Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5K3W0

Protein Details
Accession J5K3W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-144LENARLKEKAREERVRKKRRFEAAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-138REKRLENARLKEKAREERVRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006555  ATP-dep_Helicase_C  
IPR010614  DEAD_2  
IPR045028  DinG/Rad3-like  
IPR014013  Helic_SF1/SF2_ATP-bd_DinG/Rad3  
IPR006554  Helicase-like_DEXD_c2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013020  Rad3/Chl1-like  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0016818  F:hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides  
GO:0034085  P:establishment of sister chromatid cohesion  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
GO:0007064  P:mitotic sister chromatid cohesion  
Pfam View protein in Pfam  
PF06733  DEAD_2  
PF13307  Helicase_C_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51193  HELICASE_ATP_BIND_2  
CDD cd18788  SF2_C_XPD  
Amino Acid Sequences MASDPKMQSIEDGITRIDFHHPFTPYDVQEKFMRTVYQVLETGEGQVGILESPTGTGKSLSLICASLTWLRNHKSSAYRAALEEAKSSFKDEPDWMIDQLLRRKKQELVRTWEDREKRLENARLKEKAREERVRKKRRFEAAVASREVGEDDGEKWMLDDWDGEEGITSQAKDALSGLSKESRDVLERMGLGGPKQQNEESDALEEEIKIYYTSRTHSQLSQFITELRRPKFPASLPEGLSSADAKAQDELVKLLPLSSRQKLCINPSVSRLKSVQAINDRCAELQQPKSSRKCDFVPREELLAQTHEFRDTALATIPDIEDLHQLGKSLQVCPYYASRTALPGAEIVTLPYPLLLQKSARDALGIKLEGNVVIVDEAHNIMDAVSNVYAADLKLSDLRRCREMLGIYVRKFGKKLKGVNRVNVGRVGRVVEGLSEYMNTTLNAKHDNGIVDANELTRPKGIDQINMFELIQYIHESKLAYKIEGYASHVDSKQEDGKQHAPKSSTPVLHTFVSFLVALTNLSSEGRIFYQKLSGAQADVQLSYLLLSPTYAFSSIASSARAVILAGGTMSPFEDYKDHLFPALDQSKITTLSCGHVIPSTNLCVRTLAASRAGGPPFEFSYQRRGDEEMIGQLGLAILNMCSIVPDGVVVFFPSYGYLDQVVEVWKKKRAGDAQSTWERLKSKKTILQESKGASSDEVLQKYSEAILGSQAGGGALLLSVVGGKMSEGINFSDRLGRLVAVVGLPYPNVASPEWRAKMEYIESSTRTRLLERGGITPTEASSRAKQVARDFYENSCMRAVNQSIGRAIRHRGDYAAIVLLDKRYTSERIRKKLPGWIQGGLQMDSQEKGLGGIMGALASFFRGKKVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.2
4 0.24
5 0.21
6 0.23
7 0.28
8 0.3
9 0.31
10 0.36
11 0.41
12 0.36
13 0.43
14 0.39
15 0.36
16 0.38
17 0.41
18 0.38
19 0.34
20 0.33
21 0.27
22 0.32
23 0.31
24 0.31
25 0.29
26 0.27
27 0.26
28 0.25
29 0.25
30 0.2
31 0.17
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.19
54 0.21
55 0.25
56 0.31
57 0.34
58 0.37
59 0.39
60 0.43
61 0.43
62 0.46
63 0.5
64 0.48
65 0.46
66 0.44
67 0.47
68 0.45
69 0.39
70 0.36
71 0.28
72 0.27
73 0.25
74 0.28
75 0.25
76 0.22
77 0.25
78 0.24
79 0.27
80 0.28
81 0.31
82 0.28
83 0.27
84 0.28
85 0.3
86 0.37
87 0.42
88 0.42
89 0.42
90 0.45
91 0.5
92 0.56
93 0.61
94 0.61
95 0.61
96 0.65
97 0.68
98 0.71
99 0.72
100 0.68
101 0.62
102 0.59
103 0.53
104 0.51
105 0.54
106 0.57
107 0.57
108 0.62
109 0.67
110 0.67
111 0.66
112 0.68
113 0.68
114 0.69
115 0.7
116 0.72
117 0.73
118 0.76
119 0.84
120 0.88
121 0.86
122 0.86
123 0.85
124 0.85
125 0.82
126 0.76
127 0.76
128 0.74
129 0.73
130 0.65
131 0.57
132 0.47
133 0.4
134 0.35
135 0.24
136 0.16
137 0.11
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.16
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.15
179 0.21
180 0.23
181 0.21
182 0.24
183 0.24
184 0.23
185 0.27
186 0.28
187 0.22
188 0.2
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.14
201 0.18
202 0.21
203 0.23
204 0.27
205 0.31
206 0.34
207 0.35
208 0.34
209 0.3
210 0.3
211 0.31
212 0.32
213 0.35
214 0.32
215 0.34
216 0.35
217 0.37
218 0.39
219 0.39
220 0.42
221 0.42
222 0.45
223 0.41
224 0.4
225 0.38
226 0.32
227 0.3
228 0.22
229 0.15
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.15
244 0.2
245 0.24
246 0.25
247 0.27
248 0.32
249 0.35
250 0.39
251 0.42
252 0.41
253 0.37
254 0.42
255 0.48
256 0.43
257 0.43
258 0.38
259 0.32
260 0.33
261 0.32
262 0.32
263 0.33
264 0.35
265 0.34
266 0.37
267 0.36
268 0.3
269 0.3
270 0.27
271 0.23
272 0.26
273 0.3
274 0.33
275 0.4
276 0.46
277 0.5
278 0.5
279 0.48
280 0.48
281 0.52
282 0.54
283 0.53
284 0.54
285 0.5
286 0.51
287 0.47
288 0.42
289 0.33
290 0.27
291 0.22
292 0.17
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.16
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.17
352 0.16
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.09
382 0.1
383 0.14
384 0.18
385 0.2
386 0.22
387 0.22
388 0.23
389 0.22
390 0.21
391 0.23
392 0.27
393 0.31
394 0.3
395 0.34
396 0.34
397 0.32
398 0.32
399 0.32
400 0.31
401 0.31
402 0.39
403 0.43
404 0.53
405 0.56
406 0.59
407 0.63
408 0.56
409 0.51
410 0.47
411 0.38
412 0.27
413 0.25
414 0.21
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.15
448 0.15
449 0.18
450 0.19
451 0.21
452 0.21
453 0.21
454 0.21
455 0.13
456 0.13
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.15
466 0.15
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.18
473 0.14
474 0.15
475 0.17
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.18
480 0.19
481 0.19
482 0.19
483 0.21
484 0.28
485 0.34
486 0.36
487 0.37
488 0.35
489 0.33
490 0.39
491 0.4
492 0.34
493 0.29
494 0.3
495 0.3
496 0.29
497 0.27
498 0.21
499 0.16
500 0.15
501 0.13
502 0.1
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.04
512 0.05
513 0.07
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.12
518 0.13
519 0.14
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.15
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.07
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.06
562 0.09
563 0.13
564 0.15
565 0.15
566 0.15
567 0.15
568 0.15
569 0.23
570 0.23
571 0.2
572 0.18
573 0.19
574 0.2
575 0.21
576 0.21
577 0.13
578 0.11
579 0.12
580 0.14
581 0.13
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.15
587 0.17
588 0.18
589 0.18
590 0.18
591 0.17
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.15
597 0.15
598 0.17
599 0.21
600 0.21
601 0.18
602 0.16
603 0.17
604 0.17
605 0.19
606 0.19
607 0.16
608 0.25
609 0.27
610 0.29
611 0.28
612 0.29
613 0.28
614 0.28
615 0.28
616 0.21
617 0.19
618 0.17
619 0.15
620 0.12
621 0.1
622 0.07
623 0.06
624 0.04
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.08
647 0.09
648 0.1
649 0.13
650 0.15
651 0.19
652 0.21
653 0.26
654 0.29
655 0.3
656 0.37
657 0.41
658 0.45
659 0.5
660 0.53
661 0.57
662 0.6
663 0.63
664 0.55
665 0.52
666 0.47
667 0.4
668 0.42
669 0.4
670 0.41
671 0.43
672 0.5
673 0.57
674 0.61
675 0.64
676 0.62
677 0.58
678 0.54
679 0.5
680 0.43
681 0.32
682 0.26
683 0.27
684 0.27
685 0.25
686 0.23
687 0.21
688 0.21
689 0.21
690 0.21
691 0.15
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.08
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.04
703 0.03
704 0.03
705 0.02
706 0.02
707 0.02
708 0.02
709 0.03
710 0.03
711 0.03
712 0.05
713 0.05
714 0.07
715 0.08
716 0.1
717 0.12
718 0.13
719 0.14
720 0.18
721 0.18
722 0.18
723 0.18
724 0.16
725 0.14
726 0.15
727 0.15
728 0.09
729 0.09
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.09
737 0.09
738 0.12
739 0.17
740 0.26
741 0.29
742 0.29
743 0.31
744 0.29
745 0.33
746 0.34
747 0.33
748 0.29
749 0.31
750 0.33
751 0.34
752 0.35
753 0.34
754 0.31
755 0.28
756 0.26
757 0.26
758 0.29
759 0.28
760 0.3
761 0.3
762 0.29
763 0.28
764 0.26
765 0.23
766 0.2
767 0.2
768 0.19
769 0.21
770 0.26
771 0.31
772 0.33
773 0.37
774 0.41
775 0.49
776 0.52
777 0.53
778 0.51
779 0.47
780 0.54
781 0.5
782 0.45
783 0.37
784 0.31
785 0.27
786 0.31
787 0.3
788 0.28
789 0.3
790 0.3
791 0.32
792 0.35
793 0.36
794 0.32
795 0.36
796 0.35
797 0.36
798 0.35
799 0.32
800 0.32
801 0.31
802 0.29
803 0.27
804 0.21
805 0.18
806 0.18
807 0.18
808 0.16
809 0.15
810 0.15
811 0.16
812 0.21
813 0.29
814 0.38
815 0.47
816 0.55
817 0.63
818 0.68
819 0.69
820 0.73
821 0.73
822 0.72
823 0.67
824 0.61
825 0.54
826 0.52
827 0.51
828 0.42
829 0.35
830 0.27
831 0.24
832 0.21
833 0.2
834 0.16
835 0.12
836 0.11
837 0.11
838 0.09
839 0.08
840 0.08
841 0.07
842 0.06
843 0.06
844 0.05
845 0.05
846 0.06
847 0.09
848 0.09