FuNGI

A0A166BSZ0

Protein Details

Accession

A0A166BSZ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-37	MFLPKPKPSGTSKPPPRATRKAPRPAPKDEPES	Hydrophilic
75-97	TIQQWNRPVRMNRKNPKPIHDSA	Hydrophilic
146-169	GGPGGKKMPFKKKTKQVIPIPEEQ	Hydrophilic
624-643	TTKTCIHRFRKYVKDEAQKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-32	KPKPSGTSKPPPRATRKAPRPAPK
135-166	KDKQKPLPSKAGGPGGKKMPFKKKTKQVIPIP
170-171	RK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 6, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTISMFLPKPKPSGTSKPPPRATRKAPRPAPKDEPESQGPVMDEPGTFTDYKIITHDPIGRKYNVVKFDSKKPITIQQWNRPVRMNRKNPKPIHDSADFDDRSVTPMLGLDGKPVIGPDGKPVLVYPDGKVVQPKDKQKPLPSKAGGPGGKKMPFKKKTKQVIPIPEEQRKMRKEERFPWVLEDGSGKETWTGKMDEVMDKNSHWAFFMPMVPTPTHNYDHFLFVPAHRWYKMQKRPHYRTLGLEEAEEEIARMQKSKNPQHWLMRRKGKQISDASAATFKAEAEGRTGGLGESSQISASGFTQGPGGRRLKAVDYGQRGRFEEDDEFGDSEGRRRKKEQGGEGEIDELEFEEDFADDDEQGDPDPMDDEEAKELEERLKKEYRQANKTNEAYVDGPDDDDDDDQHLTGAGKDMSKLIKKIDRGAAYISDGEENPYAMVQVESDEDEPEEQKPPEPTQPPQSQSQSTNGSSSQTQPSRPVKPLPASQSLPNVQRGSQPNPPSRANSPGLGNSLVAKRATSPKAPKAKIPGTNGSRATSPLASGGSRAASPVAPGSKPASRATSPVAPSKRKAEDHDEVASNAASPQSAGVKVKKQKTSTDSPAPVGPLTEEMVIEWLRQTPDATTKTCIHRFRKYVKDEAQKLHFTSMIKKLAHLKGGVLVLRSNNSGPSTPAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.6
3	0.67
4	0.73
5	0.8
6	0.85
7	0.86
8	0.86
9	0.86
10	0.87
11	0.87
12	0.87
13	0.88
14	0.89
15	0.86
16	0.85
17	0.84
18	0.81
19	0.78
20	0.72
21	0.69
22	0.64
23	0.62
24	0.54
25	0.47
26	0.4
27	0.33
28	0.29
29	0.23
30	0.18
31	0.15
32	0.17
33	0.17
34	0.16
35	0.16
36	0.19
37	0.19
38	0.2
39	0.21
40	0.22
41	0.2
42	0.25
43	0.33
44	0.33
45	0.4
46	0.44
47	0.42
48	0.43
49	0.48
50	0.51
51	0.51
52	0.49
53	0.5
54	0.5
55	0.58
56	0.66
57	0.6
58	0.57
59	0.54
60	0.59
61	0.59
62	0.64
63	0.64
64	0.64
65	0.72
66	0.73
67	0.71
68	0.7
69	0.71
70	0.71
71	0.72
72	0.73
73	0.73
74	0.79
75	0.87
76	0.84
77	0.84
78	0.81
79	0.75
80	0.71
81	0.66
82	0.59
83	0.53
84	0.57
85	0.48
86	0.4
87	0.38
88	0.31
89	0.29
90	0.25
91	0.21
92	0.11
93	0.12
94	0.13
95	0.15
96	0.14
97	0.13
98	0.13
99	0.13
100	0.13
101	0.12
102	0.13
103	0.11
104	0.12
105	0.15
106	0.18
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.21
111	0.22
112	0.23
113	0.19
114	0.23
115	0.24
116	0.25
117	0.3
118	0.29
119	0.34
120	0.4
121	0.49
122	0.51
123	0.59
124	0.65
125	0.7
126	0.77
127	0.74
128	0.77
129	0.7
130	0.66
131	0.62
132	0.64
133	0.59
134	0.5
135	0.5
136	0.46
137	0.49
138	0.49
139	0.52
140	0.54
141	0.59
142	0.65
143	0.69
144	0.73
145	0.78
146	0.82
147	0.84
148	0.82
149	0.83
150	0.8
151	0.8
152	0.77
153	0.73
154	0.68
155	0.63
156	0.62
157	0.55
158	0.57
159	0.56
160	0.57
161	0.6
162	0.64
163	0.68
164	0.64
165	0.62
166	0.58
167	0.52
168	0.43
169	0.35
170	0.28
171	0.21
172	0.19
173	0.18
174	0.14
175	0.14
176	0.15
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.13
181	0.17
182	0.19
183	0.21
184	0.22
185	0.24
186	0.22
187	0.21
188	0.24
189	0.22
190	0.2
191	0.15
192	0.14
193	0.12
194	0.13
195	0.16
196	0.13
197	0.14
198	0.17
199	0.16
200	0.18
201	0.2
202	0.22
203	0.22
204	0.22
205	0.24
206	0.23
207	0.26
208	0.25
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.23
213	0.23
214	0.25
215	0.21
216	0.23
217	0.26
218	0.36
219	0.44
220	0.48
221	0.54
222	0.63
223	0.7
224	0.77
225	0.78
226	0.7
227	0.67
228	0.63
229	0.58
230	0.47
231	0.4
232	0.31
233	0.25
234	0.22
235	0.17
236	0.11
237	0.07
238	0.09
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.12
243	0.22
244	0.31
245	0.38
246	0.42
247	0.48
248	0.56
249	0.65
250	0.69
251	0.69
252	0.71
253	0.68
254	0.69
255	0.7
256	0.63
257	0.62
258	0.58
259	0.53
260	0.46
261	0.42
262	0.36
263	0.31
264	0.28
265	0.2
266	0.16
267	0.11
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.1
276	0.08
277	0.07
278	0.06
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.17
294	0.19
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.18
299	0.21
300	0.22
301	0.23
302	0.28
303	0.33
304	0.35
305	0.37
306	0.36
307	0.33
308	0.3
309	0.27
310	0.21
311	0.17
312	0.15
313	0.14
314	0.13
315	0.12
316	0.13
317	0.11
318	0.14
319	0.2
320	0.22
321	0.23
322	0.26
323	0.33
324	0.39
325	0.46
326	0.49
327	0.5
328	0.52
329	0.51
330	0.48
331	0.41
332	0.34
333	0.27
334	0.19
335	0.1
336	0.06
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.04
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.11
363	0.15
364	0.16
365	0.2
366	0.25
367	0.25
368	0.33
369	0.4
370	0.44
371	0.49
372	0.55
373	0.57
374	0.6
375	0.61
376	0.55
377	0.47
378	0.41
379	0.33
380	0.26
381	0.21
382	0.13
383	0.12
384	0.1
385	0.1
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.1
401	0.13
402	0.15
403	0.16
404	0.18
405	0.22
406	0.23
407	0.29
408	0.33
409	0.31
410	0.3
411	0.31
412	0.27
413	0.24
414	0.23
415	0.19
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.1
436	0.12
437	0.12
438	0.14
439	0.17
440	0.19
441	0.26
442	0.29
443	0.31
444	0.37
445	0.43
446	0.44
447	0.47
448	0.49
449	0.45
450	0.43
451	0.45
452	0.41
453	0.36
454	0.35
455	0.29
456	0.26
457	0.24
458	0.25
459	0.28
460	0.25
461	0.25
462	0.32
463	0.38
464	0.41
465	0.44
466	0.45
467	0.43
468	0.46
469	0.51
470	0.49
471	0.49
472	0.46
473	0.45
474	0.47
475	0.45
476	0.43
477	0.42
478	0.37
479	0.31
480	0.36
481	0.39
482	0.38
483	0.41
484	0.46
485	0.47
486	0.51
487	0.52
488	0.5
489	0.48
490	0.49
491	0.44
492	0.38
493	0.34
494	0.32
495	0.31
496	0.27
497	0.25
498	0.21
499	0.2
500	0.2
501	0.17
502	0.15
503	0.16
504	0.23
505	0.27
506	0.32
507	0.38
508	0.45
509	0.55
510	0.56
511	0.57
512	0.59
513	0.63
514	0.63
515	0.61
516	0.62
517	0.56
518	0.62
519	0.59
520	0.52
521	0.44
522	0.39
523	0.35
524	0.26
525	0.22
526	0.16
527	0.16
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.11
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.13
538	0.15
539	0.14
540	0.16
541	0.2
542	0.22
543	0.25
544	0.27
545	0.29
546	0.27
547	0.3
548	0.33
549	0.36
550	0.36
551	0.42
552	0.47
553	0.46
554	0.49
555	0.54
556	0.56
557	0.53
558	0.56
559	0.56
560	0.55
561	0.55
562	0.57
563	0.5
564	0.43
565	0.4
566	0.34
567	0.25
568	0.19
569	0.14
570	0.09
571	0.07
572	0.08
573	0.1
574	0.13
575	0.16
576	0.21
577	0.3
578	0.38
579	0.47
580	0.53
581	0.54
582	0.6
583	0.63
584	0.68
585	0.67
586	0.69
587	0.64
588	0.59
589	0.58
590	0.51
591	0.44
592	0.35
593	0.27
594	0.19
595	0.17
596	0.15
597	0.12
598	0.1
599	0.13
600	0.13
601	0.12
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.15
606	0.15
607	0.15
608	0.23
609	0.27
610	0.29
611	0.31
612	0.36
613	0.44
614	0.52
615	0.58
616	0.57
617	0.62
618	0.68
619	0.73
620	0.77
621	0.75
622	0.77
623	0.77
624	0.81
625	0.79
626	0.78
627	0.76
628	0.71
629	0.67
630	0.6
631	0.53
632	0.44
633	0.43
634	0.44
635	0.44
636	0.39
637	0.4
638	0.47
639	0.49
640	0.52
641	0.45
642	0.38
643	0.35
644	0.39
645	0.38
646	0.3
647	0.27
648	0.25
649	0.27
650	0.28
651	0.24
652	0.23
653	0.24
654	0.24

A0A166BSZ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer