FuNGI

A0A165I8M5

Protein Details

Accession

A0A165I8M5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-54	PSPGKPSQPARPREPKPQKKEDDDDEM	Acidic
89-110	DITKWTTPVRLNRKEPRREVDD	Hydrophilic
158-184	GDKGKDKEKAPQKKRFQKKTRQVYLVP	Basic
586-609	AGSTQGAPKKKRRSHAPPPTTELE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-47	KKKKPAAAAAPKTESEAGRSPSPGKPSQPARPREPKPQKK
160-176	KGKDKEKAPQKKRFQKK
593-599	PKKKRRS

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MALLFHQKKKKPAAAAAPKTESEAGRSPSPGKPSQPARPREPKPQKKEDDDDEMTPLPDGPYSEFRLMSSALNGWKYDIMKFDSRKNIDITKWTTPVRLNRKEPRREVDDSVAAAVPQAVGPMLGPDGKPVIGPDGKMVMVDSEGRPIRSGETQANGGDKGKDKEKAPQKKRFQKKTRQVYLVPEETRQLRKEERYPWVMEDASGKETWIGKMEEVSKAELFAMFMPAANDIFKFVPAHRWYKFQRQPNYRVPMQLEEVEALMAKIQKNKEPERVLRRIYGQNASDATKALFKAEREGSVAPVTASTSLGPGGRRLRTVDSGMAGLFGDDDEDGEERKRKIKRELGAEGDVDEMDFEETFADDEEKMDMEDREDEEARELEERLKKEYKSANKAREGYVDESEEEEETTLTRAGKTLQKTLQKLEKDGGYEESDEEENPYASEVEEEEEEVPVPVQTGPAIIPPSPKPRTPSQGTTSFPTPSATPTHINGTKTPMQVKTESPQLDLSRPTSPIAGHGGHSIVAKRATSPKMPKVPIPGTGMRPTSPLAGRMTSPTSPTSPLANGKPSIKRKATDDGTGGPVGPSGAGSTQGAPKKKRRSHAPPPTTELEDRMVIEWLRDTPGATTRDCIHHFTPWLTDEAKKVRFTALVKEVAHLRLGVLVLRPAYRDAVGPGPGAGGASPTSQAVSPAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.78
3	0.78
4	0.72
5	0.65
6	0.61
7	0.56
8	0.45
9	0.4
10	0.38
11	0.34
12	0.33
13	0.36
14	0.36
15	0.38
16	0.44
17	0.44
18	0.42
19	0.47
20	0.52
21	0.59
22	0.64
23	0.67
24	0.7
25	0.75
26	0.77
27	0.79
28	0.83
29	0.83
30	0.84
31	0.87
32	0.86
33	0.84
34	0.86
35	0.81
36	0.79
37	0.73
38	0.65
39	0.58
40	0.5
41	0.41
42	0.34
43	0.28
44	0.18
45	0.15
46	0.14
47	0.15
48	0.19
49	0.23
50	0.26
51	0.25
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.23
56	0.2
57	0.18
58	0.2
59	0.21
60	0.21
61	0.2
62	0.23
63	0.23
64	0.23
65	0.23
66	0.25
67	0.31
68	0.34
69	0.41
70	0.47
71	0.49
72	0.51
73	0.51
74	0.51
75	0.46
76	0.52
77	0.5
78	0.46
79	0.48
80	0.46
81	0.46
82	0.46
83	0.53
84	0.55
85	0.59
86	0.61
87	0.67
88	0.76
89	0.81
90	0.83
91	0.81
92	0.77
93	0.73
94	0.69
95	0.65
96	0.59
97	0.5
98	0.44
99	0.36
100	0.29
101	0.23
102	0.18
103	0.11
104	0.07
105	0.06
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.05
110	0.06
111	0.07
112	0.07
113	0.08
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.1
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.16
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.16
126	0.1
127	0.1
128	0.12
129	0.11
130	0.16
131	0.17
132	0.18
133	0.19
134	0.19
135	0.21
136	0.21
137	0.24
138	0.2
139	0.21
140	0.23
141	0.24
142	0.25
143	0.23
144	0.21
145	0.21
146	0.22
147	0.23
148	0.26
149	0.29
150	0.29
151	0.37
152	0.46
153	0.54
154	0.59
155	0.66
156	0.73
157	0.79
158	0.89
159	0.9
160	0.9
161	0.91
162	0.92
163	0.92
164	0.91
165	0.87
166	0.79
167	0.76
168	0.73
169	0.7
170	0.61
171	0.5
172	0.44
173	0.42
174	0.43
175	0.36
176	0.33
177	0.32
178	0.36
179	0.42
180	0.47
181	0.49
182	0.49
183	0.49
184	0.47
185	0.44
186	0.39
187	0.32
188	0.28
189	0.23
190	0.21
191	0.19
192	0.17
193	0.15
194	0.16
195	0.16
196	0.16
197	0.15
198	0.12
199	0.16
200	0.18
201	0.19
202	0.19
203	0.21
204	0.17
205	0.17
206	0.17
207	0.14
208	0.12
209	0.09
210	0.1
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.18
224	0.22
225	0.28
226	0.27
227	0.34
228	0.38
229	0.48
230	0.55
231	0.55
232	0.61
233	0.63
234	0.7
235	0.72
236	0.74
237	0.65
238	0.61
239	0.55
240	0.48
241	0.41
242	0.35
243	0.26
244	0.19
245	0.18
246	0.14
247	0.11
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.09
252	0.13
253	0.14
254	0.18
255	0.25
256	0.3
257	0.37
258	0.41
259	0.48
260	0.52
261	0.57
262	0.55
263	0.51
264	0.52
265	0.49
266	0.46
267	0.43
268	0.34
269	0.31
270	0.3
271	0.28
272	0.24
273	0.19
274	0.16
275	0.14
276	0.13
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.17
281	0.18
282	0.18
283	0.18
284	0.18
285	0.18
286	0.16
287	0.16
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.07
292	0.07
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.11
299	0.15
300	0.16
301	0.17
302	0.18
303	0.2
304	0.21
305	0.23
306	0.2
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.1
312	0.07
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.06
322	0.1
323	0.1
324	0.17
325	0.21
326	0.25
327	0.33
328	0.4
329	0.44
330	0.48
331	0.52
332	0.5
333	0.48
334	0.43
335	0.35
336	0.28
337	0.23
338	0.15
339	0.1
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.08
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.12
368	0.16
369	0.17
370	0.21
371	0.25
372	0.25
373	0.3
374	0.37
375	0.4
376	0.46
377	0.53
378	0.55
379	0.58
380	0.6
381	0.55
382	0.52
383	0.47
384	0.4
385	0.34
386	0.28
387	0.21
388	0.2
389	0.19
390	0.15
391	0.12
392	0.09
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.07
400	0.1
401	0.15
402	0.17
403	0.22
404	0.27
405	0.33
406	0.35
407	0.4
408	0.44
409	0.41
410	0.4
411	0.37
412	0.32
413	0.27
414	0.26
415	0.24
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.15
420	0.14
421	0.12
422	0.12
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.09
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.12
450	0.16
451	0.25
452	0.27
453	0.3
454	0.32
455	0.37
456	0.44
457	0.47
458	0.5
459	0.47
460	0.51
461	0.51
462	0.51
463	0.47
464	0.41
465	0.35
466	0.29
467	0.24
468	0.19
469	0.2
470	0.19
471	0.19
472	0.19
473	0.26
474	0.29
475	0.3
476	0.29
477	0.32
478	0.35
479	0.35
480	0.38
481	0.33
482	0.33
483	0.33
484	0.35
485	0.32
486	0.34
487	0.32
488	0.3
489	0.32
490	0.3
491	0.31
492	0.3
493	0.3
494	0.25
495	0.25
496	0.24
497	0.2
498	0.18
499	0.18
500	0.2
501	0.18
502	0.16
503	0.16
504	0.16
505	0.15
506	0.16
507	0.15
508	0.13
509	0.14
510	0.13
511	0.15
512	0.21
513	0.24
514	0.31
515	0.38
516	0.44
517	0.51
518	0.53
519	0.54
520	0.56
521	0.55
522	0.52
523	0.51
524	0.47
525	0.42
526	0.46
527	0.44
528	0.36
529	0.35
530	0.31
531	0.29
532	0.26
533	0.24
534	0.21
535	0.21
536	0.21
537	0.23
538	0.26
539	0.23
540	0.24
541	0.23
542	0.23
543	0.24
544	0.24
545	0.24
546	0.23
547	0.27
548	0.29
549	0.31
550	0.32
551	0.35
552	0.43
553	0.48
554	0.54
555	0.53
556	0.52
557	0.52
558	0.58
559	0.56
560	0.52
561	0.48
562	0.42
563	0.41
564	0.39
565	0.34
566	0.24
567	0.2
568	0.15
569	0.12
570	0.09
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.08
575	0.1
576	0.16
577	0.22
578	0.29
579	0.35
580	0.44
581	0.54
582	0.6
583	0.68
584	0.72
585	0.77
586	0.81
587	0.86
588	0.87
589	0.82
590	0.82
591	0.77
592	0.72
593	0.63
594	0.54
595	0.46
596	0.37
597	0.32
598	0.26
599	0.24
600	0.18
601	0.18
602	0.17
603	0.15
604	0.16
605	0.15
606	0.15
607	0.14
608	0.21
609	0.23
610	0.22
611	0.24
612	0.25
613	0.32
614	0.34
615	0.37
616	0.32
617	0.35
618	0.38
619	0.36
620	0.37
621	0.31
622	0.32
623	0.29
624	0.29
625	0.3
626	0.36
627	0.39
628	0.37
629	0.37
630	0.36
631	0.39
632	0.39
633	0.41
634	0.39
635	0.41
636	0.4
637	0.41
638	0.43
639	0.39
640	0.38
641	0.29
642	0.22
643	0.17
644	0.17
645	0.16
646	0.13
647	0.15
648	0.16
649	0.17
650	0.18
651	0.17
652	0.19
653	0.18
654	0.18
655	0.18
656	0.21
657	0.22
658	0.21
659	0.19
660	0.18
661	0.17
662	0.16
663	0.12
664	0.09
665	0.08
666	0.09
667	0.09
668	0.09
669	0.1
670	0.1
671	0.12

A0A165I8M5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer