FuNGI

J4WMG5

Protein Details

Accession

J4WMG5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	GLTSNPVRKKPLRPAINKTVPA	Hydrophilic
76-99	SYMKNLTKPKVPKRRSKDDEIADS	Hydrophilic
140-160	SDKKVSAKKPVLKQKASKKTS	Hydrophilic
524-568	IERTGASPKARQKKDKKRKEASDPKESTRKSKKSKRDHTISEDKD	Basic
577-600	KESVSASSKPKKRKTAPIGSPDLG	Hydrophilic
669-697	GFKKPAASRKTPVKKKATQETKRHEQADP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
145-158	SAKKPVLKQKASKK
530-559	SPKARQKKDKKRKEASDPKESTRKSKKSKR
586-590	PKKRK
671-685	KKPAASRKTPVKKKA

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPFKVHSLQKYIQEANKGLTSNPVRKKPLRPAINKTVPAAAASIFPDNSDSDSGNSSSESSGSDDSDSDGPSYMKNLTKPKVPKRRSKDDEIADSDVERTSTADKSKPAKKTSASVKVKAPPSSDDDPSGSDPESSDKKVSAKKPVLKQKASKKTSASVKVKAPPSSDDDPSGSDPESSDEKVSAKKPVLKQEASSTSASSSPSDSGSDSASSSSSEDSSSVKEESSESEGKAALAKPTAPVKKPASKTSPAKQRESSSNDSTSGESESESDKESEPAAKPKNKPIVNGTKPMTATAEPTESNATSNGSSEEESSSGSEDGGESSDDEEVDESMHIAERAQGSQAALPTFLPPDFELRKSEQQSNGQDVARVCSEANQQGKQLWYFTLPANVPVSVVENLEFPLDSSQQCGSILRQNGEDYGVSFDSMPPTKSIQILIHPADGSTYEPSRHAVNEVMQIRRITEIGVTTATPADVGSSAKIARPQPKGLTARFRPIGVKSDVGTHHPDAHSEEDVEMRDIERTGASPKARQKKDKKRKEASDPKESTRKSKKSKRDHTISEDKDAAAAEQLMKESVSASSKPKKRKTAPIGSPDLGSEGGHLPVKQTLVVPPAIPTSSATVPATPTPAKKTKMGKSSEDKPATPLSQVSSGAKKETPVPVPVLPGFKKPAASRKTPVKKKATQETKRHEQADPKLPL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.65
3	0.61
4	0.59
5	0.51
6	0.48
7	0.47
8	0.4
9	0.33
10	0.36
11	0.4
12	0.43
13	0.5
14	0.55
15	0.59
16	0.66
17	0.74
18	0.76
19	0.79
20	0.8
21	0.8
22	0.81
23	0.83
24	0.86
25	0.8
26	0.71
27	0.64
28	0.54
29	0.46
30	0.37
31	0.27
32	0.19
33	0.18
34	0.19
35	0.14
36	0.14
37	0.15
38	0.15
39	0.17
40	0.17
41	0.16
42	0.14
43	0.17
44	0.18
45	0.17
46	0.16
47	0.15
48	0.14
49	0.13
50	0.13
51	0.13
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.13
56	0.16
57	0.17
58	0.17
59	0.14
60	0.15
61	0.14
62	0.14
63	0.16
64	0.17
65	0.19
66	0.25
67	0.32
68	0.35
69	0.43
70	0.53
71	0.61
72	0.68
73	0.73
74	0.78
75	0.79
76	0.86
77	0.85
78	0.85
79	0.83
80	0.8
81	0.8
82	0.74
83	0.68
84	0.58
85	0.51
86	0.42
87	0.33
88	0.25
89	0.16
90	0.12
91	0.11
92	0.15
93	0.18
94	0.21
95	0.27
96	0.35
97	0.42
98	0.49
99	0.52
100	0.55
101	0.54
102	0.59
103	0.62
104	0.65
105	0.64
106	0.61
107	0.63
108	0.63
109	0.66
110	0.61
111	0.54
112	0.46
113	0.46
114	0.46
115	0.42
116	0.37
117	0.32
118	0.32
119	0.32
120	0.3
121	0.24
122	0.19
123	0.18
124	0.2
125	0.23
126	0.22
127	0.22
128	0.22
129	0.27
130	0.35
131	0.4
132	0.45
133	0.5
134	0.55
135	0.63
136	0.72
137	0.76
138	0.76
139	0.8
140	0.8
141	0.82
142	0.78
143	0.74
144	0.67
145	0.65
146	0.66
147	0.68
148	0.63
149	0.58
150	0.61
151	0.63
152	0.65
153	0.6
154	0.54
155	0.47
156	0.48
157	0.46
158	0.42
159	0.37
160	0.32
161	0.32
162	0.32
163	0.3
164	0.24
165	0.19
166	0.17
167	0.18
168	0.19
169	0.17
170	0.15
171	0.15
172	0.16
173	0.2
174	0.22
175	0.24
176	0.26
177	0.32
178	0.36
179	0.45
180	0.51
181	0.48
182	0.48
183	0.51
184	0.51
185	0.48
186	0.43
187	0.34
188	0.27
189	0.27
190	0.26
191	0.19
192	0.15
193	0.12
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.12
212	0.12
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.13
217	0.17
218	0.18
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.16
223	0.18
224	0.16
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.13
229	0.2
230	0.25
231	0.23
232	0.3
233	0.34
234	0.42
235	0.46
236	0.5
237	0.49
238	0.53
239	0.59
240	0.6
241	0.64
242	0.61
243	0.63
244	0.6
