86	0.18
87	0.14
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.14
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.15
99	0.2
100	0.27
101	0.33
102	0.41
103	0.49
104	0.57
105	0.66
106	0.72
107	0.73
108	0.7
109	0.69
110	0.72
111	0.73
112	0.66
113	0.64
114	0.59
115	0.54
116	0.51
117	0.46
118	0.39
119	0.3
120	0.28
121	0.2
122	0.18
123	0.16
124	0.15
125	0.12
126	0.1
127	0.17
128	0.16
129	0.17
130	0.18
131	0.2
132	0.24
133	0.31
134	0.31
135	0.24
136	0.27
137	0.31
138	0.29
139	0.33
140	0.31
141	0.32
142	0.34
143	0.34
144	0.35
145	0.34
146	0.38
147	0.4
148	0.46
149	0.49
150	0.55
151	0.65
152	0.71
153	0.78
154	0.81
155	0.83
156	0.84
157	0.82
158	0.77
159	0.7
160	0.68
161	0.57
162	0.5
163	0.42
164	0.33
165	0.25
166	0.22
167	0.19
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.11
174	0.11
175	0.17
176	0.21
177	0.25
178	0.31
179	0.41
180	0.5
181	0.57
182	0.65
183	0.67
184	0.72
185	0.77
186	0.8
187	0.8
188	0.74
189	0.71
190	0.63
191	0.57
192	0.49
193	0.43
194	0.36
195	0.27
196	0.28
197	0.22
198	0.24
199	0.25
200	0.26
201	0.25
202	0.27
203	0.25
204	0.25
205	0.29
206	0.33
207	0.34
208	0.37
209	0.41
210	0.45
211	0.48
212	0.51
213	0.48
214	0.43
215	0.42
216	0.42
217	0.38
218	0.34
219	0.32
220	0.26
221	0.25
222	0.24
223	0.22
224	0.15
225	0.13
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.09
233	0.1
234	0.13
235	0.15
236	0.16
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.17
243	0.18
244	0.17
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.18
249	0.16
250	0.11
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.13
290	0.17
291	0.19
292	0.19
293	0.23
294	0.24
295	0.29
296	0.29
297	0.25
298	0.23
299	0.23
300	0.22
301	0.2
302	0.21
303	0.19
304	0.23
305	0.23
306	0.22
307	0.22
308	0.25
309	0.26
310	0.26
311	0.28
312	0.28
313	0.33
314	0.38
315	0.38
316	0.38
317	0.41
318	0.37
319	0.33
320	0.29
321	0.25
322	0.19
323	0.16
324	0.18
325	0.14
326	0.15
327	0.15
328	0.14
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.15
336	0.19
337	0.18
338	0.2
339	0.21
340	0.19
341	0.22
342	0.25
343	0.3
344	0.32
345	0.35
346	0.38
347	0.39
348	0.45
349	0.43
350	0.43
351	0.36
352	0.33
353	0.3
354	0.26
355	0.24
356	0.19
357	0.2
358	0.16
359	0.14
360	0.12
361	0.13
362	0.13
363	0.11
364	0.1
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.08
375	0.13
376	0.16
377	0.21
378	0.26
379	0.28
380	0.35
381	0.42
382	0.48
383	0.5
384	0.52
385	0.49
386	0.46
387	0.47
388	0.43
389	0.39
390	0.32
391	0.26
392	0.23
393	0.22
394	0.2
395	0.19
396	0.17
397	0.13
398	0.15
399	0.17
400	0.15
401	0.15
402	0.17
403	0.15
404	0.15
405	0.15
406	0.13
407	0.11
408	0.11
409	0.09
410	0.13
411	0.13
412	0.12
413	0.15
414	0.16
415	0.17
416	0.17
417	0.19
418	0.14
419	0.14
420	0.14
421	0.11
422	0.11
423	0.09
424	0.08
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.05
435	0.07
436	0.07
437	0.09
438	0.09
439	0.1
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.08
444	0.08
445	0.06
446	0.07
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.1
456	0.14
457	0.16
458	0.18
459	0.21
460	0.23
461	0.26
462	0.26
463	0.23
464	0.19
465	0.17
466	0.16
467	0.14
468	0.11
469	0.08
470	0.07
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.12
500	0.13
501	0.14
502	0.17
503	0.18
504	0.19
505	0.19
506	0.19
507	0.17
508	0.19
509	0.24
510	0.28
511	0.33
512	0.42
513	0.44
514	0.45
515	0.45
516	0.45
517	0.5
518	0.52
519	0.55
520	0.55
521	0.64
522	0.7
523	0.76
524	0.78
525	0.77
526	0.78
527	0.81
528	0.8
529	0.8
530	0.79
531	0.8
532	0.79
533	0.8
534	0.75
535	0.66
536	0.6
537	0.53
538	0.51
539	0.46
540	0.43
541	0.33
542	0.3
543	0.3
544	0.28
545	0.26
546	0.22
547	0.2
548	0.21
549	0.24
550	0.21
551	0.25
552	0.26
553	0.28
554	0.32
555	0.4
556	0.38
557	0.36
558	0.4
559	0.38
560	0.42
561	0.44
562	0.46
563	0.42
564	0.47
565	0.47
566	0.48
567	0.44
568	0.43
569	0.42
570	0.41
571	0.38
572	0.33
573	0.32
574	0.27
575	0.26
576	0.21
577	0.21
578	0.15
579	0.14
580	0.13
581	0.12
582	0.15
583	0.14
584	0.15
585	0.12
586	0.11
587	0.12
588	0.18
589	0.22
590	0.21
591	0.24
592	0.25
593	0.33
594	0.34
595	0.34
596	0.33
597	0.34
598	0.35

J4UG01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer