Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4KPY1

Protein Details
Accession J4KPY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-466EREWEEARLRRRQKRKDGTLETTTHydrophilic
484-505PESDKAMTKKEQKKNQAMKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-458ARLRRRQKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.333, mito 6.5, cyto_mito 5.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQSQVPARAYSPPQPTPSPAGSQSGYALPPNKRVGASSQPGSPYMATSYAASPGAAGSPPTAGSPTYAQTPPVQGGYNTPYANGTPVYNVAEARAAAAAAAAANANATISPMQQHQQIPAMMTPYTNATLMPAMQQGQQQMQQNVMGPPQRPAERPAKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSELYSNAMDGNQDARTGFAVYPPTGANSFYGAGPASQPAEMIKDQSQKDYEAHVAERLWKESAMRLAAQRTQEIADPFLFVAIMHRRADKIAREHHLGLNLELRGNTYAPGKLRHPDQFPTPSVNVKTQPGPDSTMVSTTGSFIPHDAYLVDQFALLSISTKQRLRELLEDANAIALNRQKTSHGDIPEEWAAAAAPMNKEVLEVVEAPNAEGRSEVGDGSLKRTWDQANGEVNTKPAKLPKISSYMTVTMRELAKREREWEEARLRRRQKRKDGTLETTTAGPKSGSAAPGTPGTVAPESDKAMTKKEQKKNQAMKAAEANSHANQNLTSSMFAGLGGKSGLFGKSKRKTYDWMNVGRGGSGASTPVKSSSDGGKVVNGMGPSTPTNLALTTEGRNRLGTWREDKEKGRNIQLRDWIAVLERDGREAQMLQHAYLQLDSSNPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.51
4 0.5
5 0.52
6 0.52
7 0.51
8 0.48
9 0.42
10 0.41
11 0.36
12 0.34
13 0.32
14 0.29
15 0.26
16 0.25
17 0.3
18 0.28
19 0.34
20 0.37
21 0.38
22 0.36
23 0.36
24 0.38
25 0.41
26 0.44
27 0.41
28 0.41
29 0.39
30 0.4
31 0.4
32 0.34
33 0.26
34 0.21
35 0.2
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.09
53 0.11
54 0.13
55 0.14
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.18
65 0.22
66 0.25
67 0.28
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.24
73 0.2
74 0.16
75 0.12
76 0.14
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.04
90 0.05
91 0.04
92 0.03
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.08
101 0.1
102 0.12
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.24
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.19
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.22
129 0.26
130 0.25
131 0.25
132 0.24
133 0.25
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.2
138 0.22
139 0.27
140 0.28
141 0.28
142 0.32
143 0.38
144 0.39
145 0.42
146 0.44
147 0.44
148 0.42
149 0.42
150 0.39
151 0.33
152 0.3
153 0.27
154 0.22
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.21
216 0.22
217 0.25
218 0.26
219 0.24
220 0.25
221 0.25
222 0.23
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.16
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.19
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.2
240 0.21
241 0.19
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.2
261 0.21
262 0.24
263 0.27
264 0.31
265 0.34
266 0.35
267 0.35
268 0.36
269 0.32
270 0.26
271 0.23
272 0.2
273 0.16
274 0.14
275 0.14
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.14
283 0.14
284 0.16
285 0.2
286 0.24
287 0.26
288 0.26
289 0.3
290 0.32
291 0.32
292 0.33
293 0.3
294 0.29
295 0.28
296 0.28
297 0.25
298 0.22
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.19
303 0.21
304 0.19
305 0.19
306 0.17
307 0.16
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.06
331 0.08
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.17
336 0.19
337 0.22
338 0.23
339 0.25
340 0.25
341 0.24
342 0.23
343 0.21
344 0.19
345 0.16
346 0.12
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.14
354 0.21
355 0.25
356 0.24
357 0.25
358 0.25
359 0.29
360 0.28
361 0.26
362 0.19
363 0.14
364 0.11
365 0.09
366 0.1
367 0.07
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.1
391 0.1
392 0.15
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.23
400 0.24
401 0.29
402 0.3
403 0.32
404 0.29
405 0.3
406 0.27
407 0.25
408 0.2
409 0.18
410 0.21
411 0.21
412 0.24
413 0.27
414 0.32
415 0.33
416 0.34
417 0.33
418 0.34
419 0.33
420 0.32
421 0.27
422 0.24
423 0.25
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.28
428 0.27
429 0.32
430 0.32
431 0.36
432 0.38
433 0.43
434 0.48
435 0.5
436 0.55
437 0.6
438 0.65
439 0.69
440 0.76
441 0.78
442 0.79
443 0.83
444 0.86
445 0.88
446 0.87
447 0.84
448 0.79
449 0.71
450 0.6
451 0.52
452 0.43
453 0.32
454 0.24
455 0.17
456 0.12
457 0.13
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.15
463 0.16
464 0.17
465 0.14
466 0.11
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.21
475 0.19
476 0.23
477 0.3
478 0.38
479 0.47
480 0.55
481 0.62
482 0.67
483 0.77
484 0.82
485 0.83
486 0.82
487 0.73
488 0.68
489 0.66
490 0.59
491 0.49
492 0.42
493 0.38
494 0.31
495 0.32
496 0.28
497 0.21
498 0.18
499 0.18
500 0.17
501 0.14
502 0.13
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.1
515 0.12
516 0.15
517 0.25
518 0.33
519 0.41
520 0.46
521 0.48
522 0.52
523 0.58
524 0.65
525 0.63
526 0.62
527 0.58
528 0.57
529 0.54
530 0.48
531 0.4
532 0.3
533 0.22
534 0.14
535 0.13
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.18
543 0.21
544 0.24
545 0.25
546 0.25
547 0.25
548 0.25
549 0.24
550 0.24
551 0.19
552 0.14
553 0.12
554 0.14
555 0.14
556 0.16
557 0.16
558 0.14
559 0.15
560 0.15
561 0.16
562 0.16
563 0.18
564 0.2
565 0.25
566 0.28
567 0.29
568 0.29
569 0.29
570 0.33
571 0.37
572 0.39
573 0.41
574 0.46
575 0.51
576 0.57
577 0.63
578 0.66
579 0.69
580 0.68
581 0.71
582 0.69
583 0.67
584 0.68
585 0.7
586 0.64
587 0.56
588 0.5
589 0.4
590 0.36
591 0.33
592 0.27
593 0.26
594 0.22
595 0.24
596 0.24
597 0.23
598 0.23
599 0.23
600 0.23
601 0.24
602 0.25
603 0.23
604 0.26
605 0.26
606 0.25
607 0.24
608 0.23
609 0.15