Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PCS3

Protein Details
Accession J5PCS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-246PHDDDGSSEKKKKKKKKDKKKDKSNSSIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241EKKKKKKKKDKKKDK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 11.333, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22015  HMG-box_HMO1-like  
Amino Acid Sequences MTTDPSVKLKSAKDSLVSSLFELSKASNQTASSIVDFYNAIGGDEEEKIEAFTTLTESLQTLTSGVNHLHGISSELVNPADDDKEAIIVAPVKPVRRKIERDPNAPKKPLTVFFAYSAYVRQELREDRQKAGLPPLSSTEITQEISKKWKELSDGEKEKWKQAYNVELENYQREKSKYLEAKKNGTLPPASLENGPTHAPVPIPLSLQHAAEPPVEKRPHDDDGSSEKKKKKKKKDKKKDKSNSSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.29
7 0.26
8 0.22
9 0.21
10 0.18
11 0.19
12 0.2
13 0.21
14 0.19
15 0.19
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.18
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.11
78 0.13
79 0.16
80 0.19
81 0.25
82 0.31
83 0.36
84 0.42
85 0.47
86 0.57
87 0.61
88 0.67
89 0.72
90 0.76
91 0.75
92 0.72
93 0.62
94 0.55
95 0.5
96 0.44
97 0.38
98 0.3
99 0.24
100 0.23
101 0.24
102 0.21
103 0.18
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.13
111 0.19
112 0.27
113 0.28
114 0.28
115 0.31
116 0.33
117 0.3
118 0.34
119 0.32
120 0.23
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.2
125 0.19
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.21
138 0.25
139 0.3
140 0.34
141 0.39
142 0.39
143 0.46
144 0.46
145 0.47
146 0.46
147 0.41
148 0.34
149 0.32
150 0.38
151 0.33
152 0.35
153 0.32
154 0.3
155 0.29
156 0.32
157 0.3
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.32
164 0.35
165 0.43
166 0.51
167 0.52
168 0.57
169 0.59
170 0.63
171 0.55
172 0.5
173 0.42
174 0.33
175 0.32
176 0.28
177 0.26
178 0.19
179 0.2
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.19
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.22
200 0.19
201 0.27
202 0.29
203 0.28
204 0.32
205 0.36
206 0.4
207 0.39
208 0.38
209 0.35
210 0.41
211 0.5
212 0.51
213 0.53
214 0.54
215 0.6
216 0.7
217 0.76
218 0.78
219 0.8
220 0.85
221 0.89
222 0.93
223 0.96
224 0.97
225 0.98
226 0.98