Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EEH8

Protein Details
Accession J6EEH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-71IPTQTIRRFSKKHSNKPRKPLGIAFHydrophilic
110-133TPEPDAKKLKEKKKGKKTPETAADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-64KKHSNKPR
115-126AKKLKEKKKGKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034244  Rrt5_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12409  RRM1_RRT5  
Amino Acid Sequences MTEQPTTDTAATPAAVTTVYISNLPFTASERDLHTFLSDYGASSVLIPTQTIRRFSKKHSNKPRKPLGIAFAQFANDTSASKAIQDLNGTIFQNQKLFLKLHVPYEAEPTPEPDAKKLKEKKKGKKTPETAADTVYCHDLPDDVTDSEIRELFQLYCPQEIWIYRSKVYKRKCIPFAPHQITAALVTLQSEKPIADICDDVVKTATLRSKPVTVKPAYVSKIQEIKQLVKDNLTNARDPPPPAAPAEVAQETQDNSEANEAPVCAPASSSDRPAVAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.11
13 0.12
14 0.16
15 0.17
16 0.19
17 0.21
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.23
22 0.19
23 0.18
24 0.2
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.16
37 0.2
38 0.25
39 0.3
40 0.37
41 0.41
42 0.48
43 0.58
44 0.61
45 0.69
46 0.74
47 0.81
48 0.82
49 0.89
50 0.91
51 0.87
52 0.81
53 0.75
54 0.68
55 0.65
56 0.57
57 0.48
58 0.38
59 0.31
60 0.27
61 0.23
62 0.2
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.12
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.19
87 0.19
88 0.21
89 0.22
90 0.22
91 0.2
92 0.25
93 0.25
94 0.21
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.26
102 0.26
103 0.36
104 0.42
105 0.47
106 0.55
107 0.64
108 0.71
109 0.76
110 0.84
111 0.83
112 0.85
113 0.82
114 0.8
115 0.79
116 0.74
117 0.64
118 0.56
119 0.47
120 0.37
121 0.32
122 0.25
123 0.17
124 0.1
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.21
152 0.27
153 0.33
154 0.39
155 0.44
156 0.5
157 0.52
158 0.58
159 0.62
160 0.63
161 0.65
162 0.66
163 0.72
164 0.68
165 0.61
166 0.53
167 0.47
168 0.4
169 0.33
170 0.24
171 0.14
172 0.08
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.14
192 0.19
193 0.16
194 0.19
195 0.2
196 0.27
197 0.3
198 0.36
199 0.41
200 0.37
201 0.4
202 0.41
203 0.46
204 0.41
205 0.42
206 0.39
207 0.37
208 0.42
209 0.39
210 0.41
211 0.37
212 0.4
213 0.42
214 0.47
215 0.42
216 0.39
217 0.4
218 0.38
219 0.44
220 0.41
221 0.36
222 0.31
223 0.36
224 0.36
225 0.36
226 0.36
227 0.31
228 0.3
229 0.29
230 0.3
231 0.26
232 0.23
233 0.26
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.13
242 0.13
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.17
250 0.17
251 0.13
252 0.12
253 0.14
254 0.2
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.23