245	0.58
246	0.57
247	0.58
248	0.55
249	0.5
250	0.46
251	0.42
252	0.39
253	0.35
254	0.28
255	0.22
256	0.16
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.21
269	0.27
270	0.33
271	0.35
272	0.42
273	0.51
274	0.49
275	0.5
276	0.5
277	0.54
278	0.51
279	0.55
280	0.49
281	0.43
282	0.42
283	0.4
284	0.34
285	0.23
286	0.21
287	0.16
288	0.16
289	0.12
290	0.13
291	0.14
292	0.12
293	0.13
294	0.11
295	0.11
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.11
345	0.13
346	0.14
347	0.17
348	0.2
349	0.27
350	0.29
351	0.33
352	0.32
353	0.37
354	0.38
355	0.4
356	0.39
357	0.32
358	0.31
359	0.28
360	0.26
361	0.19
362	0.17
363	0.12
364	0.12
365	0.14
366	0.17
367	0.2
368	0.18
369	0.19
370	0.2
371	0.21
372	0.19
373	0.18
374	0.13
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.14
379	0.13
380	0.15
381	0.15
382	0.14
383	0.13
384	0.11
385	0.13
386	0.1
387	0.1
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.05
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.15
404	0.18
405	0.16
406	0.17
407	0.17
408	0.17
409	0.18
410	0.16
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.11
421	0.13
422	0.14
423	0.14
424	0.16
425	0.14
426	0.16
427	0.2
428	0.2
429	0.2
430	0.18
431	0.17
432	0.15
433	0.15
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.1
438	0.11
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.13
445	0.2
446	0.23
447	0.23
448	0.25
449	0.24
450	0.23
451	0.22
452	0.2
453	0.13
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.14
472	0.18
473	0.25
474	0.29
475	0.33
476	0.35
477	0.43
478	0.47
479	0.47
480	0.52
481	0.47
482	0.51
483	0.48
484	0.46
485	0.41
486	0.38
487	0.39
488	0.32
489	0.31
490	0.23
491	0.27
492	0.27
493	0.28
494	0.3
495	0.25
496	0.28
497	0.26
498	0.27
499	0.24
500	0.26
501	0.24
502	0.2
503	0.19
504	0.15
505	0.16
506	0.16
507	0.13
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.16
516	0.17
517	0.23
518	0.32
519	0.42
520	0.49
521	0.58
522	0.67
523	0.73
524	0.82
525	0.87
526	0.89
527	0.89
528	0.91
529	0.92
530	0.92
531	0.89
532	0.89
533	0.82
534	0.78
535	0.77
536	0.69
537	0.68
538	0.68
539	0.7
540	0.69
541	0.75
542	0.78
543	0.8
544	0.9
545	0.9
546	0.89
547	0.87
548	0.85
549	0.86
550	0.79
551	0.73
552	0.64
553	0.53
554	0.45
555	0.37
556	0.28
557	0.18
558	0.15
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.12
568	0.14
569	0.21
570	0.3
571	0.37
572	0.48
573	0.56
574	0.64
575	0.69
576	0.78
577	0.81
578	0.83
579	0.85
580	0.84
581	0.82
582	0.73
583	0.65
584	0.54
585	0.46
586	0.35
587	0.26
588	0.19
589	0.12
590	0.13
591	0.14
592	0.14
593	0.13
594	0.15
595	0.16
596	0.15
597	0.15
598	0.16
599	0.17
600	0.19
601	0.18
602	0.17
603	0.19
604	0.18
605	0.17
606	0.15
607	0.17
608	0.17
609	0.2
610	0.19
611	0.18
612	0.2
613	0.2
614	0.25
615	0.23
616	0.26
617	0.31
618	0.37
619	0.4
620	0.45
621	0.53
622	0.56
623	0.62
624	0.64
625	0.65
626	0.66
627	0.71
628	0.74
629	0.7
630	0.62
631	0.57
632	0.58
633	0.5
634	0.44
635	0.37
636	0.3
637	0.29
638	0.31
639	0.31
640	0.31
641	0.31
642	0.33
643	0.32
644	0.3
645	0.32
646	0.37
647	0.37
648	0.34
649	0.37
650	0.35
651	0.39
652	0.4
653	0.43
654	0.37
655	0.38
656	0.4
657	0.38
658	0.42
659	0.42
660	0.49
661	0.48
662	0.53
663	0.56
664	0.62
665	0.71
666	0.75
667	0.8
668	0.8
669	0.81
670	0.84
671	0.87
672	0.87
673	0.86
674	0.87
675	0.87
676	0.88
677	0.88
678	0.82
679	0.76
680	0.74
681	0.73

J4WMG5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer