Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PJS6

Protein Details
Accession J5PJS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87QSDTHKIKRLNPKKQVDQKNSKDKKKLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVKSVKKTSTKEAVNKKTAEEKSVQEKEELKLESSSGSSDEEDEKDDNEIKGLAASDDEQSDTHKIKRLNPKKQVDQKNSKDKKKLDEYSGIIYVSRLPHGFHEKELSKYFAQFGDLREVRLARNKKTGNSRHYGFLEFVNKEDAFVAQESMNNYLLMGHLLQVRLLPKDAKIEKLYKYKKRVLVEKGVTKPVKQLKENMKLKHEERINKLAKSGIEFKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.71
3 0.66
4 0.66
5 0.59
6 0.54
7 0.47
8 0.43
9 0.46
10 0.51
11 0.48
12 0.42
13 0.44
14 0.41
15 0.44
16 0.4
17 0.31
18 0.26
19 0.25
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.16
33 0.18
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.1
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.21
52 0.23
53 0.3
54 0.42
55 0.5
56 0.57
57 0.65
58 0.71
59 0.76
60 0.84
61 0.86
62 0.85
63 0.85
64 0.84
65 0.85
66 0.85
67 0.82
68 0.8
69 0.73
70 0.72
71 0.71
72 0.67
73 0.6
74 0.57
75 0.53
76 0.48
77 0.45
78 0.37
79 0.27
80 0.22
81 0.19
82 0.14
83 0.13
84 0.09
85 0.09
86 0.12
87 0.18
88 0.19
89 0.17
90 0.22
91 0.23
92 0.26
93 0.27
94 0.27
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.15
99 0.16
100 0.14
101 0.14
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.2
107 0.18
108 0.25
109 0.28
110 0.22
111 0.31
112 0.32
113 0.36
114 0.46
115 0.53
116 0.51
117 0.53
118 0.51
119 0.48
120 0.48
121 0.44
122 0.35
123 0.3
124 0.3
125 0.24
126 0.23
127 0.22
128 0.2
129 0.19
130 0.18
131 0.15
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.22
157 0.24
158 0.27
159 0.31
160 0.35
161 0.39
162 0.49
163 0.58
164 0.58
165 0.64
166 0.67
167 0.69
168 0.72
169 0.74
170 0.71
171 0.72
172 0.71
173 0.72
174 0.69
175 0.71
176 0.65
177 0.57
178 0.58
179 0.56
180 0.55
181 0.49
182 0.53
183 0.54
184 0.64
185 0.71
186 0.69
187 0.67
188 0.67
189 0.66
190 0.66
191 0.64
192 0.61
193 0.61
194 0.65
195 0.64
196 0.58
197 0.58
198 0.53
199 0.47
200 0.45