Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166HVE0

Protein Details
Accession A0A166HVE0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-218PESLKDEKGKKKNKGKKSEAKVKKETGBasic
341-361ATPTETKPKPNDPKDPKAPKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-55RRKK
73-90RGGRGRGRGRGGARGGAP
198-216EKGKKKNKGKKSEAKVKKE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, cyto 14, nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSEPPVASTSAAGDSAPAPSGSKAIGSFAKKQDDITRKGTAKMKFVPTLPVRRKKAEGETKAEEPVASTSSDRGGRGRGRGRGGARGGAPREPVQMTASGPFAMGPALPSAGGRGRSDGTQMVPITPGASRALGANLTETTAPALKREKDKRAISVGSNTPDVEDVEVYSDPDEGVEIVDMSDVKKMDWMAPESLKDEKGKKKNKGKKSEAKVKKETGPPGPSTGEPSSIPSDEDEDMKDLANAIDLSESGDEEPSEDLVEHFAARNDALPDSGRSGKLFFFQFPKPFPTFVSAEPESADVEMTDVDAPPAASSSSTNPPPSEKALGKRVSFAPDVKLGAATPTETKPKPNDPKDPKAPKIVEPPPKVEGHIGQLELYRSGAVKLRLRNGTLLDVTSGSQTTFLQQAVHLDPTTKKLCVLGEVTQRFMVSPDIDALLDDVEKNDSLAFDQDDHAKPPAEQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.15
12 0.21
13 0.24
14 0.31
15 0.37
16 0.43
17 0.42
18 0.45
19 0.5
20 0.53
21 0.54
22 0.52
23 0.55
24 0.5
25 0.56
26 0.6
27 0.54
28 0.53
29 0.55
30 0.57
31 0.51
32 0.51
33 0.54
34 0.54
35 0.61
36 0.63
37 0.66
38 0.65
39 0.66
40 0.7
41 0.67
42 0.7
43 0.7
44 0.67
45 0.65
46 0.65
47 0.62
48 0.59
49 0.53
50 0.41
51 0.32
52 0.26
53 0.2
54 0.15
55 0.13
56 0.12
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.24
62 0.27
63 0.35
64 0.41
65 0.43
66 0.45
67 0.51
68 0.51
69 0.52
70 0.5
71 0.46
72 0.42
73 0.42
74 0.4
75 0.36
76 0.36
77 0.3
78 0.32
79 0.28
80 0.27
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.16
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.17
132 0.21
133 0.3
134 0.38
135 0.45
136 0.51
137 0.55
138 0.56
139 0.57
140 0.56
141 0.49
142 0.48
143 0.44
144 0.37
145 0.35
146 0.3
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.13
151 0.09
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.19
183 0.2
184 0.24
185 0.3
186 0.39
187 0.47
188 0.55
189 0.64
190 0.72
191 0.79
192 0.83
193 0.84
194 0.84
195 0.85
196 0.87
197 0.85
198 0.84
199 0.81
200 0.74
201 0.7
202 0.66
203 0.61
204 0.57
205 0.51
206 0.44
207 0.4
208 0.37
209 0.31
210 0.3
211 0.26
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.11
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.18
269 0.22
270 0.25
271 0.26
272 0.31
273 0.29
274 0.29
275 0.28
276 0.28
277 0.26
278 0.24
279 0.29
280 0.24
281 0.23
282 0.22
283 0.22
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.1
302 0.15
303 0.18
304 0.2
305 0.21
306 0.23
307 0.26
308 0.28
309 0.3
310 0.28
311 0.31
312 0.38
313 0.43
314 0.41
315 0.42
316 0.41
317 0.39
318 0.38
319 0.34
320 0.28
321 0.26
322 0.26
323 0.22
324 0.2
325 0.16
326 0.14
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.13
331 0.2
332 0.2
333 0.25
334 0.3
335 0.4
336 0.49
337 0.54
338 0.62
339 0.65
340 0.74
341 0.8
342 0.84
343 0.78
344 0.76
345 0.72
346 0.67
347 0.67
348 0.66
349 0.66
350 0.6
351 0.61
352 0.55
353 0.53
354 0.49
355 0.42
356 0.35
357 0.3
358 0.29
359 0.25
360 0.22
361 0.23
362 0.22
363 0.2
364 0.18
365 0.13
366 0.1
367 0.11
368 0.15
369 0.19
370 0.24
371 0.29
372 0.36
373 0.4
374 0.41
375 0.42
376 0.4
377 0.39
378 0.34
379 0.3
380 0.23
381 0.2
382 0.19
383 0.17
384 0.15
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.12
393 0.16
394 0.18
395 0.21
396 0.19
397 0.2
398 0.21
399 0.27
400 0.3
401 0.26
402 0.24
403 0.24
404 0.24
405 0.26
406 0.28
407 0.28
408 0.35
409 0.37
410 0.39
411 0.37
412 0.36
413 0.32
414 0.29
415 0.25
416 0.16
417 0.15
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.14
422 0.14
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.16
437 0.23
438 0.25
439 0.27
440 0.29
441 0.27