Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4UG43

Protein Details
Accession J4UG43    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-442LATWKTNRRGNYHRKRRRWARTRQIVDGTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-432NYHRKRRRWA
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MPRNTVQPNAWVALKLPSGNVKILQITPNTTVSLGKYGSFPSNLLLDRPYHLTYEVQDKREPETFSRLRVVPGTELNADALIDTTAEDEAANATPEAEPAAENSDDVNEAMIAAAVGEELALADGEEEIVEGSTEKSVVTRKTFDERARQTLTTEEIEELKRKGAGAGREIVAKLLVRHTAIDQKTAYSLAKYKLLKEKKYVRRFTVLPLDVPMLAQWMLEDKDASKILEMRQELLALVGCWADVHFGGLPVEGATTPHGGRWLAVDDTGGLLVVAMAERMGILYRDENEEDLQEDETEPVPAQDPATEDANGGVEEDAASTTTRPPPRKRPYKDDLAPHYALRNSITVVHANSQPNLSLLRYFGFDASDPNPQEPYHPLATHLLPVSWLQVLSPDDDPAYADRPADVPLEELATWKTNRRGNYHRKRRRWARTRQIVDGTRAGGFAGLAVASTMDPVSVLRSALPLLAGGSPVAIYSPTVEPLAQLADCFSIGRRAAWVTSPPPAAEGKSLTELESWDGSAEFPINPTLMVGVSVQTSRAKRWQVLPGRTHPLMMGKGGAEGYLFTGWRAIPAEGRISARGKFTKRRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.23
3 0.21
4 0.25
5 0.27
6 0.29
7 0.29
8 0.26
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.28
13 0.29
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.24
19 0.22
20 0.24
21 0.21
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.22
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.25
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.23
41 0.32
42 0.35
43 0.34
44 0.36
45 0.37
46 0.4
47 0.44
48 0.45
49 0.38
50 0.42
51 0.41
52 0.42
53 0.47
54 0.43
55 0.39
56 0.39
57 0.38
58 0.31
59 0.31
60 0.31
61 0.25
62 0.25
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.13
67 0.1
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.11
125 0.16
126 0.19
127 0.22
128 0.25
129 0.32
130 0.39
131 0.42
132 0.48
133 0.49
134 0.52
135 0.54
136 0.51
137 0.45
138 0.41
139 0.39
140 0.3
141 0.26
142 0.2
143 0.18
144 0.2
145 0.22
146 0.2
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.23
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.14
167 0.21
168 0.21
169 0.23
170 0.21
171 0.2
172 0.21
173 0.22
174 0.2
175 0.14
176 0.18
177 0.16
178 0.23
179 0.23
180 0.27
181 0.35
182 0.43
183 0.44
184 0.49
185 0.58
186 0.62
187 0.71
188 0.73
189 0.67
190 0.65
191 0.63
192 0.6
193 0.59
194 0.5
195 0.4
196 0.35
197 0.32
198 0.25
199 0.24
200 0.18
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.05
258 0.03
259 0.03
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.06
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.13
311 0.19
312 0.25
313 0.31
314 0.41
315 0.52
316 0.62
317 0.67
318 0.7
319 0.71
320 0.75
321 0.74
322 0.72
323 0.68
324 0.64
325 0.58
326 0.5
327 0.46
328 0.36
329 0.31
330 0.24
331 0.18
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.12
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.19
360 0.18
361 0.19
362 0.19
363 0.22
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.21
368 0.22
369 0.22
370 0.2
371 0.15
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.06
378 0.09
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.1
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.13
402 0.14
403 0.17
404 0.23
405 0.25
406 0.29
407 0.36
408 0.45
409 0.53
410 0.63
411 0.71
412 0.75
413 0.81
414 0.88
415 0.92
416 0.92
417 0.91
418 0.91
419 0.91
420 0.91
421 0.87
422 0.83
423 0.81
424 0.73
425 0.67
426 0.58
427 0.48
428 0.38
429 0.32
430 0.25
431 0.16
432 0.12
433 0.08
434 0.06
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.03
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.13
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.12
480 0.13
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.19
486 0.23
487 0.2
488 0.25
489 0.26
490 0.24
491 0.25
492 0.25
493 0.24
494 0.22
495 0.21
496 0.19
497 0.22
498 0.22
499 0.21
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.18
504 0.15
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.09
522 0.09
523 0.11
524 0.16
525 0.18
526 0.22
527 0.29
528 0.34
529 0.37
530 0.43
531 0.51
532 0.56
533 0.63
534 0.66
535 0.66
536 0.69
537 0.65
538 0.59
539 0.5
540 0.46
541 0.39
542 0.33
543 0.27
544 0.19
545 0.2
546 0.19
547 0.17
548 0.12
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.09
554 0.12
555 0.11
556 0.14
557 0.16
558 0.15
559 0.16
560 0.19
561 0.24
562 0.24
563 0.27
564 0.29
565 0.3
566 0.31
567 0.35
568 0.41
569 0.44