Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EBY2

Protein Details
Accession J6EBY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-272LKDVRLMILRKKQTKKKTKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-272RKKQTKKKTKS
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038896  RNF170  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd23142  RING-HC_CHR27-like  
Amino Acid Sequences MIRRLDNQSPEDENLRIKRTRVELVEHNDDEEETEVPRIQNGMIENHHENLETAIEIVGDRAPDNASEDEDLCLFRALEEGSGSDHPNATTADTNTNDRGSVQSNSPETGVGSATASTNSDEEPHTIEVLSQTADALSASLIPEEAAPLTKPEISSKEKTVDLTADAIDLDAEEQQVLEISDEDFQEDTKETTREYGAAKDYRCPICFDPPETALMTLCGHVFCCSCLFQMVNSSRTCRQFGHCALCRSKVYLKDVRLMILRKKQTKKKTKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.4
4 0.37
5 0.4
6 0.42
7 0.48
8 0.43
9 0.44
10 0.47
11 0.52
12 0.59
13 0.52
14 0.48
15 0.41
16 0.38
17 0.32
18 0.25
19 0.18
20 0.1
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.13
28 0.14
29 0.17
30 0.17
31 0.23
32 0.24
33 0.25
34 0.25
35 0.22
36 0.21
37 0.17
38 0.16
39 0.1
40 0.09
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.16
80 0.17
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.16
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.14
141 0.19
142 0.22
143 0.24
144 0.26
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.21
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.2
185 0.24
186 0.25
187 0.28
188 0.34
189 0.36
190 0.36
191 0.37
192 0.34
193 0.39
194 0.42
195 0.4
196 0.37
197 0.34
198 0.36
199 0.32
200 0.29
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.12
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.22
218 0.25
219 0.27
220 0.28
221 0.33
222 0.36
223 0.4
224 0.42
225 0.36
226 0.37
227 0.41
228 0.46
229 0.52
230 0.53
231 0.56
232 0.57
233 0.6
234 0.57
235 0.53
236 0.52
237 0.49
238 0.5
239 0.5
240 0.5
241 0.51
242 0.51
243 0.49
244 0.49
245 0.48
246 0.49
247 0.51
248 0.57
249 0.6
250 0.69
251 0.75
252 0.8