Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6END6

Protein Details
Accession J6END6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-200VQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-191PKPKRKN
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039723  Vps71/ZNHIT1  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MKTLVEEIDKRTYNPNAYFTSLDPQARRYTSKKIHKHGTTSTSRPVKRINYSLADLEAKLYTSRPDGDGSIISGQNDRNSKNSNSFEDRYTQQEILQSDRRFMELNTENLSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGAPFGKEQSKYGHGWVLKPETLREVQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPLITTCSICGGYDSISSCVNCGSKICSVNCFKLHNETRCRNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.4
4 0.43
5 0.43
6 0.38
7 0.38
8 0.36
9 0.37
10 0.33
11 0.33
12 0.36
13 0.37
14 0.41
15 0.4
16 0.45
17 0.51
18 0.6
19 0.66
20 0.69
21 0.76
22 0.76
23 0.78
24 0.76
25 0.74
26 0.71
27 0.66
28 0.67
29 0.66
30 0.62
31 0.58
32 0.58
33 0.57
34 0.56
35 0.57
36 0.54
37 0.49
38 0.5
39 0.48
40 0.43
41 0.37
42 0.3
43 0.25
44 0.19
45 0.15
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.19
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.26
67 0.28
68 0.34
69 0.37
70 0.38
71 0.42
72 0.43
73 0.4
74 0.39
75 0.38
76 0.35
77 0.35
78 0.29
79 0.23
80 0.25
81 0.25
82 0.27
83 0.33
84 0.28
85 0.27
86 0.27
87 0.26
88 0.23
89 0.22
90 0.25
91 0.21
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.22
97 0.23
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.17
119 0.17
120 0.21
121 0.26
122 0.27
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.23
127 0.22
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.11
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.24
153 0.24
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.19
160 0.17
161 0.15
162 0.15
163 0.18
164 0.2
165 0.19
166 0.2
167 0.23
168 0.27
169 0.31
170 0.4
171 0.47
172 0.56
173 0.66
174 0.74
175 0.81
176 0.87
177 0.92
178 0.9
179 0.89
180 0.87
181 0.84
182 0.79
183 0.73
184 0.67
185 0.57
186 0.52
187 0.48
188 0.45
189 0.4
190 0.41
191 0.44
192 0.48
193 0.52
194 0.52
195 0.47
196 0.45
197 0.43
198 0.37
199 0.32
200 0.24
201 0.18
202 0.16
203 0.14
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.13
213 0.16
214 0.25
215 0.33
216 0.37
217 0.44
218 0.46
219 0.46
220 0.47
221 0.45
222 0.41
223 0.42
224 0.42
225 0.39
226 0.4
227 0.42
228 0.4
229 0.4
230 0.35
231 0.27
232 0.24
233 0.19
234 0.16
235 0.12
236 0.11
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.19
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.18
248 0.21
249 0.28
250 0.29
251 0.34
252 0.39
253 0.45
254 0.48
255 0.48
256 0.44
257 0.49
258 0.57
259 0.58
260 0.63