Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JGW8

Protein Details
Accession J5JGW8    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-64DDQPSHTSKRPKFSRPSLSSNPSKHydrophilic
161-180HSGLKPPKKRTAKQTVRAMEHydrophilic
423-442HLGAKPKKGRQQAKMPRGPPBasic
526-545PPPSLPPKPPAARNNRGPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-440KPKKGRQQAKMPRG
524-586RGPPPSLPPKPPAARNNRGPPPPPPKGDARRGGYSRGRGGPPRGRGGRGGGGGGGGGRGRGRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MAAEEQIPGDVISMGGSDSEEENSQIGKRSLSDVDGPDGQDDQPSHTSKRPKFSRPSLSSNPSKASEEGEIEESLPKSIGSQSGQSGGQPAAKSFVPSDPPLFTTDSVSLKLPALSQKKEGSWCERVLDWSTVLCTINFKSLADIKPPTIVSAFCQYVDVHSGLKPPKKRTAKQTVRAMEESGQIDNVIASAKPPPPALATKADDSEEGQVADSPEYEPSEAAQVANGQQTNGHANNVVVTATNGDSVPKGGPTTEQRRYFPSAENAADMCVLCGRKGHVSDACSHTKCKFCGETGHWQFACQAIQARCDKCRQLGHDTSSCVEKLALTKDEGLACAYCGMEHHLEGECTEPWRSFHAEGDVVLPVIAIQASCAVCGSRNHFASDCSQKGSRPFNPSWTLRNRDRFIDPNCGNESIEEAASVHLGAKPKKGRQQAKMPRGPPSRAINVHYSESDDSDMDLLSHRAAPRQQRPPLGRMQMSTNIQMPTLGGNAVQPPLPPGPPPPLPPSGYPPPPGTTSYGRNERGPPPSLPPKPPAARNNRGPPPPPPKGDARRGGYSRGRGGPPRGRGGRGGGGGGGGGRGRGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.22
17 0.23
18 0.25
19 0.29
20 0.26
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.26
25 0.26
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.21
30 0.24
31 0.27
32 0.31
33 0.36
34 0.46
35 0.48
36 0.58
37 0.61
38 0.65
39 0.71
40 0.77
41 0.82
42 0.78
43 0.82
44 0.8
45 0.8
46 0.78
47 0.73
48 0.68
49 0.6
50 0.56
51 0.47
52 0.41
53 0.36
54 0.31
55 0.28
56 0.26
57 0.23
58 0.21
59 0.23
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.13
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.18
70 0.21
71 0.22
72 0.21
73 0.21
74 0.18
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.2
83 0.21
84 0.22
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.26
89 0.26
90 0.23
91 0.22
92 0.23
93 0.22
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.17
100 0.22
101 0.27
102 0.28
103 0.32
104 0.34
105 0.36
106 0.42
107 0.44
108 0.44
109 0.43
110 0.42
111 0.4
112 0.37
113 0.37
114 0.35
115 0.32
116 0.25
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.28
132 0.24
133 0.27
134 0.27
135 0.25
136 0.2
137 0.19
138 0.16
139 0.2
140 0.2
141 0.16
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.19
146 0.17
147 0.12
148 0.12
149 0.18
150 0.23
151 0.29
152 0.34
153 0.37
154 0.47
155 0.55
156 0.61
157 0.65
158 0.71
159 0.75
160 0.78
161 0.82
162 0.78
163 0.74
164 0.69
165 0.6
166 0.51
167 0.44
168 0.36
169 0.27
170 0.21
171 0.15
172 0.13
173 0.11
174 0.09
175 0.06
176 0.04
177 0.05
178 0.09
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.23
187 0.24
188 0.25
189 0.26
190 0.25
191 0.23
192 0.21
193 0.2
194 0.14
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.09
240 0.16
241 0.24
242 0.3
243 0.34
244 0.35
245 0.39
246 0.44
247 0.43
248 0.39
249 0.36
250 0.33
251 0.29
252 0.29
253 0.25
254 0.2
255 0.18
256 0.15
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.2
269 0.25
270 0.29
271 0.27
272 0.28
273 0.29
274 0.3
275 0.29
276 0.29
277 0.25
278 0.21
279 0.25
280 0.28
281 0.36
282 0.35
283 0.41
284 0.37
285 0.36
286 0.35
287 0.3
288 0.26
289 0.16
290 0.19
291 0.13
292 0.18
293 0.22
294 0.24
295 0.24
296 0.27
297 0.28
298 0.27
299 0.3
300 0.3
301 0.33
302 0.36
303 0.39
304 0.39
305 0.39
306 0.35
307 0.33
308 0.28
309 0.21
310 0.16
311 0.11
312 0.1
313 0.13
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.13
341 0.16
342 0.15
343 0.16
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.14
349 0.11
350 0.1
351 0.08
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.09
363 0.11
364 0.15
365 0.19
366 0.2
367 0.22
368 0.22
369 0.24
370 0.28
371 0.33
372 0.3
373 0.27
374 0.27
375 0.27
376 0.33
377 0.39
378 0.39
379 0.39
380 0.39
381 0.42
382 0.48
383 0.49
384 0.5
385 0.51
386 0.52
387 0.52
388 0.6
389 0.56
390 0.53
391 0.55
392 0.54
393 0.5
394 0.54
395 0.47
396 0.43
397 0.43
398 0.41
399 0.36
400 0.29
401 0.27
402 0.18
403 0.17
404 0.12
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.12
412 0.13
413 0.21
414 0.27
415 0.34
416 0.42
417 0.51
418 0.58
419 0.61
420 0.71
421 0.74
422 0.78
423 0.81
424 0.75
425 0.75
426 0.73
427 0.68
428 0.63
429 0.59
430 0.56
431 0.51
432 0.52
433 0.47
434 0.44
435 0.44
436 0.37
437 0.34
438 0.27
439 0.25
440 0.23
441 0.17
442 0.14
443 0.12
444 0.12
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.11
450 0.11
451 0.15
452 0.2
453 0.29
454 0.37
455 0.46
456 0.52
457 0.57
458 0.62
459 0.63
460 0.67
461 0.65
462 0.58
463 0.5
464 0.49
465 0.47
466 0.45
467 0.43
468 0.38
469 0.31
470 0.29
471 0.27
472 0.22
473 0.16
474 0.14
475 0.11
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.13
483 0.15
484 0.16
485 0.16
486 0.18
487 0.24
488 0.27
489 0.31
490 0.33
491 0.36
492 0.38
493 0.4
494 0.44
495 0.46
496 0.47
497 0.46
498 0.43
499 0.41
500 0.41
501 0.41
502 0.38
503 0.35
504 0.37
505 0.42
506 0.48
507 0.47
508 0.49
509 0.52
510 0.54
511 0.55
512 0.52
513 0.46
514 0.46
515 0.54
516 0.57
517 0.56
518 0.54
519 0.58
520 0.6
521 0.66
522 0.68
523 0.67
524 0.7
525 0.74
526 0.8
527 0.79
528 0.8
529 0.74
530 0.74
531 0.74
532 0.73
533 0.68
534 0.62
535 0.64
536 0.66
537 0.72
538 0.71
539 0.68
540 0.69
541 0.67
542 0.7
543 0.68
544 0.65
545 0.63
546 0.61
547 0.6
548 0.57
549 0.64
550 0.64
551 0.64
552 0.67
553 0.64
554 0.6
555 0.57
556 0.57
557 0.54
558 0.47
559 0.41
560 0.31
561 0.26
562 0.23
563 0.2
564 0.16
565 0.09
566 0.09