Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165GSH2

Protein Details
Accession A0A165GSH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-49MNKILEKKAKKRKHAVADIGLVAEPSTKRAKKDKTKRDKGKTRATDDGSHydrophilic
303-333EAELRKQEEKEAKRDQRRRRKEAKGGEGAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-16KKAKKRKHAV
24-42EPSTKRAKKDKTKRDKGKT
305-347ELRKQEEKEAKRDQRRRRKEAKGGEGAGGVDAGGRKGKKKKKA
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 12.833, mito 10, cyto_nucl 9.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MNKILEKKAKKRKHAVADIGLVAEPSTKRAKKDKTKRDKGKTRATDDGSEFRVIQATMSVSIPPVFANNLRKGVEEMLDSLLMRYIPALQGVMLAHDELSFLDSMATIKADCPFANCRVAFNTTVWSPQIGMKLVGKVNLCSPGHVALLLRRTFNVSIPRHHIPEDQWEFEYGPAENDPEFGAAIADEKTGTQDGETEQVGGNGRWVHKLTGVRLGDSHGFLEFTVVGLTIANRMLSLVGSIQPDPFSPEHVPRQTVAATTDVRDEPGVDEFHPVEEINEDDGSEVDTFELLGRMGDQAKAREAELRKQEEKEAKRDQRRRRKEAKGGEGAGGVDAGGRKGKKKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.87
3 0.83
4 0.78
5 0.69
6 0.59
7 0.49
8 0.38
9 0.27
10 0.22
11 0.15
12 0.14
13 0.23
14 0.25
15 0.3
16 0.4
17 0.51
18 0.59
19 0.7
20 0.77
21 0.79
22 0.88
23 0.93
24 0.95
25 0.95
26 0.93
27 0.93
28 0.91
29 0.87
30 0.85
31 0.78
32 0.73
33 0.67
34 0.63
35 0.55
36 0.47
37 0.4
38 0.31
39 0.29
40 0.22
41 0.17
42 0.14
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.14
54 0.21
55 0.25
56 0.29
57 0.3
58 0.3
59 0.31
60 0.31
61 0.27
62 0.21
63 0.18
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.12
100 0.15
101 0.18
102 0.24
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.27
107 0.25
108 0.22
109 0.22
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.17
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.16
126 0.22
127 0.2
128 0.18
129 0.18
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.1
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.14
139 0.17
140 0.17
141 0.2
142 0.26
143 0.23
144 0.25
145 0.31
146 0.33
147 0.32
148 0.33
149 0.31
150 0.23
151 0.31
152 0.32
153 0.27
154 0.25
155 0.25
156 0.24
157 0.22
158 0.22
159 0.11
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.16
196 0.19
197 0.18
198 0.25
199 0.25
200 0.23
201 0.22
202 0.24
203 0.21
204 0.19
205 0.18
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.22
237 0.3
238 0.32
239 0.34
240 0.3
241 0.33
242 0.29
243 0.27
244 0.23
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.2
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.15
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.26
290 0.29
291 0.34
292 0.4
293 0.47
294 0.47
295 0.48
296 0.56
297 0.58
298 0.61
299 0.61
300 0.63
301 0.66
302 0.73
303 0.8
304 0.83
305 0.85
306 0.9
307 0.91
308 0.91
309 0.91
310 0.9
311 0.91
312 0.91
313 0.88
314 0.8
315 0.71
316 0.62
317 0.52
318 0.41
319 0.3
320 0.2
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.14
325 0.16
326 0.23
327 0.34