Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4UJD0

Protein Details
Accession J4UJD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-189EHDPEERRRRQRDSRSRYRDRDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-199RRRRQRDSRSRYRDRDSGYRRGSGHRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMGDAVEGSHDALVAHDPVADDILQPDEVDEPGEIADDEPKPDEDATIVPNKINISGVDSLHTDDIKAYVKSHFAPVDRVEWVDDTSANLVFGSDSTARDALVALSSIEIADATALPIGEALPAKPVEGRSEITIHVRFAVARDRKQAGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRRQRDSRSRYRDRDSGYRRGSGHRRRDSDEEVETFEASMYDDAPRQATRRRSQSRDRQDSYARENRGKELFADRASRRDRSASPLRDDDGDAAMDSIQGSSRNKESARAVKERLRTGNRSKELFPSKAGSGSGQLDRLEDAIGSAHLREEDMPKVVSVPVGSTGGGFNIRGAANQTSQPSRGFNIKGSANARELFPGKLGNDNAGKELFDGSRTKQRQKAQDLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.15
32 0.15
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.13
37 0.14
38 0.17
39 0.22
40 0.22
41 0.2
42 0.22
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.15
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.14
56 0.11
57 0.13
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.18
63 0.19
64 0.24
65 0.25
66 0.23
67 0.27
68 0.27
69 0.29
70 0.27
71 0.26
72 0.23
73 0.2
74 0.19
75 0.16
76 0.14
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.21
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.13
132 0.22
133 0.22
134 0.24
135 0.29
136 0.3
137 0.3
138 0.31
139 0.33
140 0.27
141 0.29
142 0.31
143 0.3
144 0.28
145 0.29
146 0.29
147 0.26
148 0.25
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.29
156 0.31
157 0.32
158 0.4
159 0.44
160 0.52
161 0.55
162 0.61
163 0.67
164 0.74
165 0.78
166 0.77
167 0.8
168 0.82
169 0.85
170 0.84
171 0.79
172 0.73
173 0.67
174 0.67
175 0.62
176 0.61
177 0.54
178 0.53
179 0.48
180 0.5
181 0.55
182 0.54
183 0.58
184 0.57
185 0.57
186 0.57
187 0.6
188 0.58
189 0.52
190 0.45
191 0.36
192 0.3
193 0.27
194 0.23
195 0.18
196 0.13
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.16
208 0.24
209 0.29
210 0.39
211 0.46
212 0.52
213 0.61
214 0.69
215 0.75
216 0.77
217 0.74
218 0.68
219 0.66
220 0.64
221 0.63
222 0.59
223 0.52
224 0.47
225 0.45
226 0.44
227 0.4
228 0.36
229 0.29
230 0.27
231 0.26
232 0.24
233 0.3
234 0.27
235 0.33
236 0.36
237 0.36
238 0.33
239 0.34
240 0.33
241 0.34
242 0.43
243 0.41
244 0.42
245 0.43
246 0.42
247 0.39
248 0.38
249 0.31
250 0.23
251 0.17
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.11
262 0.13
263 0.17
264 0.18
265 0.21
266 0.27
267 0.33
268 0.38
269 0.42
270 0.45
271 0.47
272 0.53
273 0.55
274 0.57
275 0.55
276 0.56
277 0.6
278 0.65
279 0.64
280 0.62
281 0.57
282 0.58
283 0.58
284 0.53
285 0.46
286 0.4
287 0.35
288 0.34
289 0.33
290 0.24
291 0.21
292 0.23
293 0.21
294 0.2
295 0.19
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.1
301 0.08
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.14
333 0.16
334 0.17
335 0.21
336 0.25
337 0.24
338 0.27
339 0.28
340 0.27
341 0.27
342 0.32
343 0.31
344 0.29
345 0.32
346 0.32
347 0.37
348 0.38
349 0.39
350 0.36
351 0.35
352 0.33
353 0.32
354 0.32
355 0.26
356 0.24
357 0.24
358 0.22
359 0.27
360 0.27
361 0.28
362 0.31
363 0.31
364 0.32
365 0.28
366 0.28
367 0.22
368 0.24
369 0.19
370 0.18
371 0.2
372 0.23
373 0.33
374 0.39
375 0.47
376 0.51
377 0.59
378 0.66
379 0.73