Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163GMD0

Protein Details
Accession A0A163GMD0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-460QTGTSPKKPRKAFRIGGKSKHydrophilic
512-543PEEKAERKRAELKRRNGELAKKQAQHKKKKRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-409SRPKGRFFRIGGKAKEA
447-458KKPRKAFRIGGK
515-543KAERKRAELKRRNGELAKKQAQHKKKKRF
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSSWRVLELSAQPDGEPIPQLLVKPAFGPDSYTLHLTCLTNIWSEQLDLAAIVHRATVQQSPIEVSKQDTAQLSILLDNVKKSLETSDDAGCLLTRDGTDGITLHTTIRLPEPLDSLTWKFHLQRRSSVTLKNELILPLLVSSHIQYERINDLITTIENKDKAIARMVDQFESSNLDLAAAFPSIGALKAGRKMIKREQAARHLPALRPFQQDVWREETAQLADSEVTTLGLFQEALVQCTPDVPSSLEAEDGAEDWLSAVPSRLTYAKPAIKIRTREPAPVFQPPKHGHESSPVDDDTEDEFEVHENFKTRNLPSRELPTVPEPMPPSAQHKVNMDEDESTEDDDDLDVPSRSQNQNQDQSHNRAPRQTQQHIKSPSPKAPSEPATSPPPVSRPKGRFFRIGGKAKEAEPKPLRQEDESGPRDVEATQSLVPPFSQFGSQTGTSPKKPRKAFRIGGKSKASQEAASSQLDATATTTQFRSAHSPTPKSSPPPMPYIQKEATPREEMPEETPEEKAERKRAELKRRNGELAKKQAQHKKKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.17
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.21
9 0.21
10 0.2
11 0.2
12 0.22
13 0.21
14 0.19
15 0.24
16 0.21
17 0.24
18 0.25
19 0.27
20 0.25
21 0.24
22 0.27
23 0.23
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.19
49 0.21
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.23
54 0.22
55 0.25
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.16
73 0.18
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.16
79 0.14
80 0.12
81 0.1
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.18
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.22
107 0.25
108 0.29
109 0.36
110 0.36
111 0.42
112 0.47
113 0.52
114 0.53
115 0.53
116 0.52
117 0.52
118 0.49
119 0.42
120 0.37
121 0.3
122 0.28
123 0.22
124 0.17
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.15
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.22
151 0.21
152 0.2
153 0.28
154 0.29
155 0.27
156 0.25
157 0.24
158 0.19
159 0.21
160 0.19
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.1
177 0.14
178 0.18
179 0.21
180 0.27
181 0.35
182 0.42
183 0.45
184 0.5
185 0.54
186 0.59
187 0.62
188 0.58
189 0.55
190 0.51
191 0.47
192 0.45
193 0.45
194 0.41
195 0.39
196 0.37
197 0.36
198 0.39
199 0.42
200 0.39
201 0.39
202 0.35
203 0.31
204 0.3
205 0.28
206 0.22
207 0.18
208 0.15
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.18
256 0.21
257 0.25
258 0.29
259 0.33
260 0.36
261 0.37
262 0.4
263 0.39
264 0.41
265 0.4
266 0.41
267 0.38
268 0.44
269 0.44
270 0.36
271 0.43
272 0.4
273 0.42
274 0.41
275 0.39
276 0.31
277 0.36
278 0.39
279 0.33
280 0.34
281 0.28
282 0.24
283 0.23
284 0.23
285 0.17
286 0.13
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.12
297 0.15
298 0.16
299 0.24
300 0.28
301 0.31
302 0.32
303 0.38
304 0.38
305 0.35
306 0.36
307 0.3
308 0.3
309 0.26
310 0.27
311 0.22
312 0.21
313 0.22
314 0.21
315 0.24
316 0.24
317 0.26
318 0.26
319 0.26
320 0.28
321 0.3
322 0.3
323 0.25
324 0.21
325 0.19
326 0.19
327 0.17
328 0.14
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.13
340 0.15
341 0.19
342 0.26
343 0.33
344 0.42
345 0.44
346 0.49
347 0.49
348 0.54
349 0.58
350 0.56
351 0.5
352 0.47
353 0.48
354 0.5
355 0.53
356 0.54
357 0.56
358 0.54
359 0.62
360 0.62
361 0.64
362 0.64
363 0.61
364 0.6
365 0.56
366 0.52
367 0.47
368 0.47
369 0.47
370 0.43
371 0.4
372 0.37
373 0.37
374 0.37
375 0.35
376 0.31
377 0.32
378 0.33
379 0.36
380 0.41
381 0.42
382 0.49
383 0.57
384 0.59
385 0.59
386 0.57
387 0.62
388 0.63
389 0.65
390 0.59
391 0.55
392 0.54
393 0.5
394 0.55
395 0.46
396 0.46
397 0.42
398 0.46
399 0.47
400 0.51
401 0.51
402 0.44
403 0.48
404 0.44
405 0.5
406 0.47
407 0.42
408 0.36
409 0.33
410 0.32
411 0.27
412 0.22
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.12
423 0.13
424 0.11
425 0.12
426 0.17
427 0.18
428 0.19
429 0.26
430 0.3
431 0.34
432 0.44
433 0.5
434 0.54
435 0.62
436 0.69
437 0.7
438 0.75
439 0.78
440 0.79
441 0.82
442 0.79
443 0.8
444 0.76
445 0.71
446 0.65
447 0.63
448 0.54
449 0.43
450 0.39
451 0.35
452 0.32
453 0.29
454 0.25
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.15
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.19
466 0.21
467 0.25
468 0.25
469 0.33
470 0.4
471 0.45
472 0.45
473 0.51
474 0.54
475 0.54
476 0.58
477 0.58
478 0.53
479 0.55
480 0.58
481 0.59
482 0.59
483 0.61
484 0.55
485 0.52
486 0.54
487 0.54
488 0.54
489 0.51
490 0.47
491 0.44
492 0.45
493 0.41
494 0.38
495 0.37
496 0.36
497 0.31
498 0.32
499 0.28
500 0.29
501 0.33
502 0.37
503 0.41
504 0.41
505 0.46
506 0.55
507 0.63
508 0.71
509 0.75
510 0.78
511 0.8
512 0.82
513 0.84
514 0.81
515 0.81
516 0.8
517 0.81
518 0.8
519 0.75
520 0.78
521 0.8
522 0.83
523 0.84