Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4KQN1

Protein Details
Accession J4KQN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-43IKPQVKFKGGRWRDRKQAERGARGPRPBasic
57-76DEPSRPFKRRRADTDDNFGDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-67QVKFKGGRWRDRKQAERGARGPRPDGGPPSRPPRDRLDEPSRPFKRRR
698-714VDRKVRKGAKGAKGSRG
Subcellular Location(s) cyto 18, mito 4, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17949  DEADc_DDX31  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MADDGMLLNFELGSGPIKPQVKFKGGRWRDRKQAERGARGPRPDGGPPSRPPRDRLDEPSRPFKRRRADTDDNFGDDYRPRTRPSHIKIDHGGAGSRPPPFDNRRHGHGGGGKSTKQVVSSLFSFNPEQKTVFEDEEWTAPTPTNAPLADVANFGTLTISSRLVEELGKMNLERPTAIQQKVIPHMLTSSGDAFVQAETGSGKTFSYLLPILHRVLQLSAQNDGKQIHRDSGIFAILIAPTRELAKQTHTVLEQLIRPFPWLVSTAITGGESKKAEKARIRKGINFLVATPGRLADHIDNTKALNLGTVRWLVLDEGDRLMDLGFEDDLKKVIDALREIEIANETTNGTPLAALPDRRVTILCSATMKMNVQKLGELSLADAVFLSAEKGEMTADENIEHKAPAQLHQTHVIVPAKLRLVTLVCYLKSLFSRKGHTMKVIIFMSCADAVDFHFELFRDPKDAEAPPAEPKDVELVSKTVARAAYVTSAASPEVVLHRMHGSLSQPIRSATLRTFSACKSPSVLITTDVSSRGLDIPSVDLVIEYDPAFSFADHIHRIGRTARAGRAGEAVLFLLPGSEEGYVELLKASGAPTAQSYEAILKTGLMSKLEFPVETAAQLTEGQTYHDKAETMQLHFEQRLLEDPRRLELARNGFKSHIRAYATHIKEERVHFDIAELHLGHTAKSYALREPPRGVGAGVDRKVRKGAKGAKGSRGGATAAKDDDKEQQVDQGAARNVLRKKGMMLMTGADEFNIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.17
4 0.21
5 0.23
6 0.3
7 0.37
8 0.44
9 0.49
10 0.54
11 0.59
12 0.64
13 0.74
14 0.75
15 0.76
16 0.78
17 0.83
18 0.84
19 0.82
20 0.84
21 0.82
22 0.83
23 0.81
24 0.81
25 0.77
26 0.73
27 0.67
28 0.61
29 0.55
30 0.51
31 0.53
32 0.5
33 0.51
34 0.54
35 0.61
36 0.65
37 0.64
38 0.63
39 0.64
40 0.65
41 0.65
42 0.67
43 0.68
44 0.68
45 0.71
46 0.78
47 0.77
48 0.75
49 0.74
50 0.73
51 0.74
52 0.74
53 0.77
54 0.75
55 0.78
56 0.78
57 0.82
58 0.77
59 0.7
60 0.61
61 0.52
62 0.45
63 0.37
64 0.35
65 0.32
66 0.31
67 0.32
68 0.34
69 0.42
70 0.5
71 0.54
72 0.6
73 0.56
74 0.6
75 0.6
76 0.62
77 0.57
78 0.48
79 0.42
80 0.32
81 0.33
82 0.29
83 0.27
84 0.23
85 0.21
86 0.28
87 0.34
88 0.41
89 0.47
90 0.5
91 0.54
92 0.6
93 0.58
94 0.57
95 0.56
96 0.53
97 0.5
98 0.49
99 0.44
100 0.39
101 0.41
102 0.35
103 0.3
104 0.27
105 0.21
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.23
110 0.25
111 0.26
112 0.28
113 0.3
114 0.28
115 0.26
116 0.23
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.23
121 0.21
122 0.21
123 0.22
124 0.23
125 0.21
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.23
163 0.29
164 0.3
165 0.29
166 0.3
167 0.35
168 0.39
169 0.39
170 0.31
171 0.24
172 0.24
173 0.23
174 0.21
175 0.17
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.2
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.21
210 0.21
211 0.2
212 0.22
213 0.23
214 0.21
215 0.22
216 0.21
217 0.21
218 0.21
219 0.19
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.18
234 0.19
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.19
243 0.16
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.16
261 0.18
262 0.24
263 0.3
264 0.38
265 0.44
266 0.53
267 0.56
268 0.55
269 0.59
270 0.58
271 0.55
272 0.47
273 0.37
274 0.34
275 0.31
276 0.27
277 0.21
278 0.17
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.09
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.15
290 0.13
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.09
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.02
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.17
392 0.18
393 0.19
394 0.22
395 0.22
396 0.2
397 0.24
398 0.23
399 0.17
400 0.15
401 0.17
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.15
414 0.17
415 0.19
416 0.21
417 0.21
418 0.26
419 0.31
420 0.36
421 0.36
422 0.36
423 0.35
424 0.3
425 0.33
426 0.29
427 0.23
428 0.19
429 0.17
430 0.16
431 0.13
432 0.12
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.15
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.19
453 0.21
454 0.2
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.16
459 0.15
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.09
472 0.1
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.11
488 0.16
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.18
493 0.21
494 0.2
495 0.21
496 0.15
497 0.18
498 0.17
499 0.18
500 0.2
501 0.19
502 0.25
503 0.24
504 0.23
505 0.23
506 0.23
507 0.23
508 0.23
509 0.23
510 0.17
511 0.18
512 0.18
513 0.16
514 0.16
515 0.15
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.08
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.16
543 0.18
544 0.19
545 0.22
546 0.23
547 0.26
548 0.27
549 0.31
550 0.32
551 0.31
552 0.31
553 0.27
554 0.21
555 0.18
556 0.16
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.05
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.13
584 0.13
585 0.14
586 0.13
587 0.11
588 0.11
589 0.16
590 0.16
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.19
595 0.19
596 0.18
597 0.14
598 0.17
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.12
609 0.14
610 0.16
611 0.16
612 0.17
613 0.17
614 0.15
615 0.24
616 0.25
617 0.25
618 0.27
619 0.28
620 0.3
621 0.3
622 0.3
623 0.23
624 0.19
625 0.25
626 0.27
627 0.29
628 0.3
629 0.31
630 0.33
631 0.36
632 0.36
633 0.32
634 0.34
635 0.4
636 0.44
637 0.46
638 0.46
639 0.44
640 0.48
641 0.49
642 0.44
643 0.4
644 0.34
645 0.32
646 0.38
647 0.45
648 0.44
649 0.46
650 0.45
651 0.42
652 0.45
653 0.47
654 0.45
655 0.38
656 0.36
657 0.29
658 0.29
659 0.3
660 0.25
661 0.26
662 0.21
663 0.18
664 0.21
665 0.21
666 0.2
667 0.17
668 0.16
669 0.13
670 0.17
671 0.19
672 0.2
673 0.29
674 0.34
675 0.38
676 0.41
677 0.43
678 0.41
679 0.4
680 0.35
681 0.3
682 0.32
683 0.36
684 0.36
685 0.4
686 0.39
687 0.4
688 0.48
689 0.47
690 0.43
691 0.44
692 0.51
693 0.53
694 0.62
695 0.67
696 0.68
697 0.71
698 0.69
699 0.61
700 0.53
701 0.45
702 0.38
703 0.35
704 0.3
705 0.26
706 0.27
707 0.25
708 0.26
709 0.32
710 0.33
711 0.33
712 0.29
713 0.31
714 0.31
715 0.32
716 0.31
717 0.31
718 0.28
719 0.29
720 0.3
721 0.33
722 0.34
723 0.38
724 0.4
725 0.34
726 0.34
727 0.39
728 0.4
729 0.35
730 0.33
731 0.29
732 0.3
733 0.3
734 0.28