FuNGI

A0A165XYD4

Protein Details

Accession

A0A165XYD4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
122-147	EDMIRKMQEARKRRRLKQELEDSTHS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
132-136	RKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MTSLVGDIVERKSGSTSSNAPPSRPTGTNTTGFPLVQHRSQSAFSRARQAAQRNPPTTSVPRINPVASTTGNSKPQPPPSDDIQSLQGQISEENERRVAAMSPQEREQEIDSVKEHLGVGIEDMIRKMQEARKRRRLKQELEDSTHSHGPRTCSGATKQILTCTLDKRPSSPLPDFRDKDPAEPSLESIDIESHIPTSPTQPPVHQASLKSAVAIKRLGPPEADHPDRPSSTPPRMRKLRFADPKPSDIHVYESAPSSPRRVMGLLPLPDERDQAGPSSNVVQLPTLPFSSLRRRVPQPQESQESPSGSSNDNSDGTPEHIRAQYFPEAPSDDPSLAWIRDVPSSVVSFSSGQPEEPRFDLQGRTLSAEDASALPTHLGLHHHSNPSQLAGYTLADLLHLSRSTVPSQRSTMLTVLSRILRRERLSEDVFKKIFAVGLEASQVGTNLNVCTSGVELLWSALVKSASPAEESTLKSIPTESLISLFAEHLSSQVLPRTSLLQILETLLKLVTLSPDLCASVLSIPQLLPLIVRVFLPPPTGNDGPSAEVNALRLFHQLARSSRANAEKLSETADAALRFLVIIPDTSSAQLLAAETLTFYSILGRYGLYAHIAATANAHISKLGNNLLVQLQNGVHSPSLEYLAEAWLHLLECWVVCAIDPHQTSPPHEILWTQISNWEWGETILELLLVSSSRLGVVWTAACRALSAWVDGAAVNSPRNGEQERTLVYEKLRHAISDGDIQDALQEDVNSLMISLRDTGRDSLSLAEERSFDRLSATLKLVLSTHPPIGSDTETQTALDLPITFTSMQALADLIVDASSIIPSPRTAAFLQVQTRLRRRLRRESDMEWLSFAMTLPTSVPLGEEEFIAWLFDQIAILLTKDLASALSIPTPPDMWDGKGIETLLPFLVESLYPSEIRLAPFFPTPKSLKFTSTQCNSPSLSARIVSLPAPRSWPLWPLDHLLRSGTSQVFRKLPPSWDASETDVVRASLVLCLVSQKLVKSKMPRSEAMFGCMKIFMLEHEQPNDASTSEVYRDKSVESSMRLLLNPYTWANRHDISEHSDDLSLEDAAKAYLGASTPFYQFYSDFLALYDAISFGHDLFGTLLLGPISQRYPRDYRKLLIGDHRHVLRYIRTEPGQVLSGDLSAYLYPVETNGESISLFLGALTLNAGLSGLEGFLRLIAVHHVSCNIWPDLRHHSGSKQGQDDQDAKEQERARRLLGLVSSQARAAVVRDVVRYRQMGPEVDVLLSPDCFDAPNEVVEQRRAWLRSIDSNLAERLNDHFSVPSV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.26
4	0.3
5	0.4
6	0.4
7	0.4
8	0.42
9	0.45
10	0.47
11	0.43
12	0.4
13	0.38
14	0.42
15	0.44
16	0.42
17	0.42
18	0.37
19	0.35
20	0.33
21	0.32
22	0.32
23	0.32
24	0.34
25	0.32
26	0.33
27	0.37
28	0.41
29	0.42
30	0.44
31	0.43
32	0.5
33	0.49
34	0.51
35	0.56
36	0.58
37	0.59
38	0.62
39	0.7
40	0.63
41	0.65
42	0.62
43	0.61
44	0.58
45	0.57
46	0.54
47	0.48
48	0.51
49	0.51
50	0.49
51	0.43
52	0.4
53	0.36
54	0.29
55	0.28
56	0.27
57	0.3
58	0.36
59	0.36
60	0.41
61	0.43
62	0.51
63	0.54
64	0.55
65	0.53
66	0.52
67	0.59
68	0.54
69	0.49
70	0.45
71	0.41
72	0.37
73	0.32
74	0.27
75	0.2
76	0.19
77	0.2
78	0.23
79	0.23
80	0.25
81	0.26
82	0.24
83	0.24
84	0.25
85	0.23
86	0.2
87	0.27
88	0.29
89	0.31
90	0.35
91	0.37
92	0.36
93	0.37
94	0.34
95	0.31
96	0.28
97	0.27
98	0.25
99	0.25
100	0.25
101	0.24
102	0.22
103	0.16
104	0.15
105	0.12
106	0.12
107	0.13
108	0.14
109	0.13
110	0.13
111	0.14
112	0.13
113	0.13
114	0.18
115	0.21
116	0.29
117	0.39
118	0.5
119	0.59
120	0.7
121	0.78
122	0.84
123	0.87
124	0.88
125	0.88
126	0.88
127	0.86
128	0.84
129	0.79
130	0.7
131	0.66
132	0.62
133	0.51
134	0.44
135	0.38
136	0.35
137	0.35
138	0.37
139	0.34
140	0.33
141	0.36
142	0.41
143	0.39
144	0.4
145	0.38
146	0.36
147	0.37
148	0.36
149	0.38
150	0.33
151	0.39
152	0.4
153	0.4
154	0.39
155	0.43
156	0.46
157	0.48
158	0.52
159	0.53
160	0.55
161	0.64
162	0.65
163	0.6
164	0.64
165	0.58
166	0.54
167	0.49
168	0.44
169	0.38
170	0.35
171	0.34
172	0.27
173	0.26
174	0.22
175	0.18
176	0.16
177	0.12
178	0.13
179	0.11
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.15
185	0.2
186	0.24
187	0.26
188	0.26
189	0.31
190	0.36
191	0.41
192	0.39
193	0.35
194	0.36
