Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PJ39

Protein Details
Accession J5PJ39    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-109DDIYAKKYKLKRQIRRLKHRLRLRKIEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-80KHKLR
85-107YAKKYKLKRQIRRLKHRLRLRKI
131-136REKPKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MMSNQAFLTFATQNGAKEFLSRYSVTALKIQGRKVKIGMAQTSSLLGLSMQMQKNKDNGEKNNSYLKKVLKTRELKHKLRNDDIYAKKYKLKRQIRRLKHRLRLRKIEDPEIDRIVTEFKSRRLEKMESQREKPKKPQESSKQAKMSNTIENPPNRVLLVQNLPSGTTEQSLSQILGNESLLEIRLVSVRNLAFVEYKTVSDATKIKNHLGPTYKVKNNDVTIGFAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.16
4 0.17
5 0.19
6 0.19
7 0.22
8 0.21
9 0.21
10 0.23
11 0.26
12 0.25
13 0.27
14 0.28
15 0.32
16 0.35
17 0.39
18 0.42
19 0.42
20 0.43
21 0.4
22 0.41
23 0.37
24 0.39
25 0.38
26 0.34
27 0.32
28 0.3
29 0.29
30 0.24
31 0.2
32 0.13
33 0.09
34 0.07
35 0.09
36 0.15
37 0.18
38 0.21
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.34
43 0.37
44 0.38
45 0.4
46 0.46
47 0.47
48 0.48
49 0.55
50 0.51
51 0.47
52 0.44
53 0.43
54 0.41
55 0.45
56 0.47
57 0.47
58 0.54
59 0.58
60 0.65
61 0.7
62 0.69
63 0.72
64 0.74
65 0.71
66 0.7
67 0.67
68 0.61
69 0.61
70 0.6
71 0.56
72 0.52
73 0.47
74 0.46
75 0.47
76 0.5
77 0.51
78 0.57
79 0.6
80 0.68
81 0.76
82 0.81
83 0.87
84 0.9
85 0.9
86 0.88
87 0.88
88 0.87
89 0.85
90 0.84
91 0.79
92 0.77
93 0.71
94 0.69
95 0.63
96 0.55
97 0.5
98 0.41
99 0.35
100 0.26
101 0.22
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.15
107 0.23
108 0.24
109 0.27
110 0.3
111 0.34
112 0.37
113 0.46
114 0.53
115 0.5
116 0.55
117 0.62
118 0.63
119 0.65
120 0.67
121 0.66
122 0.65
123 0.65
124 0.71
125 0.71
126 0.75
127 0.77
128 0.77
129 0.74
130 0.66
131 0.63
132 0.57
133 0.5
134 0.47
135 0.41
136 0.37
137 0.36
138 0.35
139 0.37
140 0.33
141 0.31
142 0.23
143 0.22
144 0.18
145 0.18
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.16
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.2
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.19
189 0.24
190 0.24
191 0.3
192 0.33
193 0.35
194 0.39
195 0.41
196 0.44
197 0.44
198 0.45
199 0.48
200 0.54
201 0.55
202 0.57
203 0.58
204 0.58
205 0.55
206 0.56
207 0.48