Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5K184

Protein Details
Accession J5K184    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-208GSGSGHKRHHQRPQPPHRNSBasic
253-275GRDQRNNKRKHDHHQNRPKDIKEBasic
469-496VNADERPTKRFRRTSRDRDRDRSRSTSRBasic
557-586DSEPRRRPERIVPPKAKHRKPTNSAFSRRWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-216RHHQRPQPPHRNSAPSPPKSR
257-277RNNKRKHDHHQNRPKDIKEHH
560-578PRRRPERIVPPKAKHRKPT
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTDQVVTHPGRTEEPQCYNCGGMGHWAVACPEPTRETPAGLAAWRNASATRQGSSRAQHNDGRKSKGPIITKYGPPPPPTGYGAHYPPPPVYPPPHNSYTVPPPQPPPYPPQYHYPPGHGQQPLPPPPPSHGHYPPPPYPPPSESYSAQQSRPPYPGPSQEYGGYPYAGQDSHQFVPPRPAYSGSYAQGSGSGHKRHHQRPQPPHRNSAPSPPKSRAIHVTSPPKPPASSPPVPITHGLPPKPPKSVHDIDHGRDQRNNKRKHDHHQNRPKDIKEHHPGRNHGSPKAMPAVHNHHVQSNASAQHHHGSQNWQAKQHSNRRRSSAGNHGSNQPRMQRQQSRDSLNQHPQRSPRAPEGHRRISNGEQHHGSPNPNKTGDKPKRDSHTPKATETTPTFIKSVPSLPPKPNTAVESHVLKLPDDHATSVLLNSPRLSEANIRGIDGNRDRNRDHSSSTARNGTRSESSVPEDVNADERPTKRFRRTSRDRDRDRSRSTSRYRNSDDLPPLDRQRSRSLQRRTSLSRSPRSRRSSVSSRSSDLNSLEAELLGVSAARRLSTDSEPRRRPERIVPPKAKHRKPTNSAFSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.43
4 0.43
5 0.4
6 0.36
7 0.32
8 0.24
9 0.22
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.15
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.28
22 0.27
23 0.27
24 0.27
25 0.28
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.2
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.24
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.27
40 0.31
41 0.35
42 0.41
43 0.41
44 0.44
45 0.48
46 0.55
47 0.61
48 0.62
49 0.65
50 0.62
51 0.62
52 0.63
53 0.64
54 0.63
55 0.58
56 0.6
57 0.59
58 0.59
59 0.6
60 0.61
61 0.59
62 0.55
63 0.54
64 0.49
65 0.47
66 0.44
67 0.4
68 0.35
69 0.35
70 0.36
71 0.37
72 0.35
73 0.32
74 0.3
75 0.31
76 0.31
77 0.3
78 0.32
79 0.35
80 0.4
81 0.44
82 0.47
83 0.47
84 0.46
85 0.47
86 0.5
87 0.51
88 0.48
89 0.46
90 0.47
91 0.49
92 0.52
93 0.49
94 0.47
95 0.47
96 0.5
97 0.49
98 0.52
99 0.54
100 0.58
101 0.57
102 0.56
103 0.53
104 0.5
105 0.54
106 0.48
107 0.42
108 0.41
109 0.48
110 0.49
111 0.46
112 0.45
113 0.39
114 0.41
115 0.45
116 0.41
117 0.4
118 0.39
119 0.42
120 0.47
121 0.53
122 0.55
123 0.56
124 0.57
125 0.52
126 0.51
127 0.47
128 0.43
129 0.41
130 0.4
131 0.35
132 0.35
133 0.41
134 0.4
135 0.38
136 0.38
137 0.38
138 0.37
139 0.39
140 0.37
141 0.31
142 0.32
143 0.39
144 0.42
145 0.4
146 0.39
147 0.37
148 0.36
149 0.35
150 0.31
151 0.23
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.16
159 0.17
160 0.22
161 0.22
162 0.21
163 0.31
164 0.32
165 0.31
166 0.27
167 0.29
168 0.26
169 0.3
170 0.34
171 0.26
172 0.26
173 0.23
174 0.22
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.2
179 0.22
180 0.22
181 0.28
182 0.37
183 0.42
184 0.52
185 0.57
186 0.61
187 0.68
188 0.79
189 0.84
190 0.79
191 0.8
192 0.75
193 0.74
194 0.66
195 0.65
196 0.64
197 0.6
198 0.61
199 0.57
200 0.59
201 0.53
202 0.54
203 0.5
204 0.47
205 0.46
206 0.48
207 0.54
208 0.52
209 0.55
210 0.54
211 0.48
212 0.42
213 0.37
214 0.38
215 0.37
216 0.35
217 0.33
218 0.36
219 0.37
220 0.38
221 0.37
222 0.32
223 0.3
