Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4U406

Protein Details
Accession J4U406    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-101LTDKGFKVPKKPQRSKEEAIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, cyto 13.5, nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01268  UPF0024  
Amino Acid Sequences MSDLDIATVKRPLDTNVEFSENNAKKLKVDQRIRIDSGIHETDVGISLFLSPELPGFRGQIKQRYTDFLVNEIDQEGNVVHLTDKGFKVPKKPQRSKEEAIAEKEAEAARREEFNVNPALREELVEMFGEEDVSKIESVYRMANKMETSKVFEDKSVRTKIHQLLRQAFNNELESVTTDTNTFKIARSSRNSRTNKQEKINQTKDSNGVENWGYGPSKDFIHFTLHKENKDTMEGVNVITKLLRVPSRVIRYAGTKDRRAVTCQRLSISKIGLDRLNALNRTLKGMIIGNYNFSDAGLNLGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.32
4 0.36
5 0.34
6 0.35
7 0.43
8 0.37
9 0.38
10 0.37
11 0.33
12 0.3
13 0.4
14 0.47
15 0.46
16 0.53
17 0.58
18 0.64
19 0.71
20 0.72
21 0.64
22 0.57
23 0.48
24 0.46
25 0.39
26 0.29
27 0.22
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.16
32 0.09
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.05
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.15
45 0.21
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.38
50 0.39
51 0.43
52 0.44
53 0.43
54 0.39
55 0.34
56 0.34
57 0.29
58 0.28
59 0.23
60 0.18
61 0.13
62 0.12
63 0.09
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.07
69 0.09
70 0.12
71 0.13
72 0.16
73 0.22
74 0.24
75 0.32
76 0.4
77 0.49
78 0.56
79 0.65
80 0.7
81 0.74
82 0.81
83 0.77
84 0.75
85 0.75
86 0.68
87 0.62
88 0.55
89 0.46
90 0.37
91 0.35
92 0.27
93 0.2
94 0.16
95 0.14
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.17
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.07
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.14
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.27
143 0.27
144 0.26
145 0.25
146 0.31
147 0.36
148 0.4
149 0.4
150 0.4
151 0.43
152 0.47
153 0.49
154 0.44
155 0.39
156 0.33
157 0.3
158 0.25
159 0.17
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.14
172 0.17
173 0.23
174 0.29
175 0.37
176 0.44
177 0.53
178 0.59
179 0.59
180 0.67
181 0.69
182 0.7
183 0.69
184 0.68
185 0.68
186 0.73
187 0.74
188 0.69
189 0.61
190 0.57
191 0.55
192 0.49
193 0.42
194 0.31
195 0.27
196 0.21
197 0.2
198 0.17
199 0.15
200 0.13
201 0.1
202 0.13
203 0.11
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.2
209 0.23
210 0.26
211 0.35
212 0.38
213 0.39
214 0.42
215 0.43
216 0.38
217 0.38
218 0.34
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.1
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.19
233 0.28
234 0.35
235 0.38
236 0.39
237 0.36
238 0.4
239 0.45
240 0.5
241 0.49
242 0.47
243 0.49
244 0.54
245 0.55
246 0.55
247 0.57
248 0.56
249 0.56
250 0.55
251 0.53
252 0.5
253 0.5
254 0.49
255 0.42
256 0.36
257 0.31
258 0.31
259 0.3
260 0.27
261 0.28
262 0.3
263 0.34
264 0.31
265 0.32
266 0.34
267 0.33
268 0.37
269 0.34
270 0.28
271 0.24
272 0.26
273 0.26
274 0.27
275 0.27
276 0.25
277 0.25
278 0.26
279 0.23
280 0.2
281 0.19
282 0.12