195	0.41
196	0.39
197	0.35
198	0.33
199	0.29
200	0.29
201	0.29
202	0.25
203	0.26
204	0.28
205	0.28
206	0.25
207	0.26
208	0.31
209	0.38
210	0.41
211	0.35
212	0.37
213	0.41
214	0.42
215	0.41
216	0.41
217	0.4
218	0.45
219	0.53
220	0.56
221	0.61
222	0.69
223	0.71
224	0.73
225	0.73
226	0.74
227	0.75
228	0.74
229	0.75
230	0.7
231	0.7
232	0.64
233	0.58
234	0.51
235	0.41
236	0.4
237	0.33
238	0.3
239	0.26
240	0.25
241	0.24
242	0.23
243	0.24
244	0.22
245	0.2
246	0.2
247	0.21
248	0.2
249	0.19
250	0.24
251	0.3
252	0.29
253	0.3
254	0.3
255	0.3
256	0.3
257	0.3
258	0.24
259	0.18
260	0.16
261	0.15
262	0.16
263	0.14
264	0.14
265	0.16
266	0.17
267	0.15
268	0.15
269	0.14
270	0.14
271	0.16
272	0.16
273	0.14
274	0.13
275	0.14
276	0.18
277	0.28
278	0.34
279	0.37
280	0.42
281	0.47
282	0.56
283	0.65
284	0.69
285	0.69
286	0.68
287	0.7
288	0.65
289	0.65
290	0.59
291	0.51
292	0.44
293	0.37
294	0.32
295	0.26
296	0.24
297	0.2
298	0.2
299	0.19
300	0.17
301	0.15
302	0.14
303	0.16
304	0.18
305	0.18
306	0.18
307	0.2
308	0.2
309	0.2
310	0.24
311	0.26
312	0.25
313	0.25
314	0.24
315	0.24
316	0.24
317	0.27
318	0.24
319	0.18
320	0.17
321	0.18
322	0.19
323	0.16
324	0.16
325	0.14
326	0.13
327	0.14
328	0.16
329	0.14
330	0.13
331	0.14
332	0.14
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.17
338	0.16
339	0.16
340	0.19
341	0.21
342	0.21
343	0.22
344	0.23
345	0.19
346	0.21
347	0.21
348	0.2
349	0.23
350	0.21
351	0.22
352	0.2
353	0.19
354	0.17
355	0.15
356	0.14
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.09
366	0.11
367	0.17
368	0.22
369	0.25
370	0.26
371	0.28
372	0.27
373	0.26
374	0.24
375	0.18
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.1
380	0.1
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.07
387	0.08
388	0.09
389	0.11
390	0.14
391	0.19
392	0.21
393	0.22
394	0.24
395	0.26
396	0.26
397	0.26
398	0.24
399	0.22
400	0.2
401	0.18
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.2
406	0.23
407	0.26
408	0.27
409	0.29
410	0.3
411	0.33
412	0.36
413	0.42
414	0.41
415	0.43
416	0.41
417	0.38
418	0.34
419	0.28
420	0.25
421	0.16
422	0.16
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.08
429	0.08
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.14
457	0.14
458	0.17
459	0.17
460	0.16
461	0.15
462	0.16
463	0.14
464	0.12
465	0.12
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.12
484	0.12
485	0.14
486	0.13
487	0.11
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.09
492	0.09
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.07
520	0.08
521	0.08
522	0.11
523	0.1
524	0.11
525	0.17
526	0.17
527	0.17
528	0.18
529	0.18
530	0.17
531	0.17
532	0.15
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.12
543	0.15
544	0.16
545	0.21
546	0.22
547	0.23
548	0.26
549	0.29
550	0.28
551	0.24
552	0.25
553	0.21
554	0.2
555	0.21
556	0.17
557	0.13
558	0.12
559	0.14
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.05
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.08
602	0.08
603	0.08
604	0.07
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.07
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.09
613	0.1
614	0.1
615	0.09
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.07
622	0.06
623	0.07
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.06
633	0.04
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.03
638	0.03
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.03
643	0.04
644	0.05
645	0.12
646	0.12
647	0.13
648	0.17
649	0.18
650	0.2
651	0.23
652	0.23
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.14
657	0.17
658	0.16
659	0.12
660	0.13
661	0.13
662	0.14
663	0.14
664	0.12
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.06
669	0.05
670	0.04
671	0.04
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.03
679	0.03
680	0.03
681	0.03
682	0.03
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.06
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.06
700	0.07
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.1
706	0.11
707	0.11
708	0.13
709	0.15
710	0.16
711	0.19
712	0.2
713	0.19
714	0.18
715	0.22
716	0.21
717	0.22
718	0.21
719	0.17
720	0.16
721	0.16
722	0.17
723	0.18
724	0.17
725	0.15
726	0.14
727	0.14
728	0.14
729	0.13
730	0.12
731	0.06
732	0.06
733	0.05
734	0.05
735	0.06
736	0.05
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.05
741	0.06
742	0.06
743	0.07
744	0.08
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.12
751	0.12
752	0.11
753	0.11
754	0.11
755	0.11
756	0.14
757	0.13
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.12
762	0.14
763	0.14
764	0.14
765	0.14
766	0.14
767	0.14
768	0.14
769	0.15
770	0.15
771	0.15
772	0.12
773	0.13
774	0.13
775	0.15
776	0.16
777	0.14
778	0.14
779	0.14
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.12
784	0.09
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.06
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.07
794	0.07
795	0.06
796	0.06
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.04
801	0.03
802	0.03
803	0.03
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.04
809	0.04
810	0.06
811	0.07
812	0.1
813	0.1
814	0.14
815	0.16
816	0.2
817	0.23
818	0.27
819	0.32
820	0.34
821	0.4
822	0.45
823	0.5
824	0.54
825	0.59
826	0.64
827	0.67
828	0.7
829	0.71
830	0.66
831	0.68
832	0.62
833	0.55
834	0.44
835	0.36
836	0.27
837	0.21
838	0.17
839	0.09
840	0.06
841	0.06
842	0.05
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.08
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.06
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.04
860	0.04
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.05
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.04
870	0.04
871	0.05
872	0.05
873	0.07
874	0.08
875	0.08
876	0.09
877	0.09
878	0.09
879	0.12
880	0.13
881	0.12
882	0.16
883	0.17
884	0.17
885	0.18
886	0.17
887	0.14
888	0.13
889	0.13
890	0.09
891	0.08
892	0.07
893	0.06
894	0.06
895	0.05
896	0.06
897	0.08
898	0.09
899	0.09
900	0.1
901	0.12
902	0.13
903	0.15
904	0.15
905	0.14
906	0.14
907	0.18
908	0.19
909	0.18
910	0.22
911	0.24
912	0.26
913	0.3
914	0.29
915	0.29
916	0.32
917	0.36
918	0.4
919	0.41
920	0.42
921	0.39
922	0.41
923	0.38
924	0.36
925	0.35
926	0.28
927	0.25
928	0.21
929	0.21
930	0.18
931	0.19
932	0.18
933	0.19
934	0.19
935	0.18
936	0.21
937	0.21
938	0.22
939	0.22
940	0.25
941	0.23
942	0.24
943	0.25
944	0.26
945	0.3
946	0.29
947	0.29
948	0.25
949	0.23
950	0.21
951	0.22
952	0.2
953	0.19
954	0.21
955	0.24
956	0.27
957	0.27
958	0.31
959	0.31
960	0.32
961	0.32
962	0.34
963	0.33
