Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PHX7

Protein Details
Accession J5PHX7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-115DYVKKPRVVLSERKRRRRRATVLQPDSNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-105SERKRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033896  MADS_MEF2-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00265  MADS_MEF2_like  
Amino Acid Sequences MGRRKIEIEPIKDDRNRTVTFIKRKAGLFKKAHELSVLCQVDIAVIILGSNNTFYEYSSVDMSNLITVHQNNADLPHNVIEPSDYGDYVKKPRVVLSERKRRRRRATVLQPDSNSGSSTISSQDSSGVQEKRNLSVPMVSNDIGNTVAGNSLIHMQGSISGSVSSNSGYTSNNVNYPMLQDYLHSGGSFYANNYKENNGQQPHANEVAYASHMNKRIRLGTHSLLPGSNKPNYGNFYPSPYDKLPKPPLASSLMGNIPPIQSQFVQVIPGNSNPIGRSFNGTGDSVTFETRQKIPPKVTVSNASDGPAPVQTMVHHLNQLNRNRERLSEKPSLTLNIPKVMKYSCQKSPVPYSFAASPKTDVQSNTEHISSSIISSPFSHSAISAFRSNDINESNHNGRSAGTHVNNETFFLKPADW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.53
4 0.5
5 0.53
6 0.53
7 0.6
8 0.64
9 0.62
10 0.6
11 0.61
12 0.67
13 0.66
14 0.67
15 0.63
16 0.61
17 0.66
18 0.63
19 0.61
20 0.54
21 0.46
22 0.39
23 0.43
24 0.38
25 0.27
26 0.25
27 0.24
28 0.2
29 0.19
30 0.16
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.05
37 0.06
38 0.05
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.18
60 0.2
61 0.18
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.14
70 0.13
71 0.11
72 0.12
73 0.15
74 0.19
75 0.23
76 0.29
77 0.28
78 0.28
79 0.31
80 0.38
81 0.42
82 0.49
83 0.54
84 0.6
85 0.67
86 0.77
87 0.83
88 0.86
89 0.89
90 0.89
91 0.88
92 0.88
93 0.89
94 0.9
95 0.89
96 0.85
97 0.76
98 0.68
99 0.61
100 0.5
101 0.39
102 0.28
103 0.2
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.14
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.26
117 0.27
118 0.28
119 0.32
120 0.3
121 0.24
122 0.26
123 0.27
124 0.24
125 0.26
126 0.23
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.13
131 0.1
132 0.08
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.23
184 0.29
185 0.23
186 0.24
187 0.25
188 0.25
189 0.27
190 0.24
191 0.21
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.11
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.26
207 0.23
208 0.26
209 0.25
210 0.24
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.19
217 0.19
218 0.21
219 0.24
220 0.24
221 0.25
222 0.22
223 0.24
224 0.25
225 0.25
226 0.27
227 0.25
228 0.27
229 0.25
230 0.33
231 0.35
232 0.37
233 0.39
234 0.35
235 0.37
236 0.37
237 0.36
238 0.28
239 0.25
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.16
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.15
271 0.17
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.16
277 0.18
278 0.24
279 0.28
280 0.33
281 0.35
282 0.41
283 0.46
284 0.47
285 0.48
286 0.49
287 0.47
288 0.44
289 0.41
290 0.35
291 0.29
292 0.25
293 0.23
294 0.16
295 0.13
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.13
300 0.16
301 0.16
302 0.19
303 0.21
304 0.27
305 0.34
306 0.42
307 0.46
308 0.45
309 0.48
310 0.46
311 0.49
312 0.49
313 0.48
314 0.48
315 0.48
316 0.46
317 0.45
318 0.46
319 0.44
320 0.39
321 0.4
322 0.35
323 0.34
324 0.34
325 0.31
326 0.32
327 0.31
328 0.35
329 0.35
330 0.39
331 0.38
332 0.44
333 0.46
334 0.49
335 0.58
336 0.56
337 0.55
338 0.49
339 0.46
340 0.45
341 0.46
342 0.44
343 0.35
344 0.33
345 0.32
346 0.34
347 0.33
348 0.29
349 0.29
350 0.31
351 0.33
352 0.33
353 0.29
354 0.27
355 0.24
356 0.25
357 0.21
358 0.17
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.22
364 0.23
365 0.23
366 0.21
367 0.16
368 0.18
369 0.21
370 0.23
371 0.22
372 0.21
373 0.22
374 0.25
375 0.26
376 0.28
377 0.28
378 0.27
379 0.26
380 0.33
381 0.34
382 0.34
383 0.34
384 0.3
385 0.27
386 0.27
387 0.27
388 0.29
389 0.28
390 0.31
391 0.33
392 0.38
393 0.37
394 0.37
395 0.35
396 0.27
397 0.26