Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JJC9

Protein Details
Accession J5JJC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162IKPDMDKKEKEKRRARWQDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-156KEKEKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 9.833, cyto 7.5, cyto_mito 6.833, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences METKHFNVLVSTFRGLGLPPTIVLPVQPSTTVTAFRHHLNEHLPDTASRFILTTLSNKQLLNESDIPLSSYLSTEDDDFLSLRLSIPLCGGKGGFGSQLRAAGGRMSSRKKKTQDDNGSSRNLDGRRLRTVNEAKALAEYLAIKPDMDKKEKEKRRARWQDIVQQTEAKEAEIKNGGKSMIDGQWAEDKEESSERTRDAVLAAMKSGNYTDNLFSSSHGSSSAAPGESPSDSDEQSRASSKESPPPTQPATDSKGKGKARAFFGFDEDDEFMSSDDDSDDNAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.19
4 0.16
5 0.13
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.17
17 0.18
18 0.22
19 0.2
20 0.23
21 0.24
22 0.27
23 0.3
24 0.27
25 0.3
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.23
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.19
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.29
47 0.29
48 0.31
49 0.29
50 0.26
51 0.25
52 0.25
53 0.25
54 0.19
55 0.18
56 0.12
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.17
93 0.23
94 0.31
95 0.36
96 0.44
97 0.49
98 0.56
99 0.61
100 0.67
101 0.7
102 0.7
103 0.72
104 0.68
105 0.64
106 0.56
107 0.48
108 0.42
109 0.32
110 0.3
111 0.27
112 0.26
113 0.31
114 0.31
115 0.32
116 0.35
117 0.4
118 0.36
119 0.35
120 0.32
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.15
125 0.11
126 0.09
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.14
133 0.17
134 0.2
135 0.22
136 0.28
137 0.39
138 0.46
139 0.56
140 0.58
141 0.63
142 0.72
143 0.8
144 0.79
145 0.78
146 0.76
147 0.75
148 0.72
149 0.66
150 0.56
151 0.47
152 0.41
153 0.35
154 0.3
155 0.21
156 0.17
157 0.14
158 0.15
159 0.19
160 0.19
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.19
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.2
224 0.18
225 0.2
226 0.26
227 0.28
228 0.36
229 0.4
230 0.42
231 0.43
232 0.49
233 0.49
234 0.45
235 0.45
236 0.42
237 0.43
238 0.46
239 0.45
240 0.44
241 0.5
242 0.5
243 0.54
244 0.54
245 0.54
246 0.54
247 0.56
248 0.54
249 0.46
250 0.47
251 0.43
252 0.37
253 0.34
254 0.29
255 0.23
256 0.21
257 0.2
258 0.15
259 0.13
260 0.13
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08