Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5S4I6

Protein Details
Accession J5S4I6    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-162TSFTKRCSKKTASRPKREKRQTILPSGHydrophilic
194-215LAYGKRLKKEDNEKKRQEMDEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-154ASRPKREK
202-202K
206-209EKKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
Amino Acid Sequences MRCNDYDNSGSSSFSRVVRKSDAEENLLQHKEIGSCKLNGKRKAYTERGKVYVSCSFIEVSLSEIEIDIRRKIENAEQLRDITRNILRSKTCSLHEIVSSKNGVTSACNFEKVSPSSEVKDTGSDCSHAQVSDGSTSFTKRCSKKTASRPKREKRQTILPSGEIKKCAKCKDTWTIQWRSGPDHNRELCSPCGLAYGKRLKKEDNEKKRQEMDEKKRGGSSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.28
4 0.33
5 0.37
6 0.39
7 0.41
8 0.46
9 0.45
10 0.42
11 0.43
12 0.41
13 0.43
14 0.41
15 0.36
16 0.28
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.25
21 0.21
22 0.24
23 0.31
24 0.39
25 0.47
26 0.51
27 0.55
28 0.56
29 0.6
30 0.66
31 0.69
32 0.69
33 0.69
34 0.68
35 0.66
36 0.61
37 0.54
38 0.5
39 0.45
40 0.38
41 0.29
42 0.24
43 0.21
44 0.19
45 0.19
46 0.14
47 0.11
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.08
53 0.1
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.19
61 0.25
62 0.28
63 0.3
64 0.3
65 0.31
66 0.32
67 0.31
68 0.26
69 0.21
70 0.19
71 0.21
72 0.21
73 0.24
74 0.24
75 0.27
76 0.31
77 0.3
78 0.29
79 0.26
80 0.26
81 0.23
82 0.25
83 0.22
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.13
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.11
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.16
97 0.17
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.22
127 0.23
128 0.28
129 0.35
130 0.42
131 0.5
132 0.61
133 0.68
134 0.71
135 0.79
136 0.85
137 0.88
138 0.92
139 0.92
140 0.9
141 0.85
142 0.85
143 0.81
144 0.78
145 0.72
146 0.64
147 0.62
148 0.58
149 0.54
150 0.47
151 0.43
152 0.42
153 0.44
154 0.46
155 0.42
156 0.41
157 0.45
158 0.51
159 0.56
160 0.59
161 0.61
162 0.61
163 0.62
164 0.63
165 0.57
166 0.54
167 0.53
168 0.51
169 0.49
170 0.52
171 0.51
172 0.5
173 0.51
174 0.49
175 0.43
176 0.39
177 0.33
178 0.23
179 0.25
180 0.23
181 0.22
182 0.27
183 0.35
184 0.38
185 0.44
186 0.47
187 0.47
188 0.55
189 0.65
190 0.68
191 0.68
192 0.74
193 0.75
194 0.81
195 0.83
196 0.8
197 0.79
198 0.79
199 0.79
200 0.78
201 0.75
202 0.7