Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EDA6

Protein Details
Accession J6EDA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
572-593NSGSNKAQYKKRYARRSSYGYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034352  Rim4_RRM1  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12453  RRM1_RIM4_like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKTEITTADSLRDPHPNGLKADSELVIREDIDQFLPSEVSSMGSDHQNDGEDSDTDSDNFLQDPEEDADEDTTGRDNATTTSTESRGRPSSCIFVASLAAALSDDELCLSVTDNFKRYGDLARVKVLRDNANRPYAFVQYNNDHDAKHALIRAQGTLLNGRRLRCEPAKVNRTLYLKNQQSIDFNEITQICEKFGGLEQIVPDRTDNQYTRRYTYPISSANSWFVQFIYRDDAIRAYANLRTDPNWIIEWAQNINVPKNYNLLHKDKGKFKNSRYHQNYNNSSNGEDSKRNGAIIEEEREHESVSDLDEKLGSEGINDDEDKDSEITIDKKSIFVGQLDKETTREELDRRFSTHGKIQDINLIFKPTNIFAFIKYETEEAAAAALESENHAIFLNKTMHVQYKEVGGRHNRKFFNKSGSGTFNHHQFFSTRSGKSFTGPELNLAPPPINMYRKMSGGSQQESENIMPYMPMGPMAMGPPPPNAASLNDFEMFPQNYSAFMKGMMPLRRKSMPNAWSSPSSKSVNSENESIDGGDENSELPSEVPESSGRYNAANSFTTYNNSSAGSSNNNNNSGSNKAQYKKRYARRSSYGYSEVPPKPYYFQPYYYHPMQYHMGPMAPLHPSQNSAGNHHPYMMVYPMPPPPPSGLDGNMMPPPINMGQPHAANHSSTNIEASEFVPKDADDINEDSKAAYNLDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.43
4 0.44
5 0.44
6 0.43
7 0.38
8 0.38
9 0.32
10 0.25
11 0.23
12 0.22
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.16
31 0.18
32 0.18
33 0.19
34 0.19
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.2
69 0.22
70 0.26
71 0.27
72 0.32
73 0.36
74 0.37
75 0.37
76 0.36
77 0.39
78 0.35
79 0.35
80 0.29
81 0.23
82 0.22
83 0.19
84 0.16
85 0.1
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.1
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.26
106 0.3
107 0.34
108 0.34
109 0.4
110 0.41
111 0.41
112 0.44
113 0.43
114 0.44
115 0.43
116 0.48
117 0.46
118 0.53
119 0.52
120 0.5
121 0.48
122 0.43
123 0.38
124 0.34
125 0.33
126 0.29
127 0.33
128 0.36
129 0.34
130 0.29
131 0.28
132 0.28
133 0.24
134 0.22
135 0.2
136 0.17
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.22
144 0.23
145 0.28
146 0.3
147 0.3
148 0.34
149 0.35
150 0.4
151 0.38
152 0.43
153 0.44
154 0.52
155 0.59
156 0.58
157 0.6
158 0.59
159 0.58
160 0.54
161 0.52
162 0.51
163 0.48
164 0.47
165 0.46
166 0.42
167 0.4
168 0.41
169 0.39
170 0.29
171 0.24
172 0.26
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.2
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.16
192 0.21
193 0.22
194 0.24
195 0.31
196 0.33
197 0.37
198 0.37
199 0.38
200 0.34
201 0.35
202 0.36
203 0.33
204 0.34
205 0.33
206 0.32
207 0.33
208 0.32
209 0.28
210 0.22
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.19
246 0.19
247 0.23
248 0.27
249 0.29
250 0.32
251 0.39
252 0.43
253 0.49
254 0.56
255 0.59
256 0.61
257 0.61
258 0.65
259 0.64
260 0.7
261 0.69
262 0.69
263 0.68
264 0.7
265 0.72
266 0.66
267 0.64
268 0.53
269 0.45
270 0.39
271 0.35
272 0.28
273 0.23
274 0.21
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.19
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.15
284 0.16
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.13
289 0.12
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.14
323 0.13
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.16
334 0.21
335 0.21
336 0.23
337 0.25
338 0.25
339 0.26
340 0.29
341 0.29
342 0.27
343 0.27
344 0.25
345 0.28
346 0.28
347 0.27
348 0.23
349 0.21
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.18
386 0.2
387 0.2
388 0.17
389 0.21
390 0.23
391 0.23
392 0.26
393 0.3
394 0.38
395 0.43
396 0.51
397 0.48
398 0.5
399 0.55
400 0.54
401 0.53
402 0.49
403 0.46
404 0.42
405 0.42
406 0.39
407 0.39
408 0.37
409 0.35
410 0.31
411 0.28
412 0.25
413 0.21
414 0.22
415 0.25
416 0.29
417 0.24
418 0.24
419 0.28
420 0.28
421 0.29
422 0.28
423 0.23
424 0.23
425 0.22
426 0.22
427 0.21
428 0.21
429 0.2
430 0.19
431 0.17
432 0.1
433 0.14
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.22
438 0.23
439 0.23
440 0.25
441 0.22
442 0.25
443 0.27
444 0.28
445 0.25
446 0.24
447 0.24
448 0.25
449 0.24
450 0.19
451 0.14
452 0.12
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.07
457 0.07
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.15
472 0.16
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.16
477 0.2
478 0.19
479 0.16
480 0.16
481 0.13
482 0.14
483 0.16
484 0.16
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.13
489 0.2
490 0.25
491 0.28
492 0.29
493 0.34
494 0.39
495 0.4
496 0.42
497 0.44
498 0.44
499 0.46
500 0.49
501 0.47
502 0.48
503 0.48
504 0.46
505 0.43
506 0.39
507 0.33
508 0.32
509 0.35
510 0.36
511 0.37
512 0.36
513 0.31
514 0.3
515 0.29
516 0.26
517 0.2
518 0.14
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.08
531 0.09
532 0.13
533 0.14
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.17
538 0.19
539 0.21
540 0.19
541 0.2
542 0.2
543 0.2
544 0.22
545 0.23
546 0.21
547 0.19
548 0.18
549 0.18
550 0.16
551 0.17
552 0.2
553 0.21
554 0.27
555 0.31
556 0.32
557 0.32
558 0.32
559 0.32
560 0.32
561 0.31
562 0.3
563 0.32
564 0.37
565 0.44
566 0.5
567 0.58
568 0.63
569 0.7
570 0.75
571 0.77
572 0.8
573 0.81
574 0.82
575 0.76
576 0.73
577 0.68
578 0.6
579 0.54
580 0.54
581 0.48
582 0.45
583 0.42
584 0.37
585 0.35
586 0.37
587 0.42
588 0.37
589 0.4
590 0.4
591 0.45
592 0.5
593 0.5
594 0.51
595 0.43
596 0.43
597 0.39
598 0.36
599 0.33
600 0.28
601 0.25
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.17
608 0.17
609 0.18
610 0.2
611 0.27
612 0.26
613 0.29
614 0.36
615 0.39
616 0.38
617 0.37
618 0.35
619 0.28
620 0.28
621 0.25
622 0.19
623 0.14
624 0.17
625 0.22
626 0.24
627 0.24
628 0.24
629 0.25
630 0.26
631 0.29
632 0.29
633 0.25
634 0.26
635 0.26
636 0.27
637 0.26
638 0.24
639 0.21
640 0.17
641 0.2
642 0.18
643 0.2
644 0.17
645 0.2
646 0.25
647 0.27
648 0.29
649 0.3
650 0.29
651 0.28
652 0.28
653 0.27
654 0.24
655 0.22
656 0.22
657 0.17
658 0.17
659 0.17
660 0.16
661 0.22
662 0.2
663 0.21
664 0.2
665 0.19
666 0.21
667 0.22
668 0.22
669 0.17
670 0.21
671 0.24
672 0.24
673 0.24
674 0.22
675 0.22
676 0.22