224 0.32
225 0.29
226 0.31
227 0.35
228 0.36
229 0.39
230 0.37
231 0.33
232 0.36
233 0.4
234 0.36
235 0.39
236 0.41
237 0.38
238 0.47
239 0.48
240 0.42
241 0.41
242 0.45
243 0.45
244 0.51
245 0.57
246 0.55
247 0.61
248 0.65
249 0.71
250 0.76
251 0.77
252 0.78
253 0.81
254 0.83
255 0.81
256 0.82
257 0.74
258 0.68
259 0.62
260 0.6
261 0.59
262 0.59
263 0.56
264 0.57
265 0.57
266 0.57
267 0.61
268 0.54
269 0.46
270 0.41
271 0.34
272 0.3
273 0.32
274 0.27
275 0.2
276 0.22
277 0.28
278 0.28
279 0.31
280 0.29
281 0.25
282 0.26
283 0.25
284 0.22
285 0.18
286 0.18
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.15
294 0.16
295 0.22
296 0.3
297 0.3
298 0.31
299 0.32
300 0.37
301 0.43
302 0.5
303 0.52
304 0.53
305 0.55
306 0.57
307 0.59
308 0.56
309 0.53
310 0.53
311 0.52
312 0.48
313 0.46
314 0.48
315 0.48
316 0.48
317 0.46
318 0.39
319 0.36
320 0.35
321 0.42
322 0.43
323 0.44
324 0.51
325 0.55
326 0.56
327 0.56
328 0.58
329 0.57
330 0.58
331 0.6
332 0.54
333 0.52
334 0.49
335 0.53
336 0.51
337 0.48
338 0.46
339 0.48
340 0.49
341 0.55
342 0.6
343 0.62
344 0.6
345 0.58
346 0.55
347 0.51
348 0.54
349 0.48
350 0.43
351 0.35
352 0.34
353 0.36
354 0.33
355 0.32
356 0.31
357 0.33
358 0.33
359 0.34
360 0.33
361 0.34
362 0.44
363 0.49
364 0.53
365 0.53
366 0.55
367 0.6
368 0.68
369 0.71
370 0.69
371 0.71
372 0.65
373 0.62
374 0.59
375 0.54
376 0.5
377 0.44
378 0.38
379 0.3
380 0.28
381 0.26
382 0.23
383 0.23
384 0.18
385 0.2
386 0.23
387 0.28
388 0.32
389 0.35
390 0.38
391 0.4
392 0.42
393 0.42
394 0.37
395 0.32
396 0.3
397 0.29
398 0.29
399 0.26
400 0.25
401 0.23
402 0.21
403 0.19
404 0.18
405 0.19
406 0.16
407 0.16
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.17
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.14
419 0.16
420 0.16
421 0.19
422 0.26
423 0.26
424 0.26
425 0.26
426 0.27
427 0.32
428 0.32
429 0.38
430 0.36
431 0.4
432 0.4
433 0.44
434 0.5
435 0.45
436 0.43
437 0.41
438 0.44
439 0.45
440 0.49
441 0.52
442 0.46
443 0.46
444 0.44
445 0.4
446 0.36
447 0.33
448 0.31
449 0.26
450 0.29
451 0.29
452 0.28
453 0.24
454 0.22
455 0.2
456 0.2
457 0.18
458 0.17
459 0.2
460 0.21
461 0.25
462 0.32
463 0.39
464 0.45
465 0.54
466 0.6
467 0.66
468 0.76
469 0.81
470 0.85
471 0.89
472 0.88
473 0.89
474 0.91
475 0.89
476 0.86
477 0.84
478 0.79
479 0.79
480 0.78
481 0.78
482 0.75
483 0.75
484 0.74
485 0.71
486 0.67
487 0.66
488 0.64
489 0.59
490 0.55
491 0.52
492 0.51
493 0.53
494 0.52
495 0.48
496 0.5
497 0.55
498 0.6
499 0.64
500 0.68
501 0.69
502 0.72
503 0.76
504 0.75
505 0.73
506 0.74
507 0.74
508 0.74
509 0.75
510 0.78
511 0.8
512 0.8
513 0.78
514 0.75
515 0.74
516 0.74
517 0.72
518 0.73
519 0.68
520 0.63
521 0.62
522 0.58
523 0.53
524 0.44
525 0.37
526 0.27
527 0.24
528 0.22
529 0.17
530 0.15
531 0.1
532 0.09
533 0.07
534 0.07
535 0.05
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.11
541 0.16
542 0.23
543 0.34
544 0.42
545 0.52
546 0.59
547 0.65
548 0.7
549 0.69
550 0.67
551 0.67
552 0.68
553 0.69
554 0.74
555 0.77
556 0.79
557 0.87
558 0.92
559 0.9
560 0.89
561 0.89
562 0.89
563 0.87
564 0.89
565 0.89
566 0.88