Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JXS7

Protein Details
Accession J5JXS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-496NGEVKKVPPKAPPPRRRGKMKVAEPPPIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
472-488KKVPPKAPPPRRRGKMK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 9.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MTLADVEGGAFSEEEEQQLWTDIDTCVSSPCDDHESIDDALRTWLGLTARLRDRPPGSQEGCVMCANMLINSQIFQRNQEYVRTQLIHSLLQEDNVASLHAITSLLLLDGHYDESVFPRMLQEQCFPRLVELIAAKEDDEDARLHRFLLQLMYEMSRVERLRPAELVLVDDEFIHSLFRIIEGVSNDVHDPYHYPTIRVLLVLNEQYMLASTEPIEGPDGRQAPLTNRIVKCLSLHGPSYRTFGENIILLLNRETETSLQLLILKLLYLLFTTKATYEYFYTNDLRVLLDVIIRNLMDLPDERISLRHTYLRVLYPLLAHTQLSHPPHYKQDEILKVLKILRGSLNAHFAPADDTTVRLVDRVAKVKWLEAGNLDGASEVARKFLGISLSPTQYASSISVGDVAGVMEKPGVQTPSRNAGNGARSRDAPSPTQDEVNTTVRAKKPLPTVPKHRHGVPFQNFADKPVMNGEVKKVPPKAPPPRRRGKMKVAEPPPIETIRETPPEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.12
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.16
18 0.2
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.24
23 0.25
24 0.27
25 0.24
26 0.19
27 0.2
28 0.18
29 0.15
30 0.11
31 0.13
32 0.11
33 0.16
34 0.18
35 0.25
36 0.31
37 0.37
38 0.38
39 0.42
40 0.45
41 0.46
42 0.51
43 0.52
44 0.49
45 0.47
46 0.5
47 0.45
48 0.44
49 0.37
50 0.31
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.13
60 0.17
61 0.17
62 0.21
63 0.24
64 0.28
65 0.29
66 0.34
67 0.34
68 0.32
69 0.38
70 0.36
71 0.32
72 0.32
73 0.33
74 0.29
75 0.26
76 0.27
77 0.21
78 0.19
79 0.2
80 0.15
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.09
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.16
107 0.18
108 0.21
109 0.24
110 0.26
111 0.29
112 0.31
113 0.29
114 0.26
115 0.25
116 0.22
117 0.2
118 0.17
119 0.16
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.13
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.21
150 0.22
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.15
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.17
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.22
212 0.25
213 0.28
214 0.27
215 0.3
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.24
220 0.23
221 0.18
222 0.19
223 0.18
224 0.2
225 0.2
226 0.22
227 0.19
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.2
298 0.21
299 0.2
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.17
310 0.19
311 0.22
312 0.23
313 0.25
314 0.31
315 0.34
316 0.33
317 0.31
318 0.36
319 0.37
320 0.38
321 0.4
322 0.34
323 0.32
324 0.33
325 0.31
326 0.23
327 0.2
328 0.18
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.24
333 0.22
334 0.22
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.14
339 0.15
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.09
346 0.09
347 0.13
348 0.17
349 0.22
350 0.21
351 0.25
352 0.25
353 0.27
354 0.31
355 0.26
356 0.22
357 0.19
358 0.2
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.15
375 0.19
376 0.21
377 0.22
378 0.21
379 0.2
380 0.18
381 0.18
382 0.15
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.09
398 0.12
399 0.12
400 0.16
401 0.2
402 0.29
403 0.3
404 0.3
405 0.3
406 0.33
407 0.4
408 0.42
409 0.43
410 0.37
411 0.37
412 0.41
413 0.44
414 0.42
415 0.37
416 0.36
417 0.37
418 0.36
419 0.38
420 0.34
421 0.32
422 0.34
423 0.34
424 0.32
425 0.28
426 0.33
427 0.33
428 0.38
429 0.37
430 0.38
431 0.43
432 0.48
433 0.56
434 0.59
435 0.66
436 0.71
437 0.78
438 0.77
439 0.75
440 0.74
441 0.72
442 0.74
443 0.7
444 0.69
445 0.61
446 0.66
447 0.59
448 0.54
449 0.53
450 0.42
451 0.36
452 0.31
453 0.34
454 0.27
455 0.28
456 0.31
457 0.32
458 0.36
459 0.41
460 0.42
461 0.42
462 0.49
463 0.58
464 0.64
465 0.68
466 0.75
467 0.78
468 0.84
469 0.88
470 0.9
471 0.88
472 0.88
473 0.87
474 0.87
475 0.87
476 0.83
477 0.83
478 0.75
479 0.7
480 0.64
481 0.56
482 0.48
483 0.4
484 0.37
485 0.35