964	0.32
965	0.33
966	0.32
967	0.34
968	0.31
969	0.28
970	0.24
971	0.21
972	0.18
973	0.16
974	0.13
975	0.08
976	0.08
977	0.07
978	0.06
979	0.07
980	0.08
981	0.1
982	0.1
983	0.11
984	0.17
985	0.21
986	0.26
987	0.33
988	0.41
989	0.47
990	0.51
991	0.53
992	0.53
993	0.57
994	0.53
995	0.49
996	0.45
997	0.36
998	0.32
999	0.29
1000	0.23
1001	0.15
1002	0.14
1003	0.11
1004	0.15
1005	0.19
1006	0.21
1007	0.23
1008	0.24
1009	0.24
1010	0.25
1011	0.24
1012	0.17
1013	0.13
1014	0.11
1015	0.11
1016	0.14
1017	0.17
1018	0.18
1019	0.19
1020	0.2
1021	0.2
1022	0.21
1023	0.22
1024	0.23
1025	0.22
1026	0.24
1027	0.25
1028	0.26
1029	0.25
1030	0.25
1031	0.22
1032	0.19
1033	0.19
1034	0.18
1035	0.2
1036	0.19
1037	0.22
1038	0.24
1039	0.25
1040	0.25
1041	0.24
1042	0.25
1043	0.27
1044	0.29
1045	0.28
1046	0.25
1047	0.24
1048	0.23
1049	0.21
1050	0.2
1051	0.14
1052	0.1
1053	0.09
1054	0.08
1055	0.07
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.05
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.07
1062	0.09
1063	0.12
1064	0.13
1065	0.14
1066	0.15
1067	0.15
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.2
1071	0.19
1072	0.18
1073	0.17
1074	0.18
1075	0.16
1076	0.16
1077	0.14
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.07
1082	0.06
1083	0.07
1084	0.06
1085	0.07
1086	0.07
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.08
1091	0.07
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.08
1095	0.11
1096	0.14
1097	0.16
1098	0.21
1099	0.3
1100	0.38
1101	0.47
1102	0.5
1103	0.5
1104	0.55
1105	0.57
1106	0.56
1107	0.57
1108	0.58
1109	0.53
1110	0.55
1111	0.55
1112	0.47
1113	0.45
1114	0.43
1115	0.38
1116	0.37
1117	0.35
1118	0.35
1119	0.35
1120	0.35
1121	0.35
1122	0.35
1123	0.32
1124	0.25
1125	0.23
1126	0.17
1127	0.16
1128	0.13
1129	0.12
1130	0.1
1131	0.07
1132	0.08
1133	0.06
1134	0.06
1135	0.05
1136	0.06
1137	0.09
1138	0.08
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.1
1142	0.1
1143	0.1
1144	0.1
1145	0.07
1146	0.07
1147	0.05
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.04
1154	0.04
1155	0.05
1156	0.04
1157	0.04
1158	0.04
1159	0.04
1160	0.04
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.05
1165	0.05
1166	0.05
1167	0.08
1168	0.12
1169	0.12
1170	0.13
1171	0.15
1172	0.15
1173	0.17
1174	0.21
1175	0.2
1176	0.19
1177	0.19
1178	0.23
1179	0.31
1180	0.35
1181	0.37
1182	0.36
1183	0.37
1184	0.45
1185	0.51
1186	0.54
1187	0.51
1188	0.5
1189	0.5
1190	0.53
1191	0.54
1192	0.48
1193	0.49
1194	0.45
1195	0.42
1196	0.44
1197	0.47
1198	0.47
1199	0.51
1200	0.49
1201	0.43
1202	0.44
1203	0.43
1204	0.4
1205	0.37
1206	0.34
1207	0.32
1208	0.32
1209	0.31
1210	0.26
1211	0.26
1212	0.21
1213	0.19
1214	0.17
1215	0.15
1216	0.16
1217	0.18
1218	0.22
1219	0.25
1220	0.28
1221	0.33
1222	0.33
1223	0.32
1224	0.34
1225	0.36
1226	0.34
1227	0.34
1228	0.36
1229	0.32
1230	0.3
1231	0.28
1232	0.23
1233	0.21
1234	0.18
1235	0.15
1236	0.11
1237	0.1
1238	0.1
1239	0.11
1240	0.14
1241	0.14
1242	0.16
1243	0.18
1244	0.2
1245	0.23
1246	0.25
1247	0.25
1248	0.24
1249	0.3
1250	0.3
1251	0.3
1252	0.33
1253	0.34
1254	0.4
1255	0.46
1256	0.48
1257	0.44
1258	0.45
1259	0.45
1260	0.41
1261	0.36
1262	0.29
1263	0.26
1264	0.26
1265	0.23
1266	0.21

A0A165XYD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer