Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8TXU3

Protein Details
Accession J8TXU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGRYSVKRYKTKRRTRDLDLIYNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-76KVHKRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0022613  P:ribonucleoprotein complex biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MGRYSVKRYKTKRRTRDLDLIYNDLATKESVQKLLNQPLDETKAGLGQHYCIHCAKYMETAIALKTHLKGKVHKRRVKELKGVPYTQEVSDAAAGYNLNKFLDRVQEIAQSVGPEKETNESLLKEHMDTTLANVATTEPTLPWAATPATEATEAESATTTTAQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.88
4 0.84
5 0.82
6 0.75
7 0.68
8 0.58
9 0.5
10 0.42
11 0.31
12 0.24
13 0.16
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.19
18 0.19
19 0.25
20 0.31
21 0.39
22 0.4
23 0.35
24 0.35
25 0.36
26 0.39
27 0.33
28 0.27
29 0.19
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.14
34 0.11
35 0.16
36 0.16
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.09
52 0.1
53 0.14
54 0.16
55 0.17
56 0.24
57 0.35
58 0.45
59 0.55
60 0.58
61 0.59
62 0.67
63 0.74
64 0.73
65 0.71
66 0.67
67 0.66
68 0.65
69 0.61
70 0.51
71 0.44
72 0.39
73 0.3
74 0.25
75 0.15
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.12
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.12
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.11
144 0.11