FuNGI

J5RMD3

Protein Details

Accession

J5RMD3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
131-153	VIAGRMRKAPRKKVQLRNITFRI	Hydrophilic
465-493	GSWTRDMRRKMKDALKHRKRKQSKNGVLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
127-143	DHKEVIAGRMRKAPRKK
472-488	RRKMKDALKHRKRKQSK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034138 NOP8_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12226 RRM_NOL8

Amino Acid Sequences

MSSVIQKRVFVGNIFHDADQCYSELLDRFGKFGDCQEAQFEKHDHFAFIDVKFNDEAAFNKLKKSFNNVKFKGNVLKVDEAKPSWETTWALQHTKDLEEDIVQSIKMKKKDWEHYKKMENVAKSWKDHKEVIAGRMRKAPRKKVQLRNITFRINVDGSLKVYKCYKTKLWGYERNKELNDLVYKFTNNFWKNGYDHIVDRLDYSHAAKTIRFKSGSKQLTISQNETSGKENADSDENMSEEEKEKNNVILSGLLKDFDFDKPVPLYDSDVEPISQVGGEEENAPEEENALEEENAPEEEEEDVELADVPEVDVSERENGILQEASEKKKELDEGQEEDHEFIPTFTGEPGQGTISNTETLRSLFNPSEVETVSQFKLIEDSDNDIDRTKGIDVGQQEEEASRPNRLDVVFPVTQATKDKDTKNFLFFPHLQSPFLIGQTQVSKVRASGKETILSNWDEEFWANRGSWTRDMRRKMKDALKHRKRKQSKNGVLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.34
3	0.3
4	0.3
5	0.29
6	0.25
7	0.21
8	0.15
9	0.12
10	0.15
11	0.15
12	0.17
13	0.22
14	0.21
15	0.22
16	0.22
17	0.24
18	0.22
19	0.24
20	0.29
21	0.24
22	0.24
23	0.3
24	0.31
25	0.31
26	0.35
27	0.33
28	0.27
29	0.32
30	0.32
31	0.27
32	0.24
33	0.27
34	0.27
35	0.25
36	0.31
37	0.25
38	0.27
39	0.26
40	0.25
41	0.21
42	0.18
43	0.19
44	0.17
45	0.25
46	0.23
47	0.28
48	0.33
49	0.37
50	0.38
51	0.46
52	0.51
53	0.53
54	0.64
55	0.61
56	0.63
57	0.62
58	0.64
59	0.63
60	0.57
61	0.52
62	0.46
63	0.5
64	0.46
65	0.47
66	0.47
67	0.38
68	0.37
69	0.33
70	0.31
71	0.24
72	0.24
73	0.22
74	0.2
75	0.28
76	0.29
77	0.3
78	0.28
79	0.31
80	0.3
81	0.3
82	0.28
83	0.21
84	0.17
85	0.16
86	0.17
87	0.15
88	0.14
89	0.12
90	0.15
91	0.2
92	0.25
93	0.28
94	0.3
95	0.34
96	0.43
97	0.54
98	0.62
99	0.66
100	0.69
101	0.74
102	0.79
103	0.78
104	0.78
105	0.72
106	0.63
107	0.57
108	0.59
109	0.55
110	0.51
111	0.53
112	0.49
113	0.48
114	0.48
115	0.45
116	0.44
117	0.43
118	0.46
119	0.47
120	0.44
121	0.42
122	0.47
123	0.5
124	0.49
125	0.55
126	0.58
127	0.59
128	0.68
129	0.76
130	0.79
131	0.85
132	0.87
133	0.85
134	0.83
135	0.79
136	0.71
137	0.62
138	0.52
139	0.46
140	0.36
141	0.3
142	0.23
143	0.19
144	0.17
145	0.22
146	0.21
147	0.18
148	0.21
149	0.25
150	0.26
151	0.3
152	0.31
153	0.34
154	0.4
155	0.48
156	0.54
157	0.6
158	0.63
159	0.67
160	0.68
161	0.66
162	0.59
163	0.52
164	0.44
165	0.38
166	0.36
167	0.29
168	0.26
169	0.22
170	0.22
171	0.21
172	0.23
173	0.27
174	0.24
175	0.24
176	0.24
177	0.25
178	0.26
179	0.28
180	0.29
181	0.22
182	0.21
183	0.24
184	0.23
185	0.19
186	0.19
187	0.17
188	0.14
189	0.13
190	0.14
191	0.11
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.2
196	0.23
197	0.26
198	0.27
199	0.26
200	0.3
201	0.39
202	0.4
203	0.35
204	0.33
205	0.33
206	0.39
207	0.41
208	0.38
209	0.29
210	0.29
211	0.29
212	0.28
213	0.26
214	0.19
215	0.17
216	0.15
217	0.15
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.11
236	0.11
237	0.1
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.08
245	0.11
246	0.09
247	0.11
248	0.11
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.14
253	0.11
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.09
259	0.09
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.13
310	0.16
311	0.19
312	0.2
313	0.21
314	0.2
315	0.22
316	0.24
317	0.2
318	0.24
319	0.26
320	0.28
321	0.29
322	0.31
323	0.29
324	0.29
325	0.26
326	0.19
327	0.15
328	0.11
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.16
350	0.14
351	0.16
352	0.16
353	0.17
354	0.19
355	0.17
356	0.18
357	0.15
358	0.18
359	0.17
360	0.17
361	0.16
362	0.13
363	0.15
364	0.14
365	0.15
366	0.13
367	0.17
368	0.18
369	0.2
370	0.2
371	0.19
372	0.19
373	0.16
374	0.17
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.14
379	0.15
380	0.2
381	0.2
382	0.19
383	0.19
384	0.16
385	0.16
386	0.19
387	0.19
388	0.17
389	0.16
390	0.17
391	0.2
392	0.2
393	0.21
394	0.19
395	0.25
396	0.23
397	0.22
398	0.24
399	0.22
400	0.23
401	0.24
402	0.26
403	0.26
404	0.32
405	0.37
406	0.42
407	0.49
408	0.52
409	0.55
410	0.54
411	0.48
412	0.5
413	0.47
414	0.47
415	0.48
416	0.45
417	0.4
418	0.37
419	0.39
420	0.33
421	0.32
422	0.25
423	0.16
424	0.18
425	0.2
426	0.24
427	0.24
428	0.23
429	0.23
430	0.24
431	0.33
432	0.33
433	0.35
434	0.38
435	0.37
436	0.42
437	0.42
438	0.43
439	0.38
440	0.35
441	0.32
442	0.25
443	0.22
444	0.18
445	0.17
446	0.18
447	0.16
448	0.17
449	0.16
450	0.18
451	0.22
452	0.27
453	0.34
454	0.4
455	0.48
456	0.55
457	0.64
458	0.71
459	0.74
460	0.76
461	0.78
462	0.77
463	0.77
464	0.79
465	0.81
466	0.83
467	0.85
468	0.88
469	0.9
470	0.92
471	0.93
472	0.93
473	0.93

J5RMD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer