FuNGI

J4U4U1

Protein Details

Accession

J4U4U1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
634-659	DFDVDFPVNKRRKQKKRTHEGLTITD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
643-650	KRRKQKKR

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MTSQQRMIVHRCRFVDFTPATITSLAFSHKSNIDKLTPSDLRLAIGRSNGNIEIWNPRNNWFQEMMIEGGKDRSIEGLCWSNVSGESLRLFSIGGSTVVTEWDLATGLPLRNYDCNAGVIWSISINDSQDKLSVGCDNGTVVLIDISGGPGVLEHDTILMRQEARVLTLAWKKNDFVIGGCSDGRIRIWSAQRGDENMGRLLHTMKVDKAKRESTLVWSVIYLPRTDQVVSGDSTGSIKFWDFQFATLNQSFKAHDADVLCLTTDIDNNYVFSAGVDRKIFQFSQNTNKSQKNNRWVNSSNRLLHGNDIRTICAYQSKGADFLVSGGVEKTLVINSLTSFSNGNYRKMPTVEPYSKNVLINKEQRLIVSWNESTVKIWTMGIESNSEQNYKLVCKLNLKDEQNISTCALSPDGQVLVVGRPSTTKVFHLQPIGAKLKVTKLDNELLLKTATKLAKFIDNSRIVICSCEDEVFIVDLESEEDEKPQQIELLEINSTKSSIKVPYINRINHLEVDQDIAVISRGCGAVDILNLKTMEAKSLVRLNNFITAVYINSPRKSVVVVTAENKIYEFNVNLSPEAENEDNESLLTQWSKNNTENLPKEWKTLKENCVGIFTDMKNSNMLWFWGATWISRIDFDVDFPVNKRRKQKKRTHEGLTITDESNFMNDEEDDEDDDIDMEINENLNVLLSQGNKIKSTDSHRHEESSNYFFFTDKYRPLLFVDSISSDELAIIERNLLCSHSKQKAFVQPKLVF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.5
3	0.41
4	0.38
5	0.36
6	0.34
7	0.31
8	0.29
9	0.27
10	0.18
11	0.19
12	0.19
13	0.15
14	0.15
15	0.19
16	0.23
17	0.26
18	0.29
19	0.32
20	0.33
21	0.36
22	0.38
23	0.42
24	0.4
25	0.39
26	0.41
27	0.36
28	0.34
29	0.32
30	0.32
31	0.25
32	0.27
33	0.27
34	0.22
35	0.25
36	0.24
37	0.22
38	0.21
39	0.2
40	0.25
41	0.28
42	0.33
43	0.31
44	0.34
45	0.42
46	0.42
47	0.45
48	0.38
49	0.35
50	0.3
51	0.31
52	0.29
53	0.22
54	0.21
55	0.17
56	0.16
57	0.16
58	0.14
59	0.12
60	0.13
61	0.12
62	0.13
63	0.16
64	0.21
65	0.2
66	0.21
67	0.22
68	0.19
69	0.19
70	0.22
71	0.18
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.15
76	0.14
77	0.14
78	0.1
79	0.11
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.09
86	0.09
87	0.07
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.07
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.14
97	0.16
98	0.19
99	0.21
100	0.22
101	0.19
102	0.19
103	0.18
104	0.18
105	0.15
106	0.13
107	0.12
108	0.1
109	0.09
110	0.08
111	0.09
112	0.1
113	0.11
114	0.12
115	0.12
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.13
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.09
128	0.07
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.03
137	0.04
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.13
150	0.12
151	0.13
152	0.14
153	0.14
154	0.19
155	0.26
156	0.32
157	0.31
158	0.33
159	0.32
160	0.33
161	0.34
162	0.28
163	0.21
164	0.2
165	0.18
166	0.18
167	0.18
168	0.16
169	0.14
170	0.14
171	0.14
172	0.11
173	0.12
174	0.16
175	0.21
176	0.27
177	0.29
178	0.33
179	0.34
180	0.35
181	0.37
182	0.34
183	0.31
184	0.27
185	0.25
186	0.21
187	0.2
188	0.18
189	0.17
190	0.17
191	0.17
192	0.18
193	0.27
194	0.3
195	0.35
196	0.39
197	0.4
198	0.4
199	0.42
200	0.4
201	0.37
202	0.4
203	0.35
204	0.3
205	0.26
206	0.27
207	0.26
208	0.25
209	0.19
210	0.13
211	0.13
212	0.15
213	0.15
214	0.13
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.09
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.18
232	0.18
233	0.24
234	0.24
235	0.24
236	0.19
237	0.2
238	0.19
239	0.17
240	0.19
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.15
245	0.15
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.11
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.1
261	0.09
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.17
267	0.17
268	0.16
269	0.22
270	0.23
271	0.33
272	0.38
273	0.41
274	0.44
275	0.49
276	0.52
277	0.55
278	0.59
279	0.59
280	0.62
281	0.6
282	0.62
283	0.61
284	0.63
285	0.62
286	0.61
287	0.53
288	0.46
289	0.46
290	0.39
291	0.38
292	0.35
293	0.28
294	0.26
295	0.24
296	0.23
297	0.21
298	0.21
299	0.17
300	0.16
301	0.15
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.1
309	0.1
310	0.08
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.16
329	0.18
330	0.2
331	0.2
332	0.21
333	0.22
334	0.23
335	0.24
336	0.2
337	0.27
338	0.32
339	0.32
340	0.34
341	0.37
342	0.37
343	0.37
344	0.36
345	0.31
346	0.31
347	0.34
348	0.34
349	0.32
350	0.31
351	0.29
352	0.29
353	0.27
354	0.22
355	0.2
356	0.17
357	0.15
358	0.16
359	0.16
360	0.14
361	0.13
362	0.12
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.15
379	0.16
380	0.17
381	0.22
382	0.24
383	0.3
384	0.36
385	0.37
386	0.36
387	0.34
388	0.35
389	0.31
390	0.31
391	0.25
392	0.18
393	0.17
394	0.13
395	0.13
396	0.1
397	0.09
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.08
409	0.09
410	0.1
411	0.11
412	0.14
413	0.17
414	0.19
415	0.21
416	0.2
417	0.2
418	0.25
419	0.26
420	0.22
421	0.2
422	0.18
423	0.21
424	0.24
425	0.23
426	0.2
427	0.21
428	0.23
429	0.25
430	0.26
431	0.22
432	0.19
433	0.18
434	0.16
435	0.13
436	0.16
437	0.15
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.2
442	0.21
443	0.24
444	0.27
445	0.28
446	0.29
447	0.28
448	0.29
449	0.23
450	0.22
451	0.19
452	0.12
453	0.11
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.08
472	0.09
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.11
486	0.14
487	0.2
488	0.23
489	0.31
490	0.39
491	0.4
492	0.41
493	0.44
494	0.42
495	0.37
496	0.35
497	0.27
498	0.19
499	0.2
500	0.16
501	0.12
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.07
506	0.07
507	0.05
508	0.06
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.08
514	0.1
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.14
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.21
526	0.23
527	0.21
528	0.23
529	0.23
530	0.26
531	0.26
532	0.22
533	0.17
534	0.15
535	0.14
536	0.15
537	0.21
538	0.19
539	0.2
540	0.21
541	0.2
542	0.2
543	0.2
544	0.19
545	0.18
546	0.2
547	0.22
548	0.23
549	0.28
550	0.28
551	0.27
552	0.26
553	0.2
554	0.16
555	0.15
556	0.13
557	0.11
558	0.15
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.16
563	0.14
564	0.18
565	0.16
566	0.13
567	0.15
568	0.15
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.09
573	0.1
574	0.12
575	0.1
576	0.12
577	0.17
578	0.22
579	0.24
580	0.29
581	0.31
582	0.4
583	0.42
584	0.45
585	0.49
586	0.46
587	0.49
588	0.49
589	0.5
590	0.49
591	0.53
592	0.53
593	0.51
594	0.52
595	0.48
596	0.46
597	0.42
598	0.36
599	0.33
600	0.28
601	0.28
602	0.28
603	0.28
604	0.25
605	0.24
606	0.24
607	0.2
608	0.2
609	0.13
610	0.12
611	0.11
612	0.15
613	0.15
614	0.13
615	0.14
616	0.15
617	0.15
618	0.15
619	0.16
620	0.14
621	0.14
622	0.15
623	0.18
624	0.18
625	0.19
626	0.2
627	0.29
628	0.33
629	0.39
630	0.49
631	0.55
632	0.64
633	0.74
634	0.82
635	0.84
636	0.88
637	0.92
638	0.89
639	0.87
640	0.82
641	0.77
642	0.73
643	0.65
644	0.54
645	0.45
646	0.37
647	0.29
648	0.24
649	0.18
650	0.12
651	0.1
652	0.09
653	0.1
654	0.12
655	0.13
656	0.14
657	0.13
658	0.13
659	0.11
660	0.12
661	0.1
662	0.09
663	0.07
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.08
674	0.09
675	0.13
676	0.18
677	0.21
678	0.22
679	0.23
680	0.26
681	0.29
682	0.37
683	0.43
684	0.44
685	0.5
686	0.51
687	0.54
688	0.53
689	0.53
690	0.5
691	0.46
692	0.41
693	0.35
694	0.32
695	0.29
696	0.29
697	0.28
698	0.29
699	0.27
700	0.32
701	0.31
702	0.32
703	0.35
704	0.39
705	0.34
706	0.29
707	0.28
708	0.24
709	0.24
710	0.24
711	0.21
712	0.16
713	0.15
714	0.13
715	0.11
716	0.1
717	0.09
718	0.12
719	0.12
720	0.14
721	0.14
722	0.16
723	0.18
724	0.23
725	0.31
726	0.37
727	0.4
728	0.42
729	0.5
730	0.58
731	0.64
732	0.64

J4U4U1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer