Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165D171

Protein Details
Accession A0A165D171    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-253GSPSTAKRSKIREKEKRKEFGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-249HKREGSPSTAKRSKIREKEKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041260  Sld7_C  
Pfam View protein in Pfam  
PF18596  Sld7_C  
Amino Acid Sequences MDSLSHQFTTSESIPQGTLNVSTHRLLYRGALSLPDSHLLLDGLSFTAALKRPGESANTIYDSSFDLLNHPLALALESMRGRPSLHLLGTVKLGEVWIDEKSIGVVQLDVHPKAALSRLYFENVFCLEPIISKDGKSEYGVRVSLSDSNDPSSSDILIYAQLQSSDLEEIEANHLDSPSTTTLPKILRLLVARILPGPPPVPAPPRPRPDDPTPRVPSVFSSYVNTKHKREGSPSTAKRSKIREKEKRKEFGNATHTFEKGRETMTRPLRPPSSAAPNKGSKNADFKVPQVPRFVGTSSTQRDERKRINTPRSMAEATFDMFAVGDSVSSPDEQEKTNKTVIKKAVVRCLADHAINKQHPEFNDIFGHVYQGTCFAMRAQMRNVPVDLWNVYKFVDAHAKMYLHSGSEGPGPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.22
4 0.17
5 0.18
6 0.16
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.23
11 0.23
12 0.23
13 0.21
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.2
19 0.2
20 0.23
21 0.24
22 0.22
23 0.19
24 0.16
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.11
35 0.13
36 0.16
37 0.16
38 0.17
39 0.19
40 0.21
41 0.25
42 0.23
43 0.24
44 0.26
45 0.28
46 0.28
47 0.25
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.13
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.07
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.19
71 0.19
72 0.19
73 0.24
74 0.24
75 0.25
76 0.26
77 0.24
78 0.19
79 0.15
80 0.14
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.13
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.18
102 0.15
103 0.13
104 0.17
105 0.18
106 0.21
107 0.21
108 0.2
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.13
113 0.13
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.19
125 0.18
126 0.21
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.19
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.13
170 0.14
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.15
189 0.21
190 0.29
191 0.36
192 0.41
193 0.46
194 0.47
195 0.51
196 0.56
197 0.6
198 0.57
199 0.59
200 0.57
201 0.54
202 0.51
203 0.45
204 0.38
205 0.33
206 0.3
207 0.21
208 0.19
209 0.2
210 0.26
211 0.33
212 0.35
213 0.32
214 0.36
215 0.41
216 0.41
217 0.44
218 0.44
219 0.45
220 0.52
221 0.54
222 0.57
223 0.57
224 0.57
225 0.57
226 0.59
227 0.6
228 0.6
229 0.67
230 0.68
231 0.74
232 0.82
233 0.86
234 0.84
235 0.77
236 0.75
237 0.68
238 0.66
239 0.63
240 0.57
241 0.53
242 0.48
243 0.46
244 0.38
245 0.35
246 0.29
247 0.21
248 0.2
249 0.18
250 0.2
251 0.28
252 0.36
253 0.42
254 0.42
255 0.47
256 0.46
257 0.44
258 0.42
259 0.39
260 0.41
261 0.39
262 0.41
263 0.41
264 0.45
265 0.46
266 0.49
267 0.47
268 0.39
269 0.42
270 0.39
271 0.4
272 0.35
273 0.35
274 0.39
275 0.4
276 0.4
277 0.36
278 0.36
279 0.31
280 0.32
281 0.3
282 0.23
283 0.22
284 0.27
285 0.27
286 0.3
287 0.33
288 0.37
289 0.43
290 0.48
291 0.53
292 0.54
293 0.6
294 0.66
295 0.71
296 0.72
297 0.7
298 0.67
299 0.65
300 0.59
301 0.49
302 0.41
303 0.33
304 0.26
305 0.23
306 0.18
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.19
322 0.23
323 0.26
324 0.32
325 0.36
326 0.35
327 0.42
328 0.45
329 0.48
330 0.51
331 0.52
332 0.56
333 0.57
334 0.56
335 0.49
336 0.51
337 0.45
338 0.41
339 0.39
340 0.35
341 0.39
342 0.4
343 0.42
344 0.39
345 0.4
346 0.37
347 0.41
348 0.37
349 0.31
350 0.32
351 0.3
352 0.29
353 0.24
354 0.26
355 0.2
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.13
360 0.11
361 0.12
362 0.1
363 0.17
364 0.2
365 0.24
366 0.27
367 0.31
368 0.33
369 0.36
370 0.36
371 0.3
372 0.29
373 0.29
374 0.27
375 0.25
376 0.24
377 0.22
378 0.21
379 0.22
380 0.21
381 0.21
382 0.28
383 0.25
384 0.26
385 0.3
386 0.3
387 0.28
388 0.32
389 0.29
390 0.2
391 0.21
392 0.19
393 0.16