Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4TRZ4

Protein Details
Accession J4TRZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-167STDSKATKGRKQGSKNLKKTKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-167KATKGRKQGSKNLKKTKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSRKLKKTNLFNKDVSSLLYAYGDVPQPLQATVQCLDELVSGYLVDVCTNAFHTAQNSQRNKLRLEDFKFALRNDPVKLGRAEELIATNKLITEAKKQFNETDNQNSLKRFRAEDEEGDEVDEDEYEQQITDDDDHTVRRNNAKQSTDSKATKGRKQGSKNLKKTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.43
3 0.35
4 0.26
5 0.2
6 0.18
7 0.14
8 0.12
9 0.14
10 0.13
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.09
27 0.08
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.1
41 0.15
42 0.21
43 0.3
44 0.32
45 0.35
46 0.4
47 0.42
48 0.42
49 0.41
50 0.41
51 0.4
52 0.43
53 0.43
54 0.4
55 0.41
56 0.42
57 0.37
58 0.35
59 0.29
60 0.26
61 0.22
62 0.26
63 0.22
64 0.22
65 0.23
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.15
81 0.21
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.36
88 0.33
89 0.34
90 0.33
91 0.34
92 0.35
93 0.34
94 0.33
95 0.34
96 0.32
97 0.26
98 0.24
99 0.28
100 0.3
101 0.3
102 0.33
103 0.3
104 0.28
105 0.27
106 0.24
107 0.17
108 0.14
109 0.11
110 0.07
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.15
124 0.2
125 0.23
126 0.3
127 0.35
128 0.42
129 0.48
130 0.5
131 0.54
132 0.54
133 0.59
134 0.59
135 0.55
136 0.52
137 0.54
138 0.57
139 0.58
140 0.62
141 0.64
142 0.65
143 0.7
144 0.76
145 0.78
146 0.82
147 0.86