Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166FCW1

Protein Details
Accession A0A166FCW1    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22PPMKDKKRKHGNPQGNSKERQEBasic
288-326IDAATKKAEKARRKQEKEEKRKRKEEKRAEKARKKAAIEBasic
353-396IAASTETKKSKKRPREEKTDEVDGDEEKLTKKEKKKRRKEKTDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-323KKAEKARRKQEKEEKRKRKEEKRAEKARKKA
360-369KKSKKRPREE
380-393KLTKKEKKKRRKEK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences PPMKDKKRKHGNPQGNSKERQEFTLMNASMTLSIPPLFATEPRRGALEMLDSLLMRHIPALNGVLITHSNMKFTSSTAQIINECPFAVVPVTFDALVWAPRIGSKLVGKVSLASPDHLGLILHSTFNASIPRQHIRTDEWEFEYGPAENDPEFGQSVSWKTDEQTVIPDGEQAEAEGEAEAEEPQQTGKWIRITDGESIGGEEGLVEFTVIGYTIANQMLSLIGSLLANPFAPPPASPPPTTKSKSHDDDAELDLHSTFARLGHRTDIALARADQDQAQGSQNPVDDIDAATKKAEKARRKQEKEEKRKRKEEKRAEKARKKAAIEMEEFNAESGNMKTDVDMKDTNLAPPAIAASTETKKSKKRPREEKTDEVDGDEEKLTKKEKKKRRKEKTDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.89
3 0.84
4 0.8
5 0.78
6 0.68
7 0.61
8 0.55
9 0.45
10 0.42
11 0.48
12 0.41
13 0.32
14 0.31
15 0.28
16 0.24
17 0.23
18 0.18
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.15
26 0.19
27 0.24
28 0.27
29 0.28
30 0.29
31 0.28
32 0.28
33 0.25
34 0.24
35 0.18
36 0.16
37 0.17
38 0.15
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.17
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.18
60 0.19
61 0.22
62 0.17
63 0.19
64 0.19
65 0.22
66 0.21
67 0.23
68 0.23
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.11
89 0.1
90 0.13
91 0.14
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.22
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.07
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.12
115 0.09
116 0.13
117 0.17
118 0.22
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.26
123 0.33
124 0.34
125 0.33
126 0.31
127 0.31
128 0.3
129 0.28
130 0.25
131 0.18
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.15
149 0.16
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.16
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.08
188 0.06
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.03
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.1
222 0.17
223 0.2
224 0.21
225 0.25
226 0.28
227 0.36
228 0.39
229 0.38
230 0.36
231 0.42
232 0.44
233 0.43
234 0.43
235 0.37
236 0.37
237 0.35
238 0.31
239 0.23
240 0.19
241 0.17
242 0.13
243 0.11
244 0.08
245 0.06
246 0.07
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.17
281 0.23
282 0.31
283 0.35
284 0.44
285 0.55
286 0.66
287 0.71
288 0.8
289 0.84
290 0.87
291 0.9
292 0.91
293 0.91
294 0.9
295 0.93
296 0.93
297 0.93
298 0.93
299 0.93
300 0.93
301 0.93
302 0.94
303 0.94
304 0.93
305 0.91
306 0.9
307 0.86
308 0.77
309 0.74
310 0.7
311 0.66
312 0.6
313 0.54
314 0.46
315 0.4
316 0.37
317 0.3
318 0.22
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.17
327 0.18
328 0.21
329 0.22
330 0.21
331 0.26
332 0.27
333 0.28
334 0.25
335 0.24
336 0.19
337 0.17
338 0.17
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.14
343 0.18
344 0.24
345 0.29
346 0.34
347 0.42
348 0.53
349 0.62
350 0.67
351 0.74
352 0.8
353 0.84
354 0.89
355 0.9
356 0.9
357 0.86
358 0.85
359 0.74
360 0.65
361 0.57
362 0.46
363 0.4
364 0.31
365 0.26
366 0.18
367 0.22
368 0.26
369 0.33
370 0.42
371 0.5
372 0.59
373 0.69
374 0.79
375 0.86
376